提质粒最新娱乐体验_质粒图谱大全详解(2024年12月深度解析)
高效提取质粒的详细步骤指南슨𒒦取的原理: 基因组DNA在碱性条件下变性后无法恢复原有构象,而质粒DNA则能在加酸恢复中性后恢复构象。我们利用这一差异来提取质粒。 1️⃣ P1菌体裂解 P1菌体通常保存在-4℃冰箱中。使用含有氢氧化钠(NaOH)和十二烷基硫酸钠(SDS)的混合溶液处理细菌,导致细胞壁和细胞膜破裂,释放出质粒DNA和宿主细胞的基因组DNA。其中还含有RNA酶,可以有效去除RNA。 2️⃣ P2DNA变性 在碱性条件下(pH 12.0-12.5),质粒DNA和宿主细胞的染色体DNA都会变性,但质粒DNA由于其较小的分子量和超螺旋结构,变性后仍能保持紧密的缠绕状态。加入P2后要轻轻上下摇晃8-10下,以免过度变性,无法高效提取质粒。 3️⃣ P3/E3DNA复性 当加入中和液(如乙酸钾)后,溶液的pH值恢复中性,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,而宿主细胞的染色体DNA复性缓慢,形成大的复合物。此步骤一定要剧烈上下颠倒8-10次,使质粒DNA充分接触中和液,不然提取的质粒浓度会很低。 4️⃣ 离心分离 在离心过程中,由于质粒DNA分子较小且复性迅速,它们会留在上清液中;而蛋白质与细菌基因组DNA由于缠绕形成絮状沉淀,在离心时会被沉淀下来。所以此步骤留下的是上清,剩下的就都是去上清啦。 5️⃣ PW 质粒纯化 上清液中的质粒DNA可以特异性地吸附到柱子上,通过漂洗将非特异性吸附的杂质洗掉,得到纯化的质粒。 6️⃣ 洗脱液或ddH20洗脱 将吸附在柱子上的质粒DNA洗脱下来,得到高纯度的质粒。一般吸取100-200ul即可,最后记得测浓度!第一次使用黄色柱子,第二次使用白色柱子,千万不要弄混,根据说明书使用即可。
中量质粒提取,关键步骤! 在分子克隆实验中,质粒的质量至关重要,它直接影响后续实验的效果。今天,我们来探讨如何使用EndoFree Plasmid Midi Kit进行中量提取/制备质粒,并分享一些关键步骤和注意事项。 Part I: 准备工作 确认P1溶液中已加入RNase,并记得及时放回4度保存。 加入buffer P1后,用vortex充分混匀,确保菌块完全裂解。 加入buffer P2后,温和混匀,避免打断基因组DNA。 加入buffer E3后,立即混匀,防止局部沉淀。 Part II: 激活与洗涤 使用去内毒素的试剂盒,避免内毒素影响细胞实验。 激活柱子,确保Buffer PW中已加入指定体积的100%乙醇。 建议用Buffer PW再多洗涤一次,确保质粒纯净。 Part III: 洗脱与预热 将灭菌蒸馏水提前预热至60度,提高洗脱效率。 去除吸附柱中残留的乙醇,以免影响后续酶促反应。 建议分两次洗脱,以提高洗脱效率。 此外,建议在每一步的间隙为下一步做准备,比如捏管子做标记等,尤其是一天要提几百个质粒的情况。
쥮验室小白成长记:从零开始的科研之旅𑊰 大二那年,我加入了中科大驻我校的实验室,开启了我的科研之旅。实验室的环境和氛围都非常好,导师们都是中科大的,他们还带来了科学岛上的师兄师姐,教我们做实验和传授经验。 젥开始加入实验室时,我对很多操作都不熟悉。导师让我跟着一个师姐学习。那一个月,我每天都在问师姐有没有实验可以带我做或者让我观摩学习的。师姐非常耐心地教我各种基础实验操作,比如PCR、菌液制备、易错PCR、跑胶、质粒提取、电转、化转、细菌扩大以及诱导、划线等等。虽然刚开始质粒提取不太熟练,但随着时间的推移,我的操作越来越熟练,提取的浓度也从68ng/提升到了450ng/。 后来,我和学弟分到了一个细胞课题,开始接触细胞学实验。我们学会了各种细胞培养、转染、荧光观察等技巧。每周的组会汇报就像答辩现场一样,导师会提出各种问题,我们则不断道歉并改正。 加入实验室后,我发现做实验其实也挺快乐的,感觉自己慢慢在变强。继续加油吧!希望在本科期间能有一篇article发表。
