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磷酸化最新娱乐体验_磷酸化和去磷酸化(2024年11月深度解析)

内容来源：麦吉窗影视所属栏目：话题更新日期：2024-11-28

磷酸化

生物化学考研每日一题：能量代谢顺序解析 𐟌Ÿ在禁食状态下，人体的能量代谢顺序是：糖原、脂肪、蛋白质。糖原和葡萄糖通过磷酸化进入糖酵解途径，生成丙酮酸，丙酮酸进一步氧化脱羧生成乙酰CoA，最终通过三羧酸循环（TCA）彻底氧化供能。 𐟌Ÿ脂肪酸在体内经过活化后转运入线粒体，进行𐧥Œ–，最终彻底氧化成乙酰CoA等产物，这些产物可以通过TCA或其他途径继续氧化供能。 𐟌Ÿ酮体包括𞟤𘁩…𘥒Œ乙酰乙酸，它们通过一系列代谢反应最终分解成乙酰CoA，进入TCA供能。丙酮可以转化为丙酮酸，进而转化为乙酰CoA进入TCA。 𐟌Ÿ蛋白质在转化为糖之前，首先水解成氨基酸。除亮氨酸外，其他氨基酸均可通过脱氨基作用生成相应的酮酸。丙氨酸、谷氨酸、天冬氨酸脱氨后分别转变为EMP中的丙酮酸和TCA中的酮戊二酸和草酰乙酸，进而氧化分解供能。 𐟌Ÿ如果长期不进食，体内分解代谢大于合成代谢，物质逐渐消耗，身体会逐渐消瘦。正常情况下，如果摄入蛋白质过多，多余的蛋白质也会作为能源物质分解利用。

生物化学精华𐟓Œ代谢篇 𐟓Œ糖酵解途径 (Glycolysis) 糖酵解是葡萄糖在细胞内分解为丙酮酸的过程，主要发生在缺氧条件下。 𐟓Œ三羧酸循环 (Krebs Cycle) 三羧酸循环是糖、脂肪和蛋白质在细胞内氧化分解的共同途径，产生ATP和NADH。 𐟓Œ磷酸戊糖途径 (PPP/Pentose Phosphate Pathway) 磷酸戊糖途径是葡萄糖氧化分解的另一条途径，主要产生NADPH和磷酸戊糖。 𐟓Œ糖异生 (Gluconeogenesis) 糖异生是指非糖物质转化为葡萄糖或糖原的过程，主要在肝脏中进行。 𐟓Œ乳酸循环 (Lactic Acid Cycle) 乳酸循环是指肌肉中的乳酸通过丙酮酸羧化酶转化为丙酮酸，再进入三羧酸循环的过程。 𐟓Œ底物水平磷酸化 (Substrate Phosphorylation) 底物水平磷酸化是指底物在酶的作用下直接生成磷酸化产物，释放能量。 𐟓Œ呼吸电子传递链 (Respiratory Electron-Transport Chain) 呼吸电子传递链是电子从底物传递到氧气的过程，产生ATP和NADH。 𐟓Œ氧化磷酸化 (Oxidative Phosphorylation) 氧化磷酸化是指电子传递链中的电子传递与ATP的合成相偶联的过程。 𐟓Œ化学渗透理论 (Chemiosnotic Theory) 化学渗透理论解释了质子泵如何通过跨膜质子浓度梯度驱动ATP的合成。 𐟓Œ解偶联剂 (Uncoupling Agent) 解偶联剂能够破坏质子泵与ATP合成之间的偶联，导致ATP的生成减少。 𐟓ŒP/O比 (P/O Ratio) P/O比是指每摩尔氧原子传递给底物时所消耗的磷酸基团的数量。 𐟓Œ高能化合物 (High Energy Compound) 高能化合物是指含有高能磷酸键的化合物，如ATP和GTP。 𐟓Œ光合磷酸化 (Photophosphorylation) 光合磷酸化是指光合作用中光能转化为ATP的过程。 𐟓Œ卡尔文循环 (Calvin Cycle) 卡尔文循环是光合作用中二氧化碳固定和还原的途径。 𐟓ŒC4途径 (C4 Pathway) C4途径是植物光合作用中的一种代谢途径，能够提高光能利用率。 𐟓ŒCAM途径 (Crassulacean Acid Metabolism Pathway) CAM途径是植物在干旱条件下的一种光合作用模式，能够减少水分蒸发。 𐟓ŒATP合成酶 (ATP Synthase) ATP合成酶是氧化磷酸化过程中ATP合成的关键酶。 𐟓Œ𐧥Œ– (Oxidation) 𐧥Œ–是指脂肪酸在细胞内氧化分解生成乙酰CoA的过程。 𐟓Œ酮体 (Ketone Body) 酮体是脂肪酸在肝脏中氧化分解的中间产物，主要包括乙酰乙酸、羟丁酸和丙酮。 𐟓Œ低密度脂蛋白 (LDL) 低密度脂蛋白是一种将胆固醇从肝脏运输到外周组织的脂蛋白。 𐟓Œ高密度脂蛋白 (HDL) 高密度脂蛋白是一种将胆固醇从外周组织运输回肝脏的脂蛋白。 𐟓Œ联合脱氨基作用 (Combined Deamination) 联合脱氨基作用是指氨基酸在体内同时进行脱氨和转氨基反应的过程。 𐟓Œ尿素循环 (Urea Cycle) 尿素循环是指氨在肝脏中转化为尿素的过程，主要发生在尿素循环酶的作用下。 𐟓Œ一碳单位 (One Carbon Unit) 一碳单位是指有机化合物中的一个碳原子，通常与维生素B12有关。

