acmg最新视觉报道_acmg变异致病等级为3类(2024年12月全程跟踪)
4种常见基因型及其特点详解 基因型主要分为以下几种,你可能已经见过一些: 1⃣️ 纯合(hom) :体内有许多不影响功能的纯合突变。如果ACMG指南评级具有风险,那么这种纯合突变就是⚠️。简单来说,纯合突变就是两条染色体上的同一个基因都出问题了,可能无法正常工作,或者生成的蛋白质会影响正常功能。 ⷊ‼️例如,MTHFR纯合突变是一种常见的代谢基因突变,我看到有10个人的报告出现过。具体内容可以参考我的置顶第2篇笔记。 ⷊ还有gjb2的109位点纯合,最新指南将其纳入风险位点范畴。109位点纯合有近40%的外显率,我遇到两个109位点纯合但听力正常的例子;其他杂合突变大概在70岁左右逐渐出现听力异常。 2⃣️ 杂合(het) :常见的有AR杂合、AD杂合、XL杂合、XLR杂合等。大部分Y染色体在X上没有对应的等位基因,通常比较少见Y杂合。 ⷊ✔️染色体微缺失、微重复等大部分是杂合变异,比如Xp乘以1表示X染色体某段缺失了,拷贝数只有1,也就是杂合缺失变异,通常是女性(特纳综合征则为0,嵌合体看比例)。 ⷊ✔️如果X片段缺失变异是X乘以0,意味着拷贝数没有,大概为男性。 ⷊ‼️线粒体遗传有时可能看到这个词语:均质遗传,或者MI(线粒体遗传)。不少听力方面的线粒体遗传突变需要注意抗生素的使用情况,因为以往有很多这方面影响听力的案例。 3⃣️ 半合(hemi) :由于男性只有1条X染色体,Y染色体若没有对应的等位基因就会呈现半合基因型。出现XLR遗传方式的半合需要注意一下,比如遗传母亲的变异来源,评级意义不明,如果有需要可以验证家族中其他男性是否携带该变异。评级有⚠️的,定期观察甚至及时干预。 ⷊ❗️举个例子,IDS的半合突变,VUS XLR,VUS担心风险可以验证家族中男性的携带情况。因为IDS表型几乎在出生后2岁开始出现,我也遇到两个例子。 4⃣️ 复合杂合 :复合杂合出现在同一个基因的不同变异位点。详细内容可以看之前的笔记《复合杂合判断篇》。 希望这些信息对你有帮助!
求助!单基因检测发现双方都携带突变 我和我的丈夫都进行了单基因检测,结果发现我们双方都携带了不同的突变。我的基因检测显示SLC26A4基因有一个杂合突变:c.919-2A>G,导致氨基酸发生剪接突变(p.2)。而我的丈夫则是在GJB2基因上发现了一个杂合突变:c.109G>A,导致第37号氨基酸由缬氨酸变为异亮氨酸(p.Val71c)。 根据ACMG指南,这两个变异都被初步判定为致病性变异。对于SLC26A4基因的突变,它是一个零效变异,预测会破坏读码框,可能导致基因功能丧失。而对于GJB2基因的突变,它是一个错义突变,可能会影响蛋白质的功能。 风险评估显示,这些变异可能会导致我们各自的孩子有更高的疾病风险。根据情况,我们需要及时就医治疗,并关注配偶的变异位点携带和生育风险。 参考文献: [1] Coucke, P., et al. (2018). Pendred syndrome-associated mutations in SLC26A4. Hum. Mutat., 39(5), 704-713. [2] Najita, M., et al. (2007). GJB2 gene mutations in non-syndromic deafness. Am. J. Hum. Genet., 80(3), 432-441. 我们正在等待进一步的详细报告对比,以确定这些突变是否位于同一基因位点。在这段时间里,我们非常焦虑,希望能得到更多专业人士的建议和帮助。
基因报告看不懂?一文搞定所有术语!슥 就像一本神秘的天书,每个人都有自己独特的密码。想要解开这本天书的秘密,首先得搞清楚一些关键术语: 致病性等级 P:Pathogenic(致病),☆☆☆ LP:Likely Pathogenic(很可能致病),☆☆ VUS:Uncertain significance(显著性不确定),☆ LB:Likely benign(很可能无害),☆ B:Benign(无害),通常不用特别关注 遗传模式 AD:常染色体显性遗传(理论上杂合可能患病) AR:常染色体隐性遗传(理论上杂合不患病) XL:X连锁遗传(与性别有关),代表XLDX连锁显性遗传(理论上有突变即可能患病) XLR:X连锁隐性遗传(理论上女性杂合不会患病) DD/DR:双基因显性遗传/双基因隐性遗传 基因型 WT:野生型(正常型,与参考基因序列一致) Het:杂合(等位基因中,1个正常,1个变异) Hom:纯合(等位基因中,2个都变异) Hemi:半合(一个基因变异,没有等位基因) 复合杂合:(同一个基因上存在两个不同位置的变异,这两个变异分别位于2条染色体,即分别遗传自父母) 其他名词 HGVS:变异描述,包含变异位置、碱基变化等 MAF:人群频率 Revel:功能学预测软件,>0.644(有害/可能有害),<0.290(良性/可能良性) ACMG:美国医学遗传学与基因组学学会 ClinVar:美国国家生物技术信息中心临床疾病变异数据库 OnkoKB:纪念斯隆凯特琳Ca中心(MSK)维护的全面精准肿瘤学知识库 了解了这些术语,解读基因报告就不再是难事啦!
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