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分子内氢键前沿信息(2024年12月实时热点)

内容来源：麦吉窗影视所属栏目：教程更新日期：2024-12-03

分子内氢键

SDS-PAGE操作原理详解：一看就懂！ 𐟔젓DS-PAGE（十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳）是一种广泛用于蛋白质分离和定量的技术。其操作原理主要基于SDS（十二烷基硫酸钠）的特殊性质和聚丙烯酰胺凝胶的分子筛效应。 𐟌€ SDS的作用：SDS是一种阴离子去垢剂，能够破坏蛋白质分子内的氢键，使蛋白质分子去折叠，从而破坏其二级和三级结构。此外，SDS还能使蛋白质带上大量的负电荷，这些负电荷远超过蛋白质原有的电荷量，因此消除了不同蛋白质之间的电荷差异，使得蛋白质的分离仅与其分子量相关。 𐟧꠨š丙烯酰胺凝胶的分子筛效应：聚丙烯酰胺凝胶具有分子筛作用，小分子量的蛋白质可以轻松通过凝胶孔径，受到的阻力较小，迁移速度快；而大分子量的蛋白质则受到较大的阻力，迁移速度较慢。这样，蛋白质在电泳过程中就会根据其分子量的大小被分离。 𐟔„ 通过上述原理，SDS-PAGE能够高效地分离和纯化蛋白质，为后续的蛋白质分析和研究提供基础。

分子动力学模拟：从基础到高级分析分子动力学模拟是一种强大的工具，广泛应用于生物信息学、药物设计和材料科学等领域。它可以进行多种类型的分析，包括基础分析如RMSD、RMSF和氢键作用，以及高级分析如轨迹动画生成。基础分析 𐟓Š RMSD（均方根偏差）：用于评估分子构象的变化。 RMSF（均方根涨落）：反映分子中各个原子在不同时间点的位置变化。氢键作用：分析分子间或分子内的氢键相互作用。轨迹动画生成 𐟎슩€š过分子动力学模拟，可以生成MP4格式的动画，直观展示分子的动态行为。作图与静电势能分析 𐟖𜯸 Pymol：一种常用的作图工具，用于创建分子结构图。静电势能分析：计算分子的静电势能，了解分子内部的电荷分布。蛋白突变位点分析 𐟧슩€š过分析蛋白的突变位点，了解这些突变对蛋白结构和功能的影响。相互作用模式分析 𐟔„ 分析分子之间的相互作用模式，揭示分子间的结合力和结合方式。自由能计算 ⚖️ 结合自由能计算（MM-PBSA、MM-GBSA）：用于评估分子间的结合自由能。自由能残基分解分析：将自由能分解到每个残基，了解残基对整体自由能的贡献。非标准体系计算 𐟌 适用于非标准体系的计算，如溶剂效应、离子浓度等。蛋白共价对接模拟 𐟔— 模拟蛋白共价对接过程，了解共价键的形成和断裂。膜蛋白模拟 𐟌 适用于膜蛋白的模拟，研究膜蛋白在细胞膜中的行为和功能。分子动力学模拟不仅能提供丰富的分析结果，还能为药物设计和生物信息学研究提供有力的支持。

7号冰：海洋冻结的秘密物质 𐟌Š 在科幻小说《猫的摇篮》中，有一种神奇的物质被描述为“7号冰”，它能在常温下表现为固态，当与液态水接触时，能使水瞬间冻结成冰，并且冰会迅速蔓延。这种物质如果被投入地球的海洋中，理论上能在短时间内使全球海洋冻结。那么，这种说法是否真实呢？让我们来探究一下“7号冰”到底是什么。 𐟔젤𛎥𞮨炨璥𚦦姜‹，水分子由两个氢原子和一个氧原子构成，每个氢原子与氧原子共用一对电子，形成“共用电子对”。由于“共用电子对”偏向氧原子，水分子整体上表现为氢原子带正电，氧原子带负电。这种电子分布使得相邻水分子之间产生相互吸引的作用，称为“氢键”。 𐟧Š 当液态水冻结成冰时，水分子通过“氢键”彼此连接，形成有序的晶体结构。根据环境条件的不同，水分子可以形成不同的晶体类型。而“7号冰”就是其中一种晶体类型，科学家通常称其为“冰 VII”。 𐟌᯸ 科学家研究表明，“7号冰”确实可以在常温下存在。其独特的晶体结构使得结晶核与液态水分子之间几乎没有中间热层，从而使得液态水分子结晶的速度仅受已结晶的水分子的初始排列影响。理论上，只需要大约100个水分子就能形成“7号冰”的“种子”，而“种子”一旦形成，就会使附近的液态水迅速冻结成“7号冰”，其在液态水中的扩散速度可以达到每小时1600公里。 ⛰️ 然而，要使“7号冰”在常温下形成，还需要一个必不可少的条件——压强。实际上，在常温下形成“7号冰”，至少需要3Gpa的压强，这相当于标准大气条件下地球海平面大气压的3万倍！即使是在地球海洋的最深处——马里亚纳海沟的挑战者深渊，那里的压强也远远达不到这个数值。 𐟌 因此，一块“7号冰”并不能让地球海洋全部冻结。虽然“7号冰”的存在和扩散速度确实令人惊叹，但它的形成条件极为苛刻，使得它在自然条件下几乎不可能实现。所以，虽然“7号冰”是一种神奇的物质，但它并不能让地球海洋在短时间内全部冻结。