20条热门信号通路详解，科研必备！ MAPK信号转导通路是一种三级激酶模式，包括MAPK激酶激酶（MAPKKK）、MAPK激酶（MAPKK）和MAPK。这三种激酶依次激活，形成多级传导过程。 𐟓œ PI3K/Akt信号转导通路 PI3K（磷脂酰肌醇激酶）具有丝氨酸/苏氨酸（Ser/Thr）激酶活性，也具有磷脂酰肌醇激酶活性。它由一个调节亚基和一个催化亚基组成。调节亚基与靶蛋白结合，主要包括SH2和SH3结构域，通常称为p85。催化亚基有4种，即p110€p110€p110’Œp110€‚P110亚基通过与p85亚基结合，将底物Ptdlns(4,5)P2（PIP2，磷脂酰肌醇2磷酸）转化为PtdIns(3,4,5)P3（PIP3，磷脂酰肌醇3磷酸）。 𐟔 NF-KB信号转导通路非经典NF-KB信号通路的传导涉及配体（如CD40L、BAFF、LT-B）与受体（如LTBR、BAFFR、CD40）的结合。TRAFS复合物和泛素化介导激酶NIK的活化，导致IKa磷酸化。IKa活化后，磷酸化p100，使其降解转变为p52。p52/RelB复合物转运至细胞核调控转录，输出信号。 𐟓ˆ Wnt-Catenin Signaling Wnt-Catenin信号通路涉及Wnt蛋白与受体Frizzled的结合，导致Catenin的稳定和核内积累。Catenin与TCF/LEF转录因子结合，激活下游基因表达。 𐟓‰ Wnt-Noncanonical Signaling Pathways Wnt-Noncanonical信号通路包括Wnt蛋白与受体Frizzled的结合，但不涉及Catenin的稳定和核内积累。这些通路通过JNK、PKC等途径激活下游基因表达。 𐟔 Tol-ike Receptors (TLRs) Interactive Pathway TLR（Toll样受体）信号通路涉及TLR与病原体相关分子模式（PAMPs）的结合，导致NF-KB和MAPK的活化。这些通路在免疫应答和炎症反应中发挥重要作用。 𐟓Š TNF superfamily_Wallchart 2013 TNF超家族信号通路涉及TNF蛋白与受体TNFR的结合，导致NF-KB和MAPK的活化。这些通路在细胞凋亡、免疫应答和炎症反应中发挥重要作用。 𐟔 TGF Pathway Interactome TGF（转化生长因子）信号通路涉及TGF蛋白与受体TGFBR的结合，导致SMAD蛋白的磷酸化和核内积累。SMAD蛋白与转录因子结合，激活下游基因表达。 𐟓ˆ Ras Signaling Ras信号通路涉及Ras蛋白与GTP酶激活蛋白（GAP）的结合，导致Ras蛋白的活化。活化的Ras蛋白与下游效应分子结合，激活多种信号通路。 𐟓‰ PTEN Signaling Pathways PTEN（磷酸酶张力蛋白同源物）信号通路涉及PTEN与PI3K的相互作用，导致PI3K活性的抑制。PTEN通过去磷酸化PI3K的产物PIP3，减少下游信号通路的激活。 𐟔 P3K-Akt Interactive Pathway P3K-Akt信号通路涉及PI3K与Akt的结合，导致Akt的磷酸化和激活。活化的Akt通过多种途径调节细胞生长、存活和代谢。 𐟓Š p53 Signaling Pathway p53信号通路涉及p53蛋白的磷酸化和泛素化修饰，导致p53的稳定性和核内积累。p53蛋白与转录因子结合，激活下游基因表达，参与细胞周期调控和凋亡诱导。