质粒电泳出现多条带?原因及解决方法详解 訿行琼脂糖凝胶电泳时,发现胶上出现的不是单一条带,这可能是由什么原因引起的呢?让我们一起来探讨一下吧! 正常情况下,质粒是双链闭合的DNA。但在质粒提取过程中,由于机械力、酸碱度或试剂等因素,质粒DNA链可能会发生断裂。在电泳过程中,这些断裂的质粒DNA可能会形成开环结构,甚至解开螺旋变成线形。因此,大多数质粒提取物中会含有三种构型的质粒。 质粒的三种形态: 1️⃣ 线形DNA:两条链都断裂,呈线性分子; 2️⃣ 开环DNA:一条链断裂,呈松弛的环状分子; 3️⃣ 共价闭合环状DNA:两条链没有断裂,呈超螺旋结构。 ️这三种形态在电泳时的分离速度不同,分离率顺序为:超螺旋DNA > 线性DNA > 开环DNA。 ᤺解这些信息后,如果你在实验中遇到类似问题,就可以更好地理解和解决问题所在啦!
同源重组构建质粒的详细步骤和注意事项 ❤️一、实验步骤 1️⃣ 载体线性化 ❶ 选择合适的克隆位点,对载体进行线性化。推荐使用双酶切方法,以降低转化背景(假阳性克隆)。 ❷ 酶切时,注意酶切时间,确保载体完全线性化。若使用单酶切,可适当延长酶切时间。 2️⃣ PCR扩增插入片段 ❶ 设计带有同源臂的引物,引物5'端引入与线性化载体末端一致的同源序列(15-20 bp)。 ❷ 使用高保真聚合酶进行PCR扩增,确保扩增片段的准确性与特异性。 3️⃣ 重组反应 ❶ 将线性化载体与扩增的插入片段按一定比例混合,加入重组酶,在一定温度下反应一定时间(如37℃,30分钟)。 ❷ 重组反应完成后,可直接进行转化或储存于-20℃备用。 4️⃣ 转化与筛选 ❶ 将重组产物转化至感受态细胞(如DH5🇧、复苏和涂板等步骤,得到单克隆菌落。 ❷ 通过菌落PCR和质粒提取后的酶切鉴定,筛选阳性克隆。 5️⃣ 测序验证 ❶ 将疑似阳性克隆的菌液送测序公司进行双向测序,比对测序结果与设计序列是否一致。 ❷ 若测序结果正确,则表示重组质粒构建成功,可进行后续实验。 ❤️二、注意事项 1️⃣ 引物设计:同源臂的长度和GC含量需控制在合理范围内(15-20 bp,GC含量40%-60%),以提高重组效率。 2️⃣ 酶切与纯化:确保载体线性化完全,并进行彻底的纯化,避免环状质粒残留。 3️⃣ 重组比例:载体与插入片段的摩尔比通常为1:2,根据实际情况调整。 4️⃣ 转化条件:控制转化产物的量和感受态细胞的状态,以获得理想的转化效率。 ❤️三、原理概述 同源重组法基于DNA分子间的同源序列,在重组酶的催化下实现载体与插入片段的定向重组。通过设计带有同源臂的引物,扩增出带有同源序列的插入片段,再与线性化的载体进行重组,最终得到重组质粒。 ❤️四、应用实例 以RNase P表达载体的构建为例,通过NCBI查找基因序列,设计带有BamHⅠ和SmaⅠ酶切位点的引物,扩增目的基因片段。随后,将目的基因片段与线性化的pGEX-2T载体进行同源重组,构建成功后转化至BL21工程菌中表达目的蛋白。
