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可变剪切最新视觉报道_可变剪切名词解释(2024年12月全程跟踪)

内容来源：麦吉窗影视所属栏目：热点更新日期：2024-12-02

可变剪切

转录组测序数据分析的三步走策略转录组测序（RNA-seq）是现代生物学研究中的一项关键技术，它能够全面揭示某一生理条件下细胞内所有转录产物的信息。然而，由于测序数据量庞大，如何从海量数据中筛选出关键基因成为了一项挑战。𐟌 转录组数据分析的核心在于不断缩小关键基因的范围。这通常通过以下三种方法来实现：差异表达分析、聚类分析和加权基因共表达网络分析（WGCNA）。𐟔 差异表达分析：通过对count矩阵进行差异表达分析，根据Fold change和Pvalue筛选出在处理组与对照组之间差异表达的基因。这种方法可以将基因数目从几万条缩小到1000-2500条。𐟓‰ 聚类分析：聚类分析可以帮助我们将基因按照表达模式进行分类，从而找到关键基因。这种方法通常用于那些没有明显差异表达但在特定条件下发挥重要作用的基因。𐟓Š WGCNA：WGCNA是一种基于加权基因共表达网络的分析方法。它要求样本数目至少要有15个，因此在进行WGCNA分析时，需要多设置处理或生物学重复数。这种方法能够找到与表型高度相关的关键基因。𐟌 在缩小关键基因范围后，还需要进行富集分析来进一步确定这些基因的功能。富集分析可以通过聚类分析的cluster或WGCNA分析的module来进行，从而找到与特定生物学过程或表型相关的关键基因。𐟔 最后，揭示这些关键基因在处理组和对照组之间变化的分析机制也是必不可少的。这包括单核苷酸的变异（SNP）、碱基的插入和缺失（InDel）、染色体结构的变异（SV）以及DNA在启动子区域的甲基化等。此外，RNA层面的分析机制还包括由信号调控引起的差异表达、可变剪切（AV）以及RNA的修饰等。𐟔슊通过这些步骤，我们可以逐步缩小关键基因的范围，并揭示它们在处理组和对照组之间变化的分析机制，从而为生物学研究提供有力的支持。𐟌𑀀

深入了解：Northern杂交揭秘 Northern杂交（Northern blot），这项由斯坦福大学的James Alwine、David Kemp和George Stark于1977年共同发明的技术，是用于研究基因表达水平的强大工具。𐟔슊𐟌𑠥ꌦ�ꤦ您爯𜚊RNA提取：从细胞或组织中提取总RNA，或通过寡聚（dT）纯化柱分离纯化得到mRNA。电泳分离：RNA样本通过电泳依据分子量大小进行分离。常用的电泳胶是含有甲醛的琼脂糖凝胶，甲醛有助于减少RNA的二级结构。对于小分子的RNA或microRNA，聚丙烯酰胺变性胶电泳是更佳选择。转膜：凝胶上的RNA分子被转移到膜上。膜通常带有正电荷，与带负电荷的核酸分子结合得很好。转膜缓冲液中含有甲酰胺，能降低RNA样本与探针的退火温度，减少高温对RNA的降解。固定：RNA分子转移到膜上后，需经过烘烤或紫外交联等方法加以固定。杂交：使用与检测目的基因序列互补配对的被标记探针与RNA探针杂交。探针可以是DNA、RNA或其他寡聚核苷酸，长度需大于25bp。体外合成的RNA探针可采用更高的退火温度以减少背景噪音。常用的标记物有P或地高辛等。信号检测：杂交过后，可采用X胶片显色等方法来检测信号。 𐟌🠎orthern杂交的应用：用于检测不同组织、器官以及生物体不同发育阶段或胁迫、病理环境下特定基因的表达情况。检测目的基因是否具有可变剪切产物或者重复序列。 𐟌Ÿ 技术特点：与其他基因表达分析方法相比，Northern blot的灵敏度不如定量PCR，但特异性较高，可有效减少实验结果的假阳性。其灵敏度通常优于基因芯片实验，不过基因芯片可在一次实验中同时反映出几千个基因表达量的变化。 ⚠️ 注意事项：在进行Northern blot实验时，需注意RNA容易降解，因此所有实验用品都需要经过除去RNA酶的处理，如高温烘烤、DEPC处理等。同时，实验中用到的甲醛、EB、DEPC、紫外灯等对人体有一定伤害，操作时应注意防护。