糖酵解过程及生理意义详解糖酵解是一种在酶的催化下，将葡萄糖、淀粉等六碳糖氧化分解成丙酮酸并释放能量的过程。这个化学过程可以分为几个主要阶段：己糖的活化：己糖在ATP的作用下逐步转化为果糖-1，6-二磷酸，为后续的降解打下基础。果糖-1，6-二磷酸的裂解：果糖-1，6-二磷酸在全缩酶的催化下裂解为两分子的丙糖磷酸及甘油醛3磷酸和二氢丙酮磷酸。这两者在磷酸丙糖异构酶的催化下可以互相转化。丙糖磷酸的氧化和ATP的生成：甘油醛-3-磷酸在磷酸甘油醛脱氢酶的催化下与无机磷酸反应，形成甘油酸-1，3-二磷酸，同时发生底物的脱氢氧化。NAD+被还原为NADH。随后，磷酸甘油酸激酶将甘油酸的高能磷酸键转移给ADP，形成一分子ATP，并生成甘油酸-3-磷酸。丙酮酸的生成：甘油酸-3-磷酸在磷酸甘油酸变位酶的作用下转化为甘油酸-2-磷酸。在稀醇化酶的作用下，甘油酸-2-磷酸脱去一分子水，形成磷酸烯醇式丙酮酸。丙酮酸激酶将磷酸转移给ADP，又形成一分子ATP。磷酸烯醇式丙酮酸最终转变为丙酮酸。在整个糖酵解过程中，葡萄糖经磷酸化裂解为两分子丙糖，经过氧化形成两分子NADH，并产生四个ATP。但由于最初磷酸化过程中消耗了两个ATP，因此净得两个ATP。糖酵解的生理意义：普遍存在于动物、植物和微生物中，是有氧呼吸和无氧呼吸的共同途径。中间产物和最终产物丙酮酸的化学性质非常活跃，在不同外界条件和生理状态下，可以通过各种代谢途径产生不同的生理反应。释放能量供生物体使用。对厌氧生物来说，糖酵解是糖分解和获取能量的主要形式。途径中除了己糖激酶、果糖磷酸激酶和丙酮酸激酶所催化的反应是不可逆的以外，其余反应均可逆转，这为糖异生作用提供了基本途径。

