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那么,基于这种情况,开发人开发了Scanpy(Single-Cell Analysis in Python), 使用Python来实现有效地处理超过一百万个细胞的数据集SCANPY、Monocle2和Seurat3(CCA+MNN),重点分析了这些方法的主要原理、优点及应用等,并对几种方法进行了综合性的对比分析Scanorama是Scanpy中使用的另一种流行且性能良好的方法。最近,Harmony越来越受欢迎,并迅速成为单细胞数据集最常用的集成(来源:论文) 在这里,研究人员开发了一种快速和用户友好的空间域识别方法 STAGATE,它可以通过将 Scanpy 包的「ImageTitle
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