𐟌𘦏�˜撒金碧桃的神奇花色𐟌𚊤𝠦œ‰没有听说过这种神奇的现象？一棵桃树上竟然能开出四种不同颜色的花！这到底是怎么回事呢？其实，这种桃树叫做撒金碧桃，也叫五色碧桃，它的花期一般在3到4月，尤其在华东地区比较常见。与普通桃树最大的不同之处在于，它能在一棵树上开出白色、红色等多种颜色的花，甚至一朵花上就有不同的颜色，真是美不胜收！那么，这种神奇的花色是怎么产生的呢？其实，中国人很早就发现了这种现象。比如，在一朵牡丹的花冠上能开出两种不同颜色的花瓣，这种牡丹被称为二乔牡丹。还有桃花和梅花，有一种很特别的现象叫做跳枝，同一株桃花或梅花上有可能出现两种不同颜色的花朵，而且这种颜色的变化完全没有规律。可能今年在一根枝条上出现半红半白的花朵，但明年又出现在另一根枝条上。更神奇的是，在一朵花上甚至一根花瓣上都有可能出现不同的颜色，这被称为撒金。撒金碧桃正是因此得名。那么，这种撒金现象背后的科学原理是什么呢？其实有两种主要情况：一种是因为环境和成分对色素产生了影响。比如双色茉莉就是因为开花时间有先后，花色素随着时间的推移和光照、温度条件的变化会不断分解，于是就呈现出不同的花色。另一种情况是基因对花的颜色表达产生了影响。一些植物在花形成的早期，比如当花朵只有两个细胞的时候，其中一个基因发生了突变，产生了不同的颜色。随着细胞的分裂，就出现了两瓣花朵颜色不同的情况。撒金碧桃正是类似的情况，白色花瓣中的基因发生了可变剪切的变异，抑制了花色素的形成，导致白色花朵的形成；而红色花朵的色素正常生成，于是就形成了一棵树上有多种颜色花的美丽景象。是不是觉得大自然真是充满了奇迹和未知的奥秘呢？𐟌🰟Œ𘀀

如何快速入门生物信息学？小白必看！嘿，小白们！如果你对生物信息学感兴趣，但又不知道从哪里开始，那你来对地方了！作为一个过来人，我深知初入这个领域的迷茫和困惑。今天，我就来分享一些实用的小技巧，帮你快速入门生物信息学，甚至有可能发表SCI文章哦！一、生信分析的基本框架 𐟓Š 生物信息学其实就是一个对测序数据或者公共数据库的数据进行分析挖掘的过程。通过这些数据，你可以找到和疾病相关的基因、蛋白或者信号通路，为课题找找方向，甚至发表SCI文章。数据库和软件学习 𐟒𛊊生信分析主要分为两部分：数据库和软件学习。数据库方面，你可以学习如何使用现有的生信可视化网站，进行预测检索或者一站式出图。常见的数据库有GEPIA、Cbioportal、Oncomine、KM-plotter和Timer等。软件和编程方面，主要学习Cytoscape和GSEA这两个软件。编程语言方面，R语言是个不错的选择，特别适合医学生。你需要掌握基本的R语言语法规则、可视化作图、统计分析、数据清洗以及解决具体问题的能力。从易到难，逐步复现分析 𐟧슊第二步是从易到难，对生信文章进行复现分析。不求完整复现，但求能一步步按正确的方法操作下来。在这个过程中，你肯定会遇到很多bug或者不理解的地方，这时候就要发挥网络平台和社群的力量了。迁移应用分析 𐟌 第四步是根据最新的研究热点，进行新的迁移应用分析。比如最近的新冠疫情，不同场景的再应用，也催生了不少相关的生信文章。还有多组学分析、泛癌分析、m6A甲基化分析、可变剪切、SNP分析等等。个人经验分享 𐟓š 我自己已经发表了15篇SCI文章，累计影响因子90+，参与过三个国自然应用项目。曾经在美国斯坦福大学实验室工作过三年。最近空闲时间多，想带几个徒弟，教他们生信分析。全程手把手教学，小白也能学会！让你们零基础就能上手发SCI！课程内容 𐟓– 第1节：文献及方案讲解第2节：R语言安装、TCGA/GEO数据下载与处理第3节：差异分析、Cox+Lasso的风险模型构建与验证第4节：独立预后、临床特征相关性及免疫微环境分析第5节：药物敏感性、富集分析第6节：WGCNA分析、HPA数据库分析第7节：单基因免疫微环境、GSEA分析第8节：框架讲解总结 𐟓 生物信息学其实并没有你想象的那么难，只要你有兴趣和毅力，完全可以快速入门并发表自己的研究成果。希望这些小技巧能帮到你，祝你早日成为生物信息学的大佬！如果有任何问题或者需要进一步的指导，随时联系我哦！

