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Stata实战!轻松搞定分析 数据挖掘: 从世界银行等权威机构获取数据 利用各国和地区的统计局资源 Wind金融终端、中债资信网等专业平台 联合国开发计划署、全球环境设施等重要报告 基础统计分析: 描述统计和相关性分析的核心任务 单位根检验、稳定性检验 群体分析、聚类分析等 多元模型回归分析: 模型选择:白色噪音检验、Q检验、Box-Pierce检验 常规模型:泊松回归模型、随机效应模型,双向固定效应模型 检验方法:直接和间接效应,调节效应,有调节的间接效应 高级模型:双重选择模型、贝叶斯模型、零膨胀模型、最小绝对收缩和选择算子(LASSO)模型 显著性调整方法: 通过更换和选择控制变量进行细化 进行范围约束处理 采用样本筛选、算法优化等方式
Lasso回归:如何从系数图中读出秘密? Lasso回归的系数图是一个非常有用的工具,可以帮助我们理解模型中每个特征的重要性。在这个图中,横轴表示正则化参数对数值(Log(Lambda)),而纵轴则展示了每个特征的系数值。 随着增大(即正则化强度的增加),模型的复杂度会降低。这意味着,更强的正则化会导致模型对数据的拟合程度降低,但同时也会减少过拟合的风险。 曲线图中的每条曲线代表一个特征,曲线的变化展示了不同该特征系数的变化情况。曲线变为零表示该特征被LASSO回归剔除,也就是说,这个特征对响应变量的影响被认为是不显著的。 ᠩ过观察这些曲线,我们可以更好地理解哪些特征对模型最为重要,哪些可以安全地忽略。这在处理高维数据时尤其有用,可以帮助我们简化模型并提高其泛化能力。
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R语言必备代码清单,轻松上手数据分析 R语言必备代码清单,助你轻松上手数据分析! 1️⃣ WGCNA筛选表型相关基因:揭示基因与表型之间的关系。 2️⃣ GEO多疾病差异分析:比较不同疾病间的基因表达差异。 3️⃣ GEO数据库PCA散点图:可视化基因表达数据。 4️⃣ ROC诊断曲线:评估模型的诊断性能。 5️⃣ GEO与TCGA共同差异基因:发现两种数据库中的共同差异基因。 6️⃣ 多GEO数据库合并分析:整合多个GEO数据库的数据。 7️⃣ GEO数据库处理分析:对GEO数据库进行预处理和分析。 8️⃣ 预后模型多指标ROC:评估预后模型的多个指标。 9️⃣ 独立预后分析:对单个患者的预后进行预测。 oncoPredict包基因表达与药物敏感性:预测药物敏感性。 1️⃣1️⃣ 基因与药敏相关性:探索基因与药物敏感性的关系。 1️⃣2️⃣ PFS:评估患者的无进展生存期。 1️⃣3️⃣ 多因素Cox模型:构建多因素Cox回归模型。 1️⃣4️⃣ Lasso回归模型:进行Lasso回归分析。 1️⃣5️⃣ 线性回归及非线性回归:探索数据的线性和非线性关系。 1️⃣6️⃣ 空间分析:对数据进行空间可视化分析。 1️⃣7️⃣ TCGA临床数据:提取TCGA数据库中的临床数据。 1️⃣8️⃣ ComBat不同数据:使用ComBat方法校正不同数据集的批次效应。 1️⃣9️⃣ ComBat:进行ComBat分析,去除批次效应。 2️⃣0️⃣ Wilcox差异分析:使用Wilcoxon秩和检验进行差异分析。 2️⃣1️⃣ 模型循环:构建循环模型,优化分析效率。 2️⃣2️⃣ 构建Lasso回归预后模型:利用Lasso回归构建预后模型。 2️⃣3️⃣ 临床相关性筛选:筛选与临床指标相关的基因。 2️⃣4️⃣ 共表达分析:探索基因间的共表达关系。 2️⃣5️⃣ 临床相关性分析:分析基因与临床指标的相关性。 2️⃣6️⃣ 多GEO数据去批次:去除多个GEO数据集的批次效应。 2️⃣7️⃣ 三种方法提取TCGA临床数据:使用三种方法提取TCGA临床数据。 2️⃣8️⃣ WGCNA筛选Hub基因:利用WGCNA方法筛选Hub基因。 2️⃣9️⃣ 预后相关基因筛选:筛选与预后相关的基因。 3️⃣0️⃣ 机器学习XGBoost:使用XGBoost进行机器学习建模。 3️⃣1️⃣ 机器学习GBM:利用GBM进行机器学习建模。 3️⃣2️⃣ 机器学习决策树:构建决策树模型,进行分类和预测。 3️⃣3️⃣ ROC分析:评估模型的ROC曲线性能。 3️⃣4️⃣ 机器学习模型ROC分析:对机器学习模型进行ROC曲线分析。 3️⃣5️⃣ 机器学习建模:构建机器学习模型,进行预测和分类。 3️⃣6️⃣ 随机森林特征选择:利用随机森林方法选择重要特征。 