哪些实验必须测量DNA浓度?찟슥觔物学和分子生物学研究中,测量DNA浓度是许多实验的关键步骤。你知道哪些实验类型需要测DNA浓度吗?让我们一起来看看吧! PCR产物的纯化 슥𝓤𝠥了一次PCR实验后,通常需要测定扩增产物的浓度,以评估PCR的效率和为后续实验做准备。通常,1个吸光度值(A260)相当于50/ml的双链DNA,或者40/ml的单链DNA或RNA。 酶切产物的精确计算 ꊥ襈子克隆实验中,酶切后的DNA片段需要测定浓度,以便进行后续的克隆、测序或其他分析。通过测定A260,你可以得到精确的浓度,为接下来的实验做好准备。 质粒提取后的确认 𞊦取质粒后需要测定其浓度,以确保有足够的质粒用于转化、转染或其他分子生物学应用。 基因组DNA提取的质量检查 你刚刚从样本中提取了基因组DNA,现在需要评估提取的质量。A260/A280比值大于1.7表示你的DNA纯度很高,没有蛋白质污染。 DNA合成的精确度量 你合成了一段DNA,需要知道它的确切浓度。这不仅关系到后续实验的准确性,也关系到你的研究成果的可靠性。 构建文库的必备步骤 无论是基因组文库还是cDNA文库,DNA浓度的测定都是构建成功文库的关键。 基因组编辑的精细调控 ✂ CRISPR-Cas9等技术需要精确的DNA浓度来优化实验条件,确保基因编辑的成功率。 DNA疫苗的质量控制 在开发DNA疫苗时,准确的DNA浓度测定对于确保疫苗的剂量和效果至关重要。 这些实验都需要精确的DNA浓度测定,以确保实验的准确性和可靠性。希望这篇文章能帮助你更好地理解DNA浓度测定的重要性!
质粒构建全攻略:从零开始到成功转化 看着那些又大又圆的转化子,心情是不是特别美妙?质粒构建其实并不难,只要掌握了基本流程和技巧,你也能轻松搞定!下面我就来详细讲解一下质粒构建的整个过程。 质粒构建的基本流程 首先,我们需要准备好插入片段和载体。插入片段可以是gDNA、cDNA或者已有的质粒,只要上面有你需要的片段就行。然后,用PCR扩增出目标片段,回收这个片段。注意,PCR一般用pfu酶,如果扩增不好可以试试g或者保真较好的Taq。 设计引物 犊设计引物时,需要在引物末端加入合适的酶切位点,这样可以让插入片段和载体进行连接。常见的酶切位点有Sacl、HindIII、EcoRI和KpnI等。你也可以采用同源臂的设计,让载体和插入片段通过同源重组进行连接。 去磷酸化处理 在利用单酶切位点或者同尾酶进行克隆连接时,为了防止载体自身环化,需要对载体进行去磷酸化处理。常用的碱性磷酸酶有Shrimp Alkaline Phosphatase (SAP)或者Calf Intestinal Alkaline Phosphatase (CIAP)。去磷酸化反应体系一般包括酶切胶回收后的载体DNA、10xSAP buffer、SAP酶和H2O,总体积20ul。 大肠杆菌的转化 在实验前,将金属浴或者恒温水箱调至42℃。然后从-80℃冰箱取出感受态细胞,于冰上化冻。接着将连接或者无缝克隆产物全部加入100ul感受态细胞中,用手指轻弹混匀,冰上静置15~20分钟。然后42℃热激90秒,迅速置于冰上2分钟。接着在超净台内向热激后的细菌中加入400-800ul不含抗性的LB培养液,置于恒温摇床内37℃200rpm恢复30~45分钟。离心后倒出大部分LB,留少许约100-150ulLB,在超净台吹匀沉淀菌体,将菌体悬液均匀涂布在含有对应抗性的LB平板上(取决于转化的质粒载体抗性,如Amp*或者Kan*)。将涂布后的平板倒置于37℃恒温培养箱内培养12-16小时。最后挑取6~10个菌落进行菌落PCR鉴定,或者直接进行液体培养,提取质粒后用酶切的方法鉴定阳性克隆。 保存阳性菌 将鉴定出来的阳性菌进行保存,于标记好的冻存管中,每管中加入30%甘油和300新鲜细菌培养液,充分混匀后置于-80℃保存。注意事项:①如果转化的是纯质粒(非连接或者重组产物),一定要降低使用量和感受态细胞使用量、及涂布细菌量。②-80℃保存菌液时,可以在提质粒时留一点备用。 希望这篇攻略能帮到你,祝你早日构建出成功的质粒!
