反向PCR前沿信息_反向pcr测定未知dna区域又为啥要先环化再扩增测序?不能直接测吗(2024年11月实时热点)
两款引物设计神器,轻松搞定! 引物设计是分子生物学实验的关键步骤,选择合适的软件可以大大提高工作效率。以下是两款简单易用的引物设计软件,帮助你轻松搞定引物设计。 砓napGene SnapGene是一款功能强大的引物设计软件,特别适合初学者。它支持同源重组引物设计,步骤如下: 载体线化:通过酶切或反向PCR方法将载体线性化。 同源臂碱基:根据酶切位点选择合适的同源臂长度,注意顶部链直接复制,底部链选择5端到3端的序列。 复制顶部链碱基:直接复制顶部链的碱基序列。 复制底部链碱基:复制底部链的碱基序列。 复制氨基酸:根据需要复制相应的氨基酸序列。 复制图谱:生成引物设计的图谱。 NCBI NCBI是另一款广受欢迎的引物设计软件,操作简单,功能全面。你可以根据自己的需求选择合适的引物设计方法,轻松完成引物设计。 这两款软件各有特色,大家可以根据自己的喜好和需求选择学习。当然,如果你想要更全面的功能,不妨两款都试试,毕竟小孩子才做选择,大人当然是全都要!
쳲-无缝克隆操作指南 젤升克隆效率并减少突变,推荐使用高保真PCR Mix来扩增DNA。同时,预线性化的质粒作为模板是更好的选择哦! 引物设计小技巧: - PCR引物的5'端,要包含与相邻片段同源的15-25nt序列,推荐18nt,确保扩增产物能与相邻片段形成重叠。 插入片段的引物设计如下: - 正向扩增引物:5'端是上游载体末端的正向同源序列+酶切位点(可选)+基因特异性正向扩增序列。 - 反向扩增引物:3'端是基因特异性反向扩增序列+酶切位点(可选)+下游载体末端的反向同源序列。 ᠨ𝓤𘎦入片段的用量建议: - 最适载体用量(ng)= 0.02 㗠载体碱基对数。 - 最适片段用量(ng)= 0.04 㗠片段碱基对数(单片段);0.02 㗠片段碱基对数(多片段)。 - 若插入片段太长,则建议增加载体用量。 - 若插入片段太短,则建议增加片段用量至5倍。 堤𝓧应步骤来啦: 1️⃣ 轻轻混匀各组分,避免气泡产生。 2️⃣ 将反应体系置于50℃,反应5-60分钟。 3️⃣ 反应后置于冰上冷却,然后进行转化或储存于-20℃。 ⏰ 反应时间小贴士: - 插入1-2个片段时,推荐5-10分钟。 - 插入3-5个片段时,推荐15-30分钟。 - 当载体骨架或插入片段总长超过特定值时,建议延长至30-60分钟。 ᠦ后,记得在50℃反应后进行瞬时离心,确保反应液收集至管底哦!