3️⃣7️⃣ 生存分析:对数据进行生存分析,评估患者的生存期。 3️⃣8️⃣ SVM特征选择:使用SVM方法选择重要特征。 3️⃣9️⃣ 机器学习-lasso筛选基因:利用Lasso回归筛选基因。 4️⃣0️⃣ 铜死亡相关基因筛选:探索铜死亡相关基因的筛选方法。 4️⃣1️⃣ 免疫治疗分析:评估免疫治疗的效果和机制。 4️⃣2️⃣ 肿瘤突变负荷分析:研究肿瘤突变负荷与患者预后的关系。 4️⃣3️⃣ 免疫浸润生存:探索免疫细胞浸润与患者生存期的关系。 4️⃣4️⃣ 差异分析:比较不同条件下的基因表达差异。 4️⃣5️⃣ 多组差异分析:对多个组别进行差异分析,找出共同差异基因。 4️⃣6️⃣ 免疫检查点相关性:研究免疫检查点与患者预后的关系。 4️⃣7️⃣ 三包差异交集:找出三个数据集的共同差异基因。 4️⃣8️⃣ 免疫细胞相关性分析:探索免疫细胞间的相关性。 4️⃣9️⃣ DESeq差异分析:使用DESeq方法进行差异分析。 5️⃣0️⃣ edgeR:利用edgeR方法进行差异分析。 5️⃣1️⃣ 基因表达与免疫浸润关系:研究基因表达与免疫浸润的关系。 5️⃣2️⃣ 免疫差异:探索免疫差异与患者预后的关系。
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痛风石预测模型,一文建! 今天我们来深入探讨一篇非常专业的论文——《Establishment and Validation of Predictive Model of Tophus in Gout Patients》。这篇文章的核心是建立和验证痛风患者痛风石的预测模型。研究人员通过收集大量痛风患者的临床数据,包括年龄、性别、病程、血尿酸水平等因素,运用统计学方法进行分析。他们发现,某些因素与痛风石的形成密切相关。 那么,这个预测模型是如何建立的呢?首先,研究人员确定了可能影响痛风石形成的因素,然后通过回归分析等方法建立了预测模型。这个模型可以根据患者的临床数据,预测其发生痛风石的风险。为了验证这个模型的准确性,研究人员又进行了一系列的验证实验。他们将模型应用于新的患者群体,发现模型的预测结果与实际情况非常吻合,表明这个预测模型具有较高的准确性和可靠性。 以下是分析的具体步骤: 筛选特征因素:研究人员运用了LASSO回归与逻辑回归的方法,从众多因素中精准地找出与痛风患者痛风石形成相关的关键特征。 数据划分:将痛风患者按照7:3的比例随机分为训练组和测试组,确保在后续的分析中有足够的数据用于模型的训练和验证。 分类多模型综合分析:对多种机器学习模型进行对比,以找出最适合预测痛风石的模型。通过不同模型的性能对比,可以充分了解各个模型的优势和不足。 训练、验证和测试:使用最优模型对训练集进行10次交叉验证,确保模型的稳定性和可靠性。同时,与测试集进行评估,以验证模型在新数据上的表现。 Shap解释:为了增强模型的可解释性,绘制了对模型重要性和贡献度的Shap解释。通过计算各特征对预测结果的贡献,能够更好地解释模型的结果,让人们更加清楚地了解模型是如何做出预测的。 对这个研究感兴趣想要深入学习的同学们,可以下载原文进行仔细研读哦!当前,临床预测模型相当热门,对于科研基础较为薄弱的医生或者医学生来说是非常合适的学习方向。它无需进行实验,也无需自行收集大量数据,通过挖掘公共数据库,就能够建立属于自己的预测模型。
斯坦福机器学习全套资料:从基础到实践 数学和统计基础: 线性代数:向量、矩阵、线性变换 概率与统计:概率分布、期望、方差、最大似然估计 𐦍处理和特征工程: 数据清洗、缺失值处理、异常值检测 特征选择、特征变换、特征生成 监督学习: 回归:线性回归、岭回归、Lasso回归 分类:逻辑回归、决策树、支持向量机、集成方法 无监督学习: 聚类:K均值聚类、层次聚类、DBSCAN 降维:主成分分析(PCA)、流形学习 验证集、测试集的划分 模型性能度量:精确度、召回率、F1分数、过拟合和欠拟合问题 深度学习: 神经网络基础:感知器、前馈神经网络 深度神经网络:卷积神经网络、循环神经网络、Transformer 深度学习框架:TensorFlow、PyTorch 强化学习: 强化学习的基本概念:智能体、环境、奖励 强化学习算法:Q-learning、Deep Q Network(DQN)、策略梯度 实践项目和案例分析: 使用真实数据集进行模型训练和评估 解决实际问题的案例研究,如图像识别、自然语言处理、推荐系统 部署和应用: 将训练好的模型部署到生产环境 模型的监控和更新
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