第二期课程内容： 1.宏基因组研究专题，包括宏基因组简介、建库测序、分析环境搭建、物种分类原理、centrifuge安装、数据库、三代测序宏基因组物种分类鉴定等。 2.基因表达调控研究专题，涉及RNAseq简介、原理、建库方法、不同测序平台比较、定量方法、分析环境搭建、数据质控过滤、比对、计数、可变剪切检测、基因融合检测等。 3.基因组研究专题，包括基因组拼接原理、kmer估计基因组大小、二代测序拼接算法、fasta格式文件介绍与处理、quast评估、busco评估等。 4.R语言专题，包括R语言数据分析、基因表达调控、GEO数据库简介、关于基因的概念等。 5.课程还包括了单细胞数据分析、空间转录组等内容。

BS Code vs EC，必看！ 1. 𐟓– 在BS 8110中，负载的概念已经被EC 2中的操作所取代。同样，BS 8110中的死载荷载和活载分别对应EC 2中的永久动作和可变动作。BS 8110中的弯矩和剪力则分别与EC 2的内部矩和内应力相对应。 𐟓š BS 8110详细阐述了梁、板、柱子、底座等的设计规范。而EC 2则根据结构作用（如弯曲、剪切、偏转、扭转等）来划分材料，这种方法适用于任何结构元素。 𐟔 对于正在学习的工程师们，推荐大家参考不同的BS Code和Eurocode参考书，以及各种钢铁和RC设计的Spreadsheets。这些资源可以帮助你更好地理解和应用这些设计规范。

基因中的内含子是什么？内含子（Intron）是基因中的非编码序列，它们存在于真核生物的基因中，在基因转录成前体mRNA后会被剪切掉，不会出现在最终成熟的mRNA或蛋白质中。以下是关于内含子的一些关键点：定义 - 非编码序列：内含子是基因内部的一段DNA序列，它不编码蛋白质的一部分。 - 转录但不翻译：在基因转录过程中，内含子与外显子（编码序列）一起被转录成前体mRNA，但在mRNA成熟过程中，内含子会被特定的酶复合物（如剪接体）识别并去除。功能 - 基因调控：虽然内含子本身不直接参与蛋白质合成，但它们可能含有对基因表达调控重要的元件，例如增强子、沉默子等。 - 可变剪接：通过不同的剪接模式，同一基因可以产生多种不同版本的mRNA，从而导致不同功能的蛋白质变体。这种现象称为可变剪接或选择性剪接。 - 进化角色：内含子的存在为基因提供了更多的灵活性和多样性，有助于物种适应环境变化和进化过程。剪接过程 - 识别与切除：在细胞核内，剪接体（spliceosome）会识别出内含子边界，并将这些非编码区域从初级转录产物中切除。 - 连接外显子：剪接完成后，相邻的外显子被连接起来形成连续的编码序列，即成熟的mRNA，然后这个mRNA可以被运送到细胞质中进行翻译。例子 - 在人类基因组中，许多基因都包含多个内含子。例如，一个典型的基因可能由几个外显子和几个内含子组成。每个外显子代表一段编码氨基酸的序列，而内含子则位于外显子之间。 - 有些基因的内含子非常长，甚至比外显子还长得多。这增加了基因组的复杂性和调控的可能性。重要性 - 生物学研究：了解内含子的功能对于揭示基因表达调控机制非常重要。科学家们通过对内含子的研究来探索疾病的发生机制以及开发新的治疗方法。 - 遗传病：内含子中的突变有时会影响正常的剪接过程，导致错误的mRNA生成，进而引发遗传性疾病。总之，内含子是基因结构的重要组成部分，尽管它们不直接编码蛋白质，但在基因表达调控和增加生物体遗传多样性方面发挥着重要作用。