abmart抗体，实验神器！最近用了abmart的MAPK通路抗体，真心觉得不错，比CST的还要好用呢！分享几款我常用的抗体：经典一抗 - ERK1/2 Antibody（货号T40071）这个抗体特别好用，信号特别强，做实验的时候省了不少心。经典一抗 - Phospho-Erk1(T202/Y204)+Erk2(T185/Y187) Antibody（货号T40072）这个抗体能同时检测Erk1和Erk2的磷酸化，效率超高。经典一抗 - p38 MAPK Antibody（货号T55600） p38的抗体，信号清晰，背景干净，推荐！经典一抗 - JNK1/2/3 Antibody（货号T40073） JNK的抗体，特异性好，适合各种实验需求。经典一抗 - p-JNK1/2/3 (Thr183+Tyr185) pAb（货号T40074）这个磷酸化特异性的JNK抗体，效果非常棒，强烈推荐！经典一抗 - Phospho-p38 MAPK (Thr180/Tyr182) Antibody（货号T90391） p38磷酸化特异性的抗体，信号非常清晰，背景干净。总的来说，abmart的这些抗体真的让我省了不少心，实验结果也很满意。如果你也在找好的MAPK通路抗体，不妨试试这些吧！𐟒ꀀ

AKT磷酸化TRPML1的Ser343位点增加其稳定性第一步，筛选调控TRPML的上游分子为了确定癌细胞中调节溶酶体胞吐的上游途径，选了一个含有644种化合物的激酶抑制剂文库进行筛选（工作量有点大），结果发现：具有抑制功能的小分子大部分是PI3K和AKT抑制剂，其中AKT抑制剂对溶酶体胞吐的抑制作用最强，活化AKT的表达则增强癌细胞中溶酶体的胞吐（图1a-c）。第二步，确定AKT是TRPML的上游分子过表达AKT1增加TRPML1的蛋白丰度（图1e），敲减或抑制AKT则降低TRPML1的蛋白丰度（图1f）；不影响TRPML1的mRNA表达（图1d）。表明AKT通过增加TRPML1蛋白丰度来增强溶酶体胞吐。第三步，AKT与TRPML相互作用，磷酸化TRPML 内源性Co-IP分析显示，TRPML1与AKT相互作用（图1g）。另外，体外磷酸化实验发现，TRPML1在活性AKT激酶存在下很容易被磷酸化，而加入磷酸酶(PPase)时，没有检测到这种磷酸化（图1h）。表明AKT可能通过调节其磷酸化来稳定TRPML1。第四步，AKT磷酸化TRPML-S343位点使用Scansite程序预测TRPML1中特定蛋白激酶的可能磷酸化位点，结合AKT保守修饰位点(RXRXXS/T，其中X为任意氨基酸)特征，推测TRPML1-S343可能是潜在的修饰位点（图1i）。结构预测该位点位于TRPML1的细胞质侧（图1j），进一步暗示TRPML1-S343可能是AKT的靶向修饰位点。体外激酶实验显示，活性AKT激酶增加TRPML1-WT蛋白丝氨酸/苏氨酸磷酸化量，但这种磷酸化在失活突变体TRPML1-S343A蛋白中被阻断【备注：磷酸化修饰，色氨酸（S）失活突变丙氨酸（A）；活化突变天冬氨酸（D）】（图1k）。表明AKT可以直接磷酸化TRPML1的Ser343位点。第五步，AKT通过磷酸化TRPML1的Ser343位点来稳定TRPML1 蛋白质合成抑制剂环己亚胺(CHX)处理下，AKT抑制剂或AKT敲低加速了TRPML1的降解（图1l）。另外，在CHX处理后，磷酸化激活突变TRPML1-S343D蛋白增强了TRPML1的蛋白稳定性，而磷酸化失活突变TRPML1-S343A蛋白加速了TRPML1的降解（图1m）。表明AKT可以通过直接磷酸化和稳定TRPML1来促进溶酶体胞吐。 #科研#⠂ #磷酸化#⠂ #coip实验#