质粒提取及纯化实验全攻略슰 实验准备 LB培养基: 蛋白胨:2g 酵母提取物:1g NaCl:2g 超纯水:200ml 将以上成分加入500ml锥形瓶中,调PH至7.5,封口后120摄氏度灭菌20分钟。 灭菌准备: 准备两个平板和试管,进行灭菌处理。 灭菌后,待培养基冷却,加入200 Amp(氨苄,母液50mg/kg,稀释1000倍)。 操作步骤 倒平板: LB培养基(50ml)+1.5%琼脂(0.75g),冷却后加入100 Amp。 将培养基倒入50ml离心管中,每个平板约20ml。 待平板凝固后,准备5个2ml离心管,每管1ml生理盐水。 从-80度冰箱取出大肠杆菌菌液,用1ml枪头刮取菌液,依次稀释。 涂布: 用酒精灯热灭菌涂布棒,放凉。 将平板底部在酒精灯周围烧一下,打开平板,用涂布棒推开菌液,以画圆形式涂布均匀。 培养: 将平板放入37摄氏度烘箱,倒置培养8小时左右。 接菌: 用枪吸2ml培养基到试管中,从平板中挑选单菌落,接种到试管中。 放入37度震荡培养箱培养8小时,观察是否变浑浊。 下午5-6点,浑浊后直接倒入锥形瓶中,37度震荡培养箱培养16-17小时。 砨𒒦取及纯化 按照生工质粒抽提说明书操作,提取好的质粒去测浓度,并记录在管壁上。 注意事项 所有操作需在无菌房内进行。 灭菌后待培养基冷却再加入Amp。 涂布棒使用前需热灭菌并放凉。 젥ꌧ 实验完成后,确保所有实验器材和物品都已清洁和消毒,以避免交叉污染。
00后实验室新星:师弟的奇遇记 实验室来了一位轮转的师弟,名校毕业,生物学背景,性别优越,大家对他充满期待。 师弟第一天到实验室,就对实验室的一草一木表现出极大的兴趣,仿佛新生儿第一次看到世界。他对液氮桶结冰的现象感到惊奇,对一个泡沫盒做成的冰盒能仔细端详五分钟,更不用说电泳仪和PCR仪这种大型设备给他带来的震撼。 师弟在待人接物上也显得与众不同,对熟悉的师兄师姐直呼姓名,对不熟悉的则以“喂”作为称呼,并趾高气昂地提出自己的要求(例如:有没有剪刀?)。 师弟对带自己做实验的师姐表现出一种自己是上帝般的恩赐态度,每天早九晚五,绝不多待一秒钟。师姐以近乎请求的态度说晚上再来一下,师弟义正辞严地拒绝:我晚上要运动,晚上做实验不安全。 直到今天,师弟第一次独自提质粒并用电泳验证是否有条带,结果发现质粒没提出来,于是对实验室价值几十万的曝光仪动手动脚表示不满。路过的师姐友好提醒珍惜仪器,师弟终于震怒:你用什么口气跟我说话!然后摘掉手套扔进生活垃圾桶,摔开椅子,一边走路一边跺脚离开实验室。
学校上课的那些幸福时光 最近帮小师姐处理了五十份发票,提前一天回到学校,感觉整个人都轻松了不少。晚上在万达吃晚饭的时候,突然收到那两口子的消息,瞬间觉得嘴里的香蕉都不香了。可能我还是太笨了吧,没能领悟到让我做阳转还包括提质粒的深意。 周一那天,我问了大师姐,她说先挑一两个菌送去测序(记得很清楚,她没提提质粒的事)。当时忙着提那178份RNA,挑完放到摇床就没管了,晚上回学校上课。可能也怀着一种侥幸心理:我走了,后面有啥他俩肯定会安排别人吧? 这次算是长教训了,做事得多往后想一步。完美的周四是早上正报发票,被大师兄叫去胶回收测浓度,然后插枪头。大师姐让我洗锥形瓶、配培养基,接着配核酸胶。下午倒平板、报发票,晚上组会。快下班了突然让阳转,十一点才下班。 总的来说,我们小组还是非常友爱和谐的,虽然有时候任务重得让人喘不过气来,但大家互相帮助,一起度过难关。在学校上课的日子,真的是既幸福又充实。
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