QuikChange法突变,详解! QuikChange法适用于点突变(或相邻多个位点突变)、基因删除、小片段基因插入或替换。虽然其他步骤相同,但引物设计略有差异。以下是详细原理和操作方法: 简要原理 QuikChange法相当于对整个质粒进行PCR(环P)。利用带有反向互补序列的引物,将整个质粒进行PCR扩增。PCR过程中,质粒形成环状,转化大肠杆菌后缺口被修补。 实验方法 ꊤ链质粒为模板进行PCR扩增(PCR退火温度根据引物确定,延伸时间根据整个质粒长度及DNA聚合酶确定)。模板量可以减少到1-5ng/50,循环数可减少至25-28个。 PCR条件示例 効5℃,5min,1循环 95℃,30s 60℃,30s 72℃,4min,25循环 72℃,10min,1循环 PCR后最好先跑胶确认有没有条带。虽然有很多人说PCR后没有条带也正常,转化依然可以长出菌落,但个人经验:如果无条带或者条带弥散,转化大概率不会长。 Dpn酶切 ꊦ饢产物用Dpn酶切去除甲基化的质粒模板。Dpn酶切条件示例: 10㗢uffer:2 DpnI:1 37℃孵育2小时。 转化与验证 슥 𖥈后的产物转化DH5a/Top10感受态细胞,进行菌落PCR和测序验证。 详细原理 스𒒄NA作为模板,在高保真聚合酶作用下,使用两条具有同源序列的引物引导DNA合成。两条引物内均含有预定突变位点,经过多轮热循环,双链质粒DNA的全长均以线性形式扩增。由于引物含有同源序列,最终产生DNA双链带交错缺口的突变质粒。 经过高保真酶扩增而得到的DNA产物具有缺口,DNA链的磷酸二酯键并未闭合,非闭合环形质粒同样也能被大肠杆菌细胞吸收,断裂的缺口可在质粒进入感受态细胞内后被修补。 甲基化修饰 ꊥ来的模版质粒来源于常规大肠杆菌,是经dam甲基化修饰的,对Dpnl敏感而被切开(Dpnl识别序列为甲基化的GATC,GATC在几乎各种质粒中都会出现,而且不止一次)。而体外合成的带突变序列的质粒由于没有甲基化而不被切开,因此在随后的转化中得以成功转化,即可得到突变质粒的克隆。 通过以上步骤,你就可以成功设计并操作QuikChange法突变引物啦!
쐃R引物设计全攻略✨ 引物,这段单链DNA或RNA,是PCR实验中的关键!好的引物设计,能让你的实验成功率大大提升哦! 引物设计,其实并不难,只要掌握几个基本原则: 1️⃣ 长度:18-30bp之间,常用18-27bp,别太长也别太短哦! 2️⃣ GC含量:40%-60%,最好高于50%,这样引物在退火时就能更稳定地结合。 3️⃣ Tm值:50-65℃,正反向引物的Tm值要相近,差异不能太大。 4️⃣ 特异性:引物只与目标序列结合,避免非特异性扩增。 련😦几点要注意,避免引物之间形成二聚体、发夹结构等,这些都可能影响PCR反应的成功。 ᠥ襼物设计软件有Primer Premier、Oligo等,设计完成后还可以用BLAST检查引物的特异性。 现在,你是不是对PCR引物设计有了更深的了解呢?快去试试吧!
战胜HPV:红卡治疗的奇迹之旅 ⥯V16阳性的低度病变,我们当地的医生建议直接进行锥切手术。然而,我并不想轻易放弃,于是前往齐鲁医院寻求更温和的治疗方案。医院主任推荐了激光联合红卡的治疗方法。 3月份,我接受了激光治疗。一个月后,我按照医生的建议去复查。由于HPV16是高危型中的高危型,我向主任询问了最佳的治疗方案。主任解释说,红卡没有副作用,转阴率高,但需要隔一天使用一次,共二十天。虽然上药过程很快,只需半个小时,但坚持使用四个月后复查,我终于等到了转阴的结果。那一刻,我激动得几乎要流泪 红卡,这种外用红色诺卡氏菌细胞壁骨架,通过PCR-反向斑点杂交法进行检测。HPV核酸检测是宫颈癌筛查的重要辅助手段。如果HPV阴性,建议一年后复诊;如果仍为阴性,复诊间隔可以延长至3-5年。对于HPV阳性者,建议进行细胞学检测。如果细胞学检测结果正常,每年跟踪随诊一次;如果结果异常,请咨询医生进行进一步的诊断与治疗。 HPV感染在育龄期妇女中较为常见,高危型HPV人群感染率约为20-30%。HPV感染分为暂时性和持续性感染。只有一小部分感染是持续性的,是否持续感染与感染型别、年龄、免疫功能等因素有关。高危型HPV的持续感染是引起宫颈癌和癌前病变的主要原因;而低危型HPV的感染能引起宫颈上皮低度病变和良性湿疣。 通过红卡治疗,我成功地逆转了HPV16阳性的低度病变,体验到了治疗的奇迹。