验房必看：建筑墙体的多种分类珠海的业主们在收房时，了解建筑墙体的分类可是相当重要的哦！墙体的分类方式有很多种，下面就给大家详细介绍一下。按材料分类 𐟏—️ 砖墙：用砖块砌筑的墙体，经典而坚固。混凝土墙：用混凝土浇筑的墙体，可以是预制的也可以是现场浇筑的，非常耐用。石墙：用天然石材砌筑的墙体，具有独特的质感和美感。木墙：用木材或木板材建造的墙体，给人一种温暖的感觉。金属墙：用钢材、铝材等金属材料建造的墙体，现代感十足。砌块墙：用混凝土砌块或轻质砌块砌筑的墙体，轻便且易于施工。玻璃墙：用玻璃材料建造的墙体，常见于现代建筑中，透光性好。按结构功能分类 𐟔犦‰🩇墙：承担建筑物垂直荷载的墙体，非常重要。非承重墙：不承担主要垂直荷载，主要用于分隔空间、隔音、隔热等。剪力墙：专门设计来抵抗剪切力的墙体，用于高层建筑的抗震设计。框架墙：与建筑框架结构相结合的墙体，可以是承重或非承重的。按位置分类 𐟓 外墙：建筑物的外部墙体，具有保温、隔热、防水等功能。内墙：建筑物内部的墙体，主要用于分隔室内空间。隔断墙：轻质、可移动的墙体，用于临时或可变空间的分隔。按功能分类 𐟛᯸ 防火墙：具有特定耐火性能的墙体，用于阻止火灾蔓延。隔音墙：专门设计用于减少声音传播的墙体。隔热墙：具有良好隔热性能的墙体，用于节能建筑。防水墙：用于防止水分渗透的墙体，常见于地下室等。按施工方法分类 𐟏—️ 现场砌筑墙：在建筑现场直接砌筑的墙体。预制墙：在工厂预制完成后运输到现场安装的墙体。这些分类方法并不是相互独立的，一个墙体可以根据不同的标准属于多个类别。例如，一个墙体可能同时是混凝土剪力墙、外墙和承重墙。希望这些信息能帮助大家更好地了解建筑墙体的分类，为验房做好准备！

电动理发剪刀 𐟒ˆ✨最近在家理发的时候，我发现了一个超级好用的神器——电动理发剪刀！这款神器不仅功能强大，还非常方便操作。今天就来和大家分享一下我的使用体验吧！ 𐟌Ÿ多功能设计的优点电动理发剪刀真的是个全能选手！除了基本的理发功能，它还能剃须、剪鼻毛，甚至还能用来清理陶瓷刀头。剃完头发后，陶瓷刀头很容易残留发丝，有了这个多功能设计，清理起来非常方便。家里有了它，连理发店都省得去啦！ 𐟔秔𕥊觐†发剪刀的核心特点 𐟔礸€键操作：电动理发剪刀的一键操作设计简直太贴心了，只需轻轻一按就能启动，完全不用担心误操作的问题。 𐟛᯸安全设计：刀头采用了锋利陶瓷材质，温和安全，不易伤肤。特别是它的R型圆角设计，贴合皮肤，非常舒适。 𐟔꩔‹利陶瓷刀头：刀头的锋利程度令人惊叹，剪起头发来非常顺滑，完全不会卡住。而且陶瓷材质保持锋利的持久度也很高。 𐟔„可变理发长度：电动理发剪刀提供了六档固定理发长度键锁定，从3毫米到18毫米随意调节，真的是一推就能搞定。 ⚙️高频电机：高频电机强劲驱动，不仅使用顺畅，而且非常耐用。大扭矩设计让剪切更加有力，头发一剃就干净利落。 𐟔‹续航持久：充电一次能用90分钟，这个续航能力真是让人惊喜。Type-c快速充电设计也超级方便，充电速度杠杠的！ 𐟏†不同品牌的电动理发剪刀 𐟏†市面上有很多品牌的电动理发剪刀，每个品牌都有自己的独特特点。例如，德国品质的理发器采用了高品质材料制造，不仅锋利耐用，还具备快速充电和大容量电池。一些高端型号甚至配备了智能数显技术，让你随时掌控理发长度和电量状态。 𐟔‹有些品牌的电动理发剪刀设计了无绳设计，非常方便操作。陶瓷刀片配合LED显示屏，不仅切割锋利，还能提供精准的修剪效果。另外，有些品牌的刀头设计特别易于安装和拆卸，方便用户更换不同长度的刀片。 𐟔稿˜有一些品牌的电动理发剪刀特别注重安全性设计，刀头角度非常贴合皮肤，避免了误操作和伤害头皮的风险。而且全身可水洗的设计也让清洁变得非常简单。有了这些不同品牌的电动理发剪刀选择，真的是可以满足各种需求啦！无论是家庭护理还是专业理发店使用，都能找到适合自己的那一款。最近真的被这个电动理发剪刀圈粉了！不仅操作简单，功能多样，还能在家轻松搞定各种发型。大家有需要的也可以试试看哦！如果你有任何问题或者想分享你的使用体验，欢迎在评论区留言哦！𐟒쀀

𐟧Š冰沙品牌包装视觉设计𐟎芰Ÿ’ᦎ⧴⥆𐦲™品牌包装的视觉魅力！全模拟的设计理念，巧妙传达冰冻冰沙的全天然成分。𐟌🥉ꥭ和 Olivetti Lettera 32 型打字机是唯一工具，Bimmi 徽标由字体书写而成，每个字母由数百个更小字母构成，可扩展可变，模拟字母越多，标识越大。𐟓–旁侧剪切插图描绘配料，即使在冰柜深处也能快速感知 Bimmi 的天然与健康。𐟒š

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