水半球和陆半球这节课的内容虽然不多，但水的极性分子和高的比热容却让人头疼。为了不让学生们晕头转向，我决定简化讲解。水的角色 𐟒犊水是细胞中的重要组成部分，它不仅占据了细胞内大部分空间，还参与了各种生命活动。水在细胞中以两种形式存在：自由水和结合水。自由水可以自由流动，是细胞内良好的溶剂；而结合水则与细胞内的其他物质相结合，是细胞结构的重要组成部分。水的物理特性 𐟌᯸ 水的比热容较高，这意味着水的温度相对不容易发生改变。这种特性对维持生命系统的稳定性非常重要。同时，由于水分子的极性，水分子之间可以通过氢键相互作用，这使得水在常温下能够维持液体状态，具有流动性。无机盐的作用 𐟌🊊虽然水和无机盐在细胞中的含量不同，但它们在细胞的生命活动中都扮演着重要角色。无机盐是细胞中含量很少的无机物，仅占细胞鲜重的1%-1.5%。它们在细胞中以离子的形式存在，含量较多的离子有Na⁺、K⁺、CaⲢ𚣀MgⲢ𚣀FeⲢ𚣀FeⳢ𚧭‰。这些离子对于维持细胞的正常代谢和生命活动至关重要。细胞中的无机物与生命活动 𐟌𑊊植物体缺P常表现为生长发育不正常，这说明植物体需要适量的无机盐来支持其正常的生命活动。例如，植物在缺N、P、K等营养元素时，会出现生长发育不良的现象。同时，人体内Na缺乏会引起神经、肌肉细胞的兴奋性降低，最终引发肌肉酸痛、无力等症状。因此，当大量出汗排出过多的无机盐后，应多喝淡盐水。结论 𐟓 水和无机盐是细胞的重要组成成分，它们在细胞的生命活动中发挥着重要作用。了解这些物质的性质和作用，有助于我们更好地理解生命的本质。希望这节课能帮助学生们更好地掌握这些知识！

「x-mol微资讯」【异手性选择性反应体系的构建和手性放大效应】网页链接厦门大学江云宝教授实验室的研究工作“Heterochiral coupling to bilateral turn structured azapeptides bearing two remote chiral centers”近日发表于Nature Communications 期刊。有趣的是，该项研究起因于一个梦境，梦见对苯二异硫氰酸酯与外消旋乙酰基-L-/D-苯丙氨酰肼的反应为异手性偶合。当时实验室正在研究氨基酸酰氨基硫脲的转角结构 (Chem. Commun. 2013, 49, 8943)，日思梦想的是转角之间如何结合而使转角螺旋结构的螺旋性得以有效延展。酰基氨基酸酰肼与结构对称的对苯二异硫氰酸酯反应得到的产物中将含有两个转角结构，经对苯基二硫脲中的硫酰胺基-NH参与的两个分子内氢键关联。

