克隆载体最新视觉报道_克隆载体名词解释(2024年12月全程跟踪)
如何选择和构建质粒载体?一文搞定! 在分子克隆的世界里,选择合适的质粒载体可是个技术活儿。今天,我们就来聊聊如何挑选和构建质粒载体,让你的实验更上一层楼! 质粒载体的构成要素 슩斥 ,咱们得搞清楚质粒载体的构成。简单来说,质粒载体就像是基因工程的“运载工具”,负责把外源基因送到受体细胞里。它们是一类能自我复制的DNA分子,其中有一段DNA可以被切除而不影响复制,这样就可以用来置换或插入外源基因。 常见的质粒载体有质粒、噬菌体和病毒等,但今天我们主要聊聊质粒。质粒载体通常具备以下几个要素: 复制起始位点(Ori):控制复制的起点。 抗生素抗性基因:方便检测。 多克隆位点(MCS):用于插入外源基因片段。 启动子/增强子:调节基因表达。 终止信号:确保基因表达正确。 poly(A)稳定mRNA:增加mRNA稳定性。 如何选择质粒载体? 选择质粒载体时,主要考虑以下几个方面: 构建目的:是要克隆还是表达?选择合适的克隆载体或表达载体。 载体类型: 克隆载体:根据克隆片段大小选择,小的选质粒,大的选其他类型。 表达载体:根据受体细胞类型选择,比如原核或真核。 启动子:选择合适的启动子,特别是对于真核蛋白质表达时要注意稀有密码子、糖基化修饰和阅读框错位等问题。 酶切位点:载体MCS中的酶切位点数和组成方向要适应目的基因与载体的连接,避免阅读框架错位。 选择质粒载体的4点要求 尽量选分子量小的质粒:小载体(1-1.5kb)更稳定,不易损坏,拷贝数也多。 使用松弛型控制质粒:可自主复制,每个宿主细胞有10~200个质粒拷贝,有利于分子克隆。 具备多种限制性内切酶切点:但每种切口最好只有1个。 必须有易检测的标记:如抗药性标记,蓝白斑试验等。 小结 无论你选用哪种载体,首先都要获得载体分子,然后采用适当的限制酶将载体DNA进行切割,获得分子,以便于与目的基因片段进行连接。希望这些小贴士能帮你在分子克隆的道路上走得更稳、更远!
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如何阅读质粒图谱:简单五步搞定! ꧬ줸步:首先找到 Ori 的位置,了解质粒的类型(原核、真核或穿梭质粒)。 ꧬ줺步:接着看筛选标记,例如抗性标记,决定使用哪种筛选标记。例如: Ampr:水解 酰胺环,解除氨苄的毒性。 tetr:阻止四环素进入细胞。 camr:生成氯霉素羟乙酰基衍生物,使之失去毒性。 neor(kanr):氨基糖苷磷酸转移酶使G418(长那霉素衍生物)失活。 hygr:使潮霉素䱦 ꧬ줸步:查看多克隆位点(MCS),它具有多个限制酶的单一切点,便于外源基因的插入。如果在这些位点外有外源基因的插入,会导致某种标志基因的失活而便于筛选。决定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。 ꧬ쥛步:再看外源 DNA 插入片段大小。质粒一般只能容纳小于10Kb的外源DNA片段。一般来说,外源DNA片段越长,越难插入,越不稳定,转化效率越低。 ꧬ줺步:检查是否含有表达系统元件,即启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录终止信号。这是用来区别克隆载体与表达载体。克隆载体中加入一些与表达调控有关的元件即成为表达载体。选用那种载体,还是要以实验目的为准绳。 启动子:促进DNA转录的DNA顺序,这个DNA区域常在基因或操纵子编码顺序的上游,是DNA分子上可以与RNApol特异性结合并使之开始转录的部位,但启动子本身不被转录。 增强子/沉默子:为真核基因组(包括真核病毒基因组)中的一种具有增强邻近基因转录过程的调控顺序。其作用与增强子所在的位置或方向无关。即在所调控基因上游或下游均可发挥作用。/沉默子-负增强子,负调控序列。 核糖体结合位点/起始密码/SD序列(Rbs/AGU/SDs):mRNA有核糖体的两个结合位点,对于原核而言是AUG(起始密码)和SD序列。 转录终止顺序(终止子)/翻译终止密码子:结构基因的最后一个外显子中有一个 AATAAA 的保守序列,此位点 down-stream 有一段GT或T富丰区,这2部分共同构成poly(A)加尾信号。结构基因的最后一个外显子中有一个AATAAA的保守序列,此位点down-stream有一段GT或T富丰区,这2部分共同构成poly(A)加尾信号。
