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三步带你了解生物信息学分析 生物信息学(Bioinformatics)这个单词是由生物学(Biology)、信息学(Information)和组学(Omics)三个单词组合而成的。生物信息学的主要任务是利用新的高通量分子生物技术来收集和分析大量的组学数据,从而在数据研究的基础上解决生物医学问题。 数据挖掘:从海量数据中找到有价值的信息 数据挖掘(Data Mining)可以帮助我们从大量的数据中找到有价值的信息,并将其转化为有意义的知识。数据挖掘也被翻译成数据探索和数据采矿。在数据库知识发现(Knowledge-Discovery in Databases,简称KDD)中,数据挖掘是指自动搜索隐藏在大量数据中的特殊关系和信息的过程。广义上讲,数据挖掘是从海量数据中提取知识的过程。 生信分析的常用软件:R语言 R是一种编程语言,也是一种统计算和绘图的环境,它汇集了许多函数,可以提供强大的功能。R语言的优势包括: 开源和可扩展的环境 编程语言简单有效 数据处理、清理和存储 统计与可视化 生信分析的常用操作系统:Linux 寸 Linux系统在1991年由托瓦兹(Linus Torvalds)编写而成,提供了完整的硬件控制和资源管理架构。Linux不仅免费使用,而且开发了许多版本(distributions)。Linux在个人电脑和大型主机上的表现也非常惊人。Linux系统在很多方面都比Windows具有优势,包括: 长期运行稳定性 只有一些生信软件有Linux版本 简化各种繁琐的命令操作(如Bash) 特别适用于构建各种服务器系统 通过这些工具和技术,生物信息学分析能够更好地理解和解决复杂的生物医学问题。
【“死亡经济学”:俄罗斯兵力源源不断的背后】 如果一名35岁的男子参战一年后阵亡,家人将从工资和死亡抚恤金中获得约1,450万卢布(约合15万美元)。这比作为平民工作到60岁所能获得的累计收入还要多。 “参战一年后阵亡,比一个男人继续活下去获得的钱更多,”这被称为“死亡经济学”(deathonomics)。
【Nature:科学家揭示为何唐氏综合征患儿患白血病风险较高?】唐氏综合征(down syndrome)会使得个体机体的血液学异常,比如红细胞数量和白血病细胞增加,这一过程在个体出生前就已经开始了,目前研究人员并不清楚其背后的分子机制。唐氏综合征患者往往面临着高风险的白血病,近日,一篇发表在国际杂志Nature上题为“Single-cell multi-omics map of human fetal blood in Down syndrome”的研究报告中,来自斯坦福大学等机构的科学家们通过研究识别出了唐氏综合征患者血细胞中的特定改变,从而揭示了为何其面临白血病的风险较高。网页链接
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