透明质酸：护肤界的万能胶透明质酸，听起来有点医学感，其实就是我们常说的玻尿酸。它是一种酸性粘多糖，主要存在于人体的细胞间质中。最早是从牛眼玻璃体中分离出来的，后来发现它在人体内有很多重要的功能，比如调节血管壁的通透性、调节蛋白质，还能促进伤口愈合。透明质酸的功效 𐟒犨ᥦ𐴤🝦𙿯𜚩€明质酸里有大量的羚基和羟基，这些小家伙会吸取氢键形成水溶液，能结合自身400倍以上的水分子，简直是超强补水神器！紧致抗衰：它能促进皮肤营养成分的平衡，帮助废弃物代谢，填充细胞间隙，淡化细纹，让肌肤更紧致。修复肌肤：通过促进表皮细胞的增殖和分化，清除氧自由基，透明质酸还能修复受伤的皮肤。抗菌抗炎：它能形成粘合细胞的凝胶，保护细胞组织正常代谢和持水功能，避免有害物质入侵，防止各种感染。填充凹痕：透明质酸常用于填充皱纹和凹陷，效果立竿见影。适用人群 𐟑劧š䧲—糙缺水：透明质酸就像给肌肤提供了一个强大的吸水海绵，帮助肌肤吸水和锁水，让肌肤滋润透亮。皱纹、凹陷：由于透明质酸特殊的分子结构和它本身就是构成细胞间质的成分，所以填充效果非常好，而且不会发生排异反应。衰老肌肤：它能帮助肌肤吸收营养物质，给细胞提供充足的养分，起到抗衰老的作用。总结 𐟓 透明质酸真的是护肤界的万能胶，既能补水保湿，又能紧致抗衰，还能修复肌肤和抗菌抗炎。特别是对于那些皮肤粗糙、有皱纹和凹陷、或者需要抗衰老的人群来说，透明质酸简直是救星！下次选择护肤品的时候，不妨多留意一下成分表，看看有没有透明质酸哦！

有机化学书：药学生的好帮手 𐟓š 有了这本有机化学书，妈妈再也不用担心我的有机化学了！这本书详细讲解了有机化学的各种概念和原理，让我对这门学科有了更深入的理解。分子内作用力与构象变化 𐟌€ 在有机化学中，分子内作用力是一个非常重要的概念。这本书详细介绍了分子内作用力是如何影响分子中原子排列的。例如，乙烷分子中的旋转运动和构象变化，通过这些运动，分子可以在能量上达到更加优势的排列。氢键与反应活性 𐟌𑊊氢键是有机化学中的另一个关键概念。这本书通过实验数据和理论计算，展示了二级氢与氯的反应比一级氢更快，这是因为二级氢的反应性更高。这种反应速度的差异在实际化学反应中有着重要的影响。构象异构体与热力学研究 𐟔 构象异构体是有机化学中的一个有趣领域。这本书通过详细的图示和计算，展示了构象异构体的多样性和它们之间的相互转化。热力学和动力学的研究可以帮助我们更好地理解这些反应的本质。总结 𐟓 总的来说，这本书是一本非常全面和深入的有机化学教材，适合药学生和其他对有机化学感兴趣的朋友们。通过阅读这本书，我对有机化学的原理和反应机制有了更清晰的认识，也更加自信地应对各种有机化学问题。

化妆品原料技术应用：让美丽更高效！嘿，大家好！今天咱们继续聊聊化妆品原料的那些事儿。上次咱们讲了讲原料提取技术，这次咱们来聊聊原料递送和锁鲜技术，干货满满，赶紧收藏起来吧！原料递送技术：让活性成分直达肌肤深处 𐟚€ 原料递送技术其实就是把化妆品里的活性成分送到皮肤需要的地方。只有这样才能让活性成分在皮肤上发挥最佳效果。超分子促渗技术：小分子力量大 𐟒ꊊ超分子促渗技术利用超分子化学原理，通过分子间作用力（比如氢键、静电作用等）来提高活性成分的渗透效率。这样一来，活性成分在渗透过程中的损失就少了，皮肤中的生物利用度和安全性也提高了。具体来说，有超分子促渗技术和超分子包裹技术两种。脂质体包裹技术：细胞膜的灵感 𐟌🊊脂质体是由磷脂形成的双分子层结构，模拟了细胞膜的结构，能把亲水性和亲脂性成分都包裹在内。这种技术公认安全高效，有助于活性成分穿透皮肤屏障，提高其在皮肤深层的浓度和效果。细胞靶向识别技术：精准打击 𐟎通过将活性成分包裹在特定载体中，这些载体能与皮肤中特定类型的细胞受体结合。这样就能实现活性成分的精准传递，提高效果，减少对皮肤其他部位的潜在影响。比如说，想做美白、修复功效的产品就会采用这些技术。原料锁鲜技术：保持活性成分的新鲜度 𐟍 原料锁鲜技术主要用于保持化妆品中活性成分的稳定性和新鲜度，避免由于氧化、光照或温度变化导致的效果降低。主要是利用冻干技术。冻干技术：冰箱里的魔法 ❄️ 通过超速冷冻将化妆品中的水分冻结，然后在真空条件下将冰直接从固态升华为气态，去除水分而保留活性成分。这种方法得到的冻干产品在重新溶于水后能够迅速恢复活性，保证了成分的稳定性和有效性。好了，今天的干货就聊到这儿。希望这些信息能帮到你们，让美丽更高效！如果有任何问题或想法，欢迎在评论区留言哦！