쨴觲载体构建全攻略✨ 你是否对质粒载体构建感到困惑?别担心,这篇攻略将带你一步步了解整个流程! ᠪ*质粒载体设计** * **优化序列**:通过突变或重组技术,提升质粒在宿主细胞中的复制效率和稳定性。 * **添加元件**:为质粒添加启动子、终止子等,增强其功能和表达效率。 * **多克隆位点**:设计并插入多克隆位点,提供多个独特的酶切位点,方便插入外源基因。 * **高拷贝数质粒**:改造质粒以增加其在宿主细胞中的拷贝数,提高外源基因的表达量。 젪*质粒载体类型** * **克隆载体**:按用途分类,包括原核载体、真核表达载体等。 * **表达调控载体**:体外转录载体、基因表达载体等,用于实现基因的表达调控。 **重组蛋白表达载体** * **特点**:含有目标蛋白筛选、纯化的特定标签元件。 * **限制**:成本高,放大困难,部分蛋白因结构复杂而无法高效表达。 **非编码RNA表达载体** * **特点**:调控基因表达,引发免疫反应。 * **应用**:研究非编码RNA生物学功能,治疗某些由异常基因表达引起的疾病。 ꠪*CRISPR Cas9敲除载体** * **特点**:基于CRISPR-Cas9系统的基因敲除工具,具有高度的RNA识别和切割能力。 * **应用**:编辑对象包括DNA和RNA,广泛应用于各种生物体系。 ᠪ*常见问题及解决方案** * **重组效率低**:优化酶切、连接条件,或尝试使用不同的连接酶。 * **外源基因片段丢失**:检查酶切位点是否正确,避免使用非特异性酶切。 * **重组质粒不稳定**:在质粒载体上加入稳定序列,如复制原点、选择标记等。 ✨ 现在,你是否对质粒载体构建有了更清晰的了解呢?赶快行动起来吧!
质粒图谱详解:四大要素及常见元件 在生物科研领域,质粒是一个常见且重要的概念。当你面对质粒图谱时,可能会被各种箭头和英文序列搞得一头雾水。别担心,今天我就来为你详细解读质粒图谱的四大要素和一些常见的元件。 复制起点:质粒的“心脏” 首先,我们来说说复制起点。质粒的复制起点决定了质粒的宿主和拷贝数。图谱中的ori就是复制起点的标志。如果图谱上只有一个ori,那这个质粒通常是原核克隆和表达质粒。而如果图谱上有两个ori,那这个质粒就是穿梭质粒,可以在原核和真核细胞中复制。 筛选标记:质粒的“身份证” 接下来是筛选标记。图谱中的AmpR、KanR等表示抗生素抗性基因,这些基因方便我们通过抗生素筛选阳性克隆。一般来说,只存在单抗性的质粒多是原核克隆载体和原核表达载体,而存在两种或以上抗性的多为穿梭质粒。 多克隆位点:外源基因的“入口” ꊥ䚥 隆位点是多外源DNA的插入位点,通常位于转录启动和转录终止信号之间。图谱中的MCS区或者许多内切酶集中的部分就是多克隆位点。通过酶切后连接的方式,我们可以将外源DNA插入质粒。 其他元件:质粒的“配件” ️ 除了复制起始位点、筛选标记和多克隆位点外,质粒载体中还有一些其他的表达或调控元件,如转录调控元件、翻译调控元件和融合表达标签蛋白等。这些元件可以增强质粒的功能性,比如蛋白纯化标签蛋白(如His-Tag、GST-tag)、蛋白检测标签蛋白(如Myc-Tag、Flag-Tag、HA-Tag)以及荧光蛋白表达标签(如GFP、mCherry)。 希望这篇文章能帮你更好地理解质粒图谱,赶紧找个质粒图谱去看看吧!相信你会有更多的收获!