𐟔岰条热门信号通路全解析𐟔劰Ÿ“Š MAPK信号转导通路 MAPK通路是一种三级激酶模式，包括MAPK激酶激酶(MAPKKK)、MAPK激酶(MAPKK)和MAPK。这三种激酶能依次激活，形成从细胞膜到细胞核的多级传导过程。 𐟒Š PI3K/Akt信号转导通路 PI3K具有丝氨酸/苏氨酸(Ser/Thr)激酶的活性，也具有磷脂酰肌醇激酶的活性。它由一个调节亚基和一个催化亚基组成，调节亚基与靶蛋白结合，主要包括SH2和SH3结构域。 𐟔’ NF-KB信号转导通路非经典NF-KB信号通路的传导涉及配体如CD40L、BAFF和LT-B，以及受体如LTBR、BAFFR和CD40。通过TRAFS复合物和泛素化介导激酶NIK的活化，磷酸化下游IKa，最终调控转录。 𐟓ˆ Wnt-Catenin Signaling Wnt信号通路分为经典和非经典两种，其中经典通路涉及Catenin的调控。 𐟔젔ol-like Receptors (TLRs) Interactive Pathway TLR通路在免疫系统中起重要作用，通过识别病原微生物的保守分子模式来激活免疫反应。 𐟌𑠔GF Pathway Interactome TGF通路涉及多种细胞过程，包括细胞生长、分化和凋亡，在多种疾病中发挥重要作用。 𐟌€ Ras Signaling Ras信号通路在细胞生长和分化中起关键作用，通过调节多种下游效应分子来影响细胞行为。 𐟔’ PTEN Signaling Pathways PTEN通路通过磷酸酶活性来调节细胞生长和凋亡，是肿瘤发生中的重要调控因子。 𐟌🠐3K-Akt Signaling Interactive Pathway P3K-Akt通路在细胞代谢和增殖中起重要作用，通过磷酸化下游效应分子来影响细胞功能。 𐟔堰53 Signaling Pathway p53通路在细胞周期调控和凋亡中起关键作用，通过调节多种下游效应分子来影响细胞命运。 𐟓Š 其他信号通路包括Wnt-Noncanonical Signaling Pathways、TNF superfamily、TGF Pathway Interactome、Ras Signaling、PTEN Signaling Pathways、P3K-Akt Signaling Interactive Pathway和p53 Signaling Pathway等。这些信号通路在细胞内广泛分布，通过多种机制调节细胞生长、分化和凋亡，是生命活动中的重要组成部分。

𐟓š SCI写作必备句型，助你轻松发表！ 𐟌𑠰lay a central role in: 在...中起核心作用 𐟓‹ responsible for: 负责... 𐟔 has been extensively studied: 已被广泛研究 𐟌Œ remain largely unknown: 仍然是未知的 𐟔„ resemble: 与...相似 𐟒꠳ynergistically: 协同地 𐟓Š consistent with: 与...一致 ⚡ be more rapidly degraded: 降解的更快 𐟓ˆ transcriptomic analyses: 转录组学分析这些句型来源于华中农业大学在PNAS上发表的关于“拟南芥PP6磷酸酶脱磷酸化PIF蛋白以抑制光形态发生”的文章。