챐CR实验步骤全解析 奏性阶段导 将反应混合物加热至94℃,DNA双链间的氢键会断裂,形成单链DNA,为后续的合成提供模板。 退火阶段: 温度降至54-60℃,引物附着在模板DNA的互补序列上。这两个引物——正向和反向——将引导DNA的合成。 ꥻ𖤼𘩘𖦮 温度升高至72-80℃,Taq聚合酶将碱基固定到引物的3'末端,从5'延伸至3',合成新的DNA链。 PCR仪操作流程: 1️⃣ 使用PCR仪加热样品,使DNA变性并分离成单链。 2️⃣ 利用“Taq聚合酶”以旧链为模板创建新链。 3️⃣ 原始DNA被复制,每个新分子包含一条旧链和一条新链。 4️⃣ 变性和新DNA合成的循环重复30-40次,产生大量DNA副本。 5️⃣ 整个PCR过程自动化,由热循环仪控制温度变化,实现DNA的变性和合成。 通过这些步骤,我们能够高效地复制和检测DNA,为科研提供有力支持!ꢜ耀
师姐的实验记录本:移液操作的关键技巧 最近翻了翻师姐的实验记录本,真是大开眼界!原来不同的实验,移液的操作要点差别这么大。细胞培养、PCR实验、ELISA实验,每种实验都有自己独特的移液技巧。 细胞培养:均匀、快速接种,注意剪切力 슥觻胞培养中,移液的关键是均匀和快速。接种细胞时,要确保每块培养皿的细胞数量一致,这样才能保证实验结果的可靠性。同时,也要注意避免产生过多的剪切力,以免损伤细胞。 PCR实验:预润洗、吸头吸附力、正向移液与反向移液 슐CR实验对移液的要求特别高。首先,要进行预润洗,确保吸头内没有杂质。其次,吸头的吸附力要强,这样才能避免移液时液体泄漏。最后,正向移液和反向移液的操作要熟练,这样才能保证PCR反应的准确性。 ELISA实验:精确加样、温度控制 슥腌ISA实验中,精确加样是关键。每一步都要严格按照实验要求进行,确保样品的量准确无误。同时,温度控制也非常重要,过高的温度会影响酶的活性,从而影响实验结果。 移液器常见问题及解决方法 ️ 移液器滴液:建议采用反向移液的方法,或者使用外置活塞原理的移液器。 移液器漏吸:使用同一品牌的移液器和吸头匹配,这样可以减少漏吸的发生。 移液器吸不准:要注意吸液时保持移液器垂直,这样可以避免吸不准的问题。 移液时产生气泡:可以采用反向移液技术:吸取液体时,将排液按钮按至第二档,吸头浸入液面至少1mm,吸取液体。 真是后悔没有早点看到师姐的记录本,这些小技巧真的让我受益匪浅!希望大家也能从中学到一些有用的知识,提升自己的实验技能。
如何轻松实现无缝克隆? 젤襅隆过程中减少突变的引入,推荐使用高保真PCR Mix进行扩增,并使用预线性化的质粒作为模板,这样可以减少环状质粒模板残留对克隆阳性率的影响。 引物设计原则: PCR引物的5'端必须包含与其相邻片段(插入片段或载体)末端同源的15~25nt(推荐18nt)序列,以确保扩增产物的5'端和3'端分别与相邻片段形成重叠序列。 砦入片段的引物设计: 正向扩增引物:5'—上游载体末端正向同源序列+酶切位点(可选)+基因特异性正向扩增序列—3’ 反向扩增引物:3‘—基因特异性反向扩增序列+酶切位点(可选)+下游载体末端反向同源序列—5’ 砨𝓤𘎦入片段、插入片段与片段连接处引物、载体反向扩增引物的设计: 最适载体用量(ng)= 0.02 㗠载体碱基对数,即0.03 pmol(单片段、多片段适用) 最适片段用量(ng)= 0.04 㗠片段碱基对数(单片段);最适片段用量(ng)= 0.02 㗠片段碱基对数(多片段) 单片段重组反应,若单个插入片段的长度大于载体,则应将载体与插入片段的计算公式互换 单片段重组反应,若单个插入片段的长度小于200bp,则插入片段应使用5倍的用量 多片段重组反应,各个插入片段的用量应不少于10ng,使用上述公式计算最适使用量低于此值时,直接使用10ng 若按上述公式计算出的线性化载体用量低于50ng或高于200ng,建议按50ng或200ng用量使用 线性化载体过长,插入片段过长或片段数过多,克隆阳性率均会降低。 