쨴觲载体构建的三大方法슦🥈𐧛基因后,如何高效地将其克隆到质粒载体上呢?这里介绍三种主流的载体克隆方法: 1️⃣ T4连接酶法: 首先,使用相同的限制性内切酶同时双酶切质粒载体和目的片段,使两端产生黏性末端。然后,利用T4连接酶进行连接。注意保护酶切后的黏性末端,避免破坏。 2️⃣ 无缝克隆法(同源重组)쯼 这种方法需要线性化载体与目的片段带有20bp左右的同源臂。通过5’端核酸外切酶、DNA聚合酶和DNA连接酶的共同作用,实现载体的无缝克隆。优点是连接效率高,且阳性率高。 3️⃣ PCR法克隆载体: 最经典的是环PCR对质粒进行点突变,可以删除或添加序列到载体上。CR还能连接长片段到载体上,完全脱离了酶切位点的限制。 这三种方法各有特点,选择哪种取决于你的具体需求和实验条件哦!ꀀ
쥦何轻松解读质粒载体图谱 解读质粒载体图谱是生物实验的关键步骤,它让你更深入了解质粒的结构与功能。下面,让我们一起探索如何轻松解读这个复杂的图谱吧! 首先,找到关键元素: 1️⃣ 复制起始位点(Ori),它是质粒复制的起点,通常只有一个。 2️⃣ 抗生素抗性基因,如Amp^r或Kan^r,用于筛选转化成功的细胞。 3️⃣ 多克隆位点(MCS),这里可以插入外源基因片段。 4️⃣ 启动子/增强子(P/E),它们控制基因表达,位于基因上游。 5️⃣ 终止信号(Terms),指示转录结束的位置。 接下来,分析载体类型: * 原核载体通常含有原核生物的复制起始位点。 * 真核载体则含有真核生物的复制起始位点。 * 穿梭载体两者都有,能在两种生物间复制。 然后,考虑载体的应用: * 如果是克隆基因,选克隆载体。 * 如果是表达基因,选表达载体。 * 别忘了考虑稳定性、复制效率和转化效率哦! ꥈ륿了检查限制酶切位点: * 在插入外源基因前,要确保载体上的限制酶切位点与目标基因相匹配。 还有,注意载体大小: * 质粒通常只能容纳小于10Kb的外源DNA片段。 最后,确认表达系统元件: * 如果载体是表达型,应包含启动子、核糖体结合位点等,驱动外源基因表达。 现在,你是不是对质粒载体图谱有了更深入的了解呢?
三分钟搞懂T4法构建载体的三种变式连接 今天我们来聊聊T4法在构建载体时的三种变式连接。T4法常用于空载体的改造,通过两种内切酶将质粒DNA切开,产生带有黏性末端的线性化载体。目的片段通常是合成的小片段DNA分子,长度通常在100bp以下。 首先,我们来说说环PCR。环PCR的点突变一般只能引入60bp以下的序列。具体来说,60bp中,20bp作为扩增序列,40bp是额外添加的5’端附加序列,其中需要包含一段同源臂,真正能引入的大概只有40-45bp的额外序列。很少看到有人把PCR使用的引物设计到60bp以上。 接下来是无缝克隆。无缝克隆在载体骨架上引入100bp左右的小片段更是一种灾难。无缝克隆酶主要包含三种核心功能酶:5’端核酸外切酶、DNA聚合酶和DNA连接酶。其中5’端核酸外切酶的功能远比大家想象的更加强大。虽然我们讲同源臂加20bp左右的序列,但其实5’端核酸外切酶远不止切割掉这20bp左右的同源臂,个人认为切割长度起码在60bp以上。左右各切60bp的话,我们合成的100bp的DNA分子其实已经被切碎了,自然不可能连接到载体上。 所以,我们只能通过T4法将80-150bp的短小DNA序列插入载体骨架。具体设计方式如上图所示。 下一期,我们将探讨一种被称为“玄学”的技术——搭桥PCR或重叠PCR。这是我以前做分子克隆时第一个感觉玄学的实验,当然到现在我自认为已经非常精通其原理,但仍感觉其相当玄学。 关注我,我们一起领略科研背后的底层逻辑!