NGS文库构建中的关键酶：一文全解 𐟔슎GS测序流程大致分为四个步骤：样本制备、文库构建、上机测序和数据分析。在实验过程中，酶的作用至关重要。今天，我们来聊聊文库构建中的关键酶。 DNA片段化：选择合适的酶很重要 ✂️ 首先，我们需要将大片段的基因组DNA片段化为小片段。目前市场上的测序仪测序长度通常在150-500bp之间，所以我们需要用机械打断或酶切打断的方法来实现。机械打断虽然有效，但操作复杂且损耗大。相比之下，酶切法成本更低，操作更简便。常用的片段化酶有两种：一种是基于转座子原理的Tn5转座酶，另一种是核酸内切酶的混合酶。这两种酶都能有效地将DNA片段化，为后续步骤打下基础。末端修复与加“A”：精细操作的关键 𐟔犊打断后的DNA会产生5'/3'黏性末端和平末端。在使用TA连接的方式进行接头连接时，DNA片段还需要5'端磷酸化和在3'端加“A”，才能与带“T”黏性末端的接头互补配对。这个过程由T4 DNA聚合酶、T4多聚核苷酸激酶和Taq DNA聚合酶共同完成。 T4 DNA聚合酶：多功能酶的妙用 𐟌 T4 DNA聚合酶具有5'→3'DNA聚合酶活性，可以补平5'突出末端；同时，它也具有3'→5'外切酶活性，能够切平3'突出末端，将含黏性末端的DNA片段转变为平末端DNA。 T4多聚核苷酸激酶：磷酸基团的转移者 𐟚€ 由于人工合成的PCR引物、接头等5'端通常都是羟基基团而不是磷酸基团，因此需要T4多聚核苷酸激酶在ATP存在时催化ATP的磷酸基团转移到寡核苷酸链的5'端羟基末端上，为下一步连接接头做准备。 Taq DNA聚合酶：添加核苷酸“A”的能手 𐟏𗯸 Taq DNA聚合酶具有5'→3'聚合酶活性，可以从5'→3'方向合成DNA，同时它具有的脱氧核苷酸转移酶活性可以在PCR产物的3'末端添加一个核苷酸“A”。总结 𐟓 在NGS文库构建过程中，选择合适的酶至关重要。通过上述步骤，我们可以将大片段的基因组DNA片段化为小片段，并加上通用接头序列，通过PCR扩增获取足够多的文库核酸分子，为后续的上机测序和数据分析打下基础。

TTSX每日计划：7月29日详细安排 𐟍Ž 口诀时间： “吃苹果的天天真性感”：苹果酸-天冬氨酸穿梭（肝、心、肾） “CoQ、Cytc 不属于任何复合体”： Cytc：水溶性（与线粒体内膜结合疏松），“水溶C100” 辅酶 Q/CoQ/泛醌：脂溶性强（在线粒体内膜自由扩散），Q 循环是 CoQ 向复合体III的传递机制，“3Q” “一堆动物”：鱼藤酮、粉蝶霉素、异戊巴比妥 “萎缩”：萎锈灵 “三联抗菌”：黏噻唑菌醇、抗霉素 “黑寡妇”：ATP 合酶抑制剂，寡霉素（结合 F0 的 c 亚基）、二环己基碳二亚胺 DCCD 𐟓… 今日计划：直播：晚上7:00开始，讲解生化的“磷酸戊糖途径、糖原、糖异生”、“脂蛋白”。相关填空式讲义㗲、思维导图㗲在中午12:00左右发布。直播前需先浏览一遍讲义。直播时认真理顺考点、培养感性认识，不要在直播时强迫自己背。直播后可以及时看一遍讲义和思维导图。复习：昨日内容。氧化磷酸化的思维导图需听录播。做题：完成生化“生物氧化”的“全部年份”真题。做题前必须先认真复习，用知识点单纯做题，做题后以题带动我讲的知识点或教材复习，需回顾录播时要回到录播里，不要纠结，要带动复习。滚动复习：7.29-8.4期间，内科含诊断的“COPD”、“慢性肺心病”、“急性肺血栓栓塞”、“间质性肺疾病”。包括所有导图、讲义（含真题解析和专题串联板块）、2000-2023年真题（需再次重做）。讲义和导图需要倍速听录播。完成比完美更重要，时间精力不够则真题看2008-2023年，只听导图录播等，减量不减形式。 ⏳ 考研倒计时：还有 144天14时1607秒考研 2024/12/21周六(冬月廿一)

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