ꠤ𝓧应: 配制完成后,用移液器轻轻吸打混匀各组分,避免产生气泡,切勿涡旋。 将反应体系置于50℃,反应5~60min。 将反应液离心管置于冰上冷却,之后进行转化或者储存于-20℃。 推荐使用PCR仪等温控精准的仪器进行反应,反应时间不足或太长克隆效率均会降低。 插入1~2个片段时,推荐反应时间为5~15min;插入3~5个片段时,推荐反应时间为15~30min。 当载体骨架在10kb以上或插入片段总长在4kb以上时,推荐延长反应时间至30~60min。 建议在50℃反应完成后进行瞬时离心,将反应液收集至管底。 -20℃储存的重组产物,建议1周内使用完毕。
北京飞多伦多:入境隔离全攻略 终于成功“反向跑毒”啦!这次分享一下从北京飞多伦多的入境准备材料和隔离酒店的全攻略,希望对大家有帮助。 入境准备材料 72小时内的核酸检测报告(中英文对照):报告上要有姓名、出生年月日、测试时间、检测机构名字和地址、检测方法(PCR或LAMP)以及检测结果。我是在济南做的检测,选择了迪安检测,费用150RMB,可以加出生日期和护照号码。早上9点多做的检测,下午3:30左右就出结果了,当天一定出结果哦!出了报告后,一定要仔细检查所有信息。我的出生日期一开始被工作人员搞错了,幸好赶在他们下班前修正过来了! Book酒店:现在可以直接在网上预订,不需要打电话,方便很多。记得留好Confirmation。 ArriveCan Receipt:提前下载ArriveCan app,按照步骤填写,拿到一个Code,可以截屏保存,也可以登录App查看。 注册SwitchHealth账号:可以提前扫二维码注册SwitchHealth账号,用于落地加拿大后的核酸检测。 PR和公民:入境时只需带好以上资料和PR卡以及护照。学签和工签的小伙伴需要上官网查一下具体要携带的资料。 出入境流程✈️ 我乘坐的是海航HU7975。先托运行李,检查所有资料,确保可以登机。超过重量的行李收费580RMB。然后会给你发一张表格,可以在出海关时旁边的小桌子上填写。之后过完安检就可以候机了。⚠️我随身携带的小瓶75%酒精凝露和湿巾都被没收了,不让带上飞机。 落地加拿大后,入海关前要在机器上自动申报。之后海关检查资料,入关,取行李。取完行李会先让你去拿自己的检测试剂瓶等,这里需要提前注册Switch Health,给工作人员报电话号码就可以了。然后再往前走去小隔间做检测,左右两边鼻子各转15秒,虽然不深但时间太久了,太煎熬了!之后流程结束,就可以去酒店啦! 隔离酒店芊我选择了最方便的Sheraton Gateway。做完检测电梯上2楼,走到Currency Exchange附近的电梯上3楼,按照路标走就找到啦。超级方便!可以一直推着小推车。酒店房间够宽敞,卫生感觉做得也可以。我用消毒酒精重新自己擦了一遍以防万一。第一次感受国际机场空空如也,什么都不用排队。在下飞机前可以穿好防护服,愿大家顺利平安落地加拿大! 希望这些信息对大家有帮助,祝大家旅途愉快!
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这种使用可能会令人困惑,因为 rt
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新冠疫情使得"核酸检测"家喻户晓,pcr检测作为金标准承担了无限重任
反向pcr扩增获得a基因片段和c基因片段分别位于产物两端的基因片段
5)反应产物转化,涂板;4)进行重组反应;3)插入片段pcr扩增;2)插入片段
图5 pcr扩增与荧光信号的收集(探针法)随着模板扩增,特异性的dna数量
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