촴-导师秘而不宣的载体区分法 你是否遇到过这样的情况:导师希望你能掌握某种载体区别方法,但却又没有直接传授给你?别担心,今天我们就来揭秘这个方法! 首先,我们要了解载体的基本概念。载体,也就是我们常说的“Vector”,在生物工程领域扮演着重要角色。 즎夸来,我们要区分两种重要的载体类型:克隆载体和表达载体。 1️⃣ 克隆载体(Cloning Vector):它是用于复制和扩增DNA片段的工具,就像一个DNA的“复制品”。 2️⃣ 表达载体(Expression Vector):它则负责将DNA片段导入细胞并使其表达出相应的蛋白质或RNA。 ᩀ择载体的关键在于明确你的实验目的。不同的实验需求,可能需要不同类型的载体来解决。 现在,你是否对载体的区分有了更清晰的认识呢?这个方法虽然导师没有直接教你,但通过自学,你也能成为生物工程领域的佼佼者!加油!
分子克隆实验指南:从零开始到成功 大家好!首先,非常感谢你们的关注和喜欢,真的很开心我的笔记能帮到大家。还记得最开始的那篇笔记,记录了我那次离谱的分子克隆实验,4个片段的同源重组竟然花了两个月!后来我慢慢发现,分子克隆其实非常微妙,有点像高中时的数学,学霸们轻而易举考100分,而我这种小学渣每次都在及格边缘反复横踩。所以,我想用这个账号记录我的科研日常,希望能和大家一起学习。 之前的几篇笔记中,我分享过引物设计、载体酶切、同源重组等非常具体的实验方法。但最近我发现,很多粉丝朋友们刚开启自己的科研之旅,或者是偏向临床的科研大佬们,对分子克隆实验整体了解比较少。所以今天,我想跟大家分享一下质粒构建的大体流程。 明确你的目标 斥 ,在构建质粒之前,你需要有一个清晰的计划。明确你要使用哪种克隆方法,比如同源重组、TOPO克隆还是T4连接。TOPO/TA克隆不需要同源臂,而同源重组和T4连接是需要同源臂的。 选择合适的载体 根据你的实验目的,选择合适的表达载体。例如,常用的原核表达载体有pET28a,真核表达载体有pcDNA3.1,CRISPR/Cas9表达载体有Lenti-V2等等。载体可以通过酶切或者环形PCR后,跑胶回收所需的载体片段。 设计引物并扩增片段 슦 选的构建方法,设计并合成引物。PCR扩增需要插入的目的片段,PCR的产物也需要通过跑胶回收。 连接与转化 将载体和目的片段连接后,转入合适的感受态细胞内。例如,DH5产生突变或者缺失,而Stable3相对更加稳定。但提质粒时需要使用试剂盒中的去蛋白液洗3遍,以充分去除核酸酶,减少后续对质粒酶切等实验的影响。通常连接产物的用量不超过总体积的1/20。然后在冰上静止20分钟,热激1分钟,再冰上静置3分钟,加入无抗的LB培养基,摇床摇40-60分钟,最后涂在合适抗性的LB平板上。 培养与鉴定 ꊌB板子放在37度培养箱内过夜生长,第二天挑取单克隆细胞,置于合适抗性的LB培养基中摇菌,然后提质粒送测序公司测序。如果你想偷懒的话,也可以直接送菌液到公司哦,菌液和质粒的测序价格是一样的。 今天就分享到这啦,希望这些内容对大家有用!如果有什么问题或者要补充的,欢迎评论或者私信哦!
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然后将这些dna片段与载体连接,再转化到细菌中去,让宿主菌长成克隆
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图7分子克隆离不开质粒载体
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