质粒DNA提取与琼脂糖凝胶电泳实验全攻略 𐟓… 实验日期：2024年9月2日 𐟑堥ꌥ𐏧𛄯𜚥Œ组人 𐟓 实验目的：掌握碱裂解法提取质粒DNA的方法和原理掌握质粒DNA琼脂糖凝胶电泳及结果分析 𐟔젥ꌥŽŸ理：质粒是一种环状双链DNA，大小从1kb至200kb不等，存在于细胞质中，独立于细胞染色体之外，自主复制的遗传成分。碱裂解法提取质粒DNA：菌体在pH12.0-12.5的范围内，DNA双螺旋结构解开变性，但环状质粒DNA的氢键虽断裂但两条互补链彼此依然相立盘绕紧密结在一起。当加入中和液后，质粒DNA分子迅速复性，呈解状态，通过高速离心，质粒DNA与细胞碎片等杂质分离。 𐟧ꠥꌦ�꤯𜚊1️⃣ 过夜培养的菌液于离心管内，10000rpm离心尽量弃上清。 2️⃣ 将细菌重悬于2ml Buffer I中（已加入RNase A），用移液器反复吸打彻底悬浮细菌沉淀。 3️⃣ 加入210 Buffer II，温和的上下颠倒4-6次使菌体充分裂解，直到菌液变得粘稠，用移液器不应起过剧搅拌以免质粒受到破坏。 4️⃣ 加入LB，立即上下颠倒4-6次，此时出现白色絮状沉淀，离心形成沉淀。 5️⃣ 将步骤4中的上清加入到已装入收集管的吸附柱中，注意不吸出沉淀，离心1分钟，倒掉收集管中间废液，将吸附柱放回收集管中。 6️⃣ 加入500 Buffer W2，离心1分钟，倒掉收集管中的废液。 7️⃣ 向吸附柱中加入500 Buffer W2，再次离心1分钟，倒掉收集管中的废液。 8️⃣ 将吸附柱重新放回收集管中，离心2分钟，倒掉收集管中的废液。 9️⃣ 将吸附柱置于室温数分钟以彻底干燥。 𐟔Ÿ 将吸附柱置于一个新的离心管中，向吸附膜中滴加50 Buffer EB，室温放置2分钟，离心1分钟，将质粒溶液收集到离心管中。 1️⃣1️⃣ 制备琼脂糖凝胶，加样后电泳分析观察结果。 ⚠️ 注意事项：器具清洗干净，防止外源性核酸酶对DNA的降解。每次起跑菌液量应控制在4ml，菌量大小影响溶菌酶对质粒DNA的释放和纯化时的纯度。培养时间不要超过6小时，细菌会崩解引起大量死亡导致质粒丢失。 Buffer W2使用前置于4℃保存。加入Buffer W2后不要剧烈搅拌4-6次即可。剧烈搅拌会导致基因组DNA污染。加入Buffer W2的时机要适中，既要保证质粒DNA不因作用时间过长发生不可逆变性。 𐟓Š 实验结果：提取的质粒DNA可能拥有不同构象，因此呈现非单带可能螺旋状。不同泳道的亲亮度不同，提示质粒含量不同，亲带成亮说明DNA含量越高（结后的核酸材料越多），也该明那一组提取的质粒度越纯。可能出现电泳条带不切一的情况，可能是由于加样时从组成孔内样分不均影结果。也可能是由于样品浓度太高，凝胶制不花，导致拖带。加样时手抖可用另一手按住胶板边缘，加样之对准孔底，以免加到孔壁上而影响实验结果。 𐟔젥ꌥˆ†析：在本次实验中，我们掌握了碱裂解法提取质粒DNA的方法和原理，并成功进行了琼脂糖凝胶电泳分析。通过实验结果可以看出，提取的质粒DNA可能拥有不同构象，不同泳道的亲亮度不同提示质粒含量不同。实验过程中需要注意器具清洗干净、控制菌液量、培养时间以及Buffer W2的使用方法等细节。希望本次实验能为其他同学提供一些参考和帮助。