gapdh前沿信息_gapdh分子量(2024年11月实时热点)
科研日记:小鼠皮肤蛋白提取失败原因大揭秘 快三个月没跑WB了,结果一出来就给我这么大的“惊喜”,各种问题层出不穷,真是笑死我了。 样本来源:C57小鼠皮肤(1%SDS裂解,默克蛋白酶抑制剂,磷酸化酶抑制剂) 电泳参数:金斯瑞的预制胶,电泳80v 10min,120v 60min,转膜湿转250mA 60min 抗体比例:5%BSA封闭2小时,一抗GAPDH过夜(abcam 1:10000),二抗羊抗兔1小时(三鹰 1:10000),洗膜10分钟X3 样本是昨天提取的,除了转膜液,其他都是新配的。所有问题都集中在一张膜上,真是“教科书”级别的失败案例啊。 朋友们,快来讨论下可能的原因吧!
内参是什么意思 在Western Blot实验中,内参可是个关键角色,它就像是个“参照物”,用来标准化蛋白质表达水平。内参蛋白通常是在细胞中普遍表达且表达水平相对稳定的蛋白质,这样它的表达就不会被实验条件或者处理影响。我们做Western Blot,除了想知道目的蛋白在细胞或组织中是否表达,更关键的是要知道它表达量的高低。而内参就是来帮我们调整上样量的,让目标蛋白的信号有个参照。 内参蛋白的选择:关键因素 表达水平 内参蛋白在实验样本中应该普遍表达,且表达水平要稳定。通常我们会选择表达量较高的内参蛋白,这样在Western Blot中才能检测到明显的条带。比如,GAPDH是个不错的选择,因为它是个代谢类蛋白,在活组织中的表达比较恒定。而Actin和Tubulin是结构蛋白,不同组织的细胞结构会有差异,所以选择时要慎重。 分子量 内参蛋白的分子量要和目的蛋白有明显差异,这样才能在Western Blot中区分开。通常我们会选择分子量较大或较小的内参蛋白,以避免与目的蛋白的分子量重叠。一般建议内参与要检测的蛋白分子量最好相差5kDa以上。 物种来源 内参蛋白的物种来源要和实验样本一致,以避免种属间的差异。如果实验样本来自不同的物种,可以选择在多个物种中表达相对稳定的内参蛋白。 细胞类型和组织类型 劥 参蛋白的表达水平可能因细胞类型和组织类型而异。因此,在选择内参蛋白时,要考虑实验样本的细胞类型和组织类型,选择在相应细胞类型和组织类型中表达相对稳定的内参蛋白。 实验条件 某些实验条件可能会影响内参蛋白的表达水平。例如,缺氧或者诱导糖尿病等处理时,GAPDH的表达会增高,所以不能用来做内参。因此,在选择内参蛋白时,要考虑实验条件对其表达水平的影响。 小结 选择合适的内参蛋白可是Western Blot实验的关键一步,选对了才能让你的数据更准确、更可靠。希望这些小贴士能帮到你,让你的实验更加顺利!ꀀ
内参选择 在进行Western blot实验时,选择合适的内参至关重要。以下是选择内参时需要考虑的几个关键因素: 蛋白表达丰度:内参应在样本中稳定表达,且表达量相对较高,以确保能够有效地检测到内参信号。 分子量:内参的分子量应与目标蛋白的分子量有明显差异,以便在电泳分离时能够分开。 细胞类型和组织特异性:根据实验样本类型,选择适合的内参。例如,actin常用于哺乳动物细胞,而Tubulin则更适合检测细胞骨架蛋白。 推荐使用一些常见的内参,如actin、GAPDH和HSP90。这些内参在大多数细胞类型中都有稳定表达,且分子量适中,容易检测。 在选择内参时,还需要注意一些实验细节。比如,确保内参和目标蛋白的抗体不相互干扰,并且在实验中正确地设置对照组,以验证内参的表达是否稳定。
雅酶胶过期,WB实验告急! 𑤻天才发现,我的雅酶10%胶竟然过期两年了!梀♀️ 젨🛨ጤB实验,电泳条件是80v30min和120v55min,转膜时用了12v40min,结果发现条带都跑到棉片的背面了,看来转膜时间太长了。 担心再次剪坏条带,我决定尝试同时敷一抗和内参。 ꠤ褺ERK1/2和GAPDH抗体,幸运的是没有出现双条带,但条带的量并不多。 骨组织裂解液使用了60mg+200ul,其中加入了磷酸酶抑制剂和蛋白酶抑制剂。 有没有小伙伴能给我一些指导呢?我的实验好像出了点问题。
内参不齐 Western Blot实验中,调整内参是关键的一步。以下是一些实用的技巧,帮助你快速且稳定地调整内参: 选择合适的内参:可以查阅文献、遵循师门传统或通过通跑测试来选择合适的内参,例如GAPDH、Tublin或beta-actin等。 BCA法测定组织蛋白浓度:虽然有时候测完也不齐,但在测完的基础上调整更为方便。 细胞铺板均匀:细胞不需要测BCA,但需要保证铺的板细胞均匀,这样上样量才能更准确。 统一浓度上样:先统一浓度上样,再根据发光结果进行相应调整。浓的少加,淡的多加,这主要靠经验。 确保电泳、转膜、封闭无误:在调整上样量之前,必须保证电泳、转膜和封闭没有问题,这样调整才能更准确。 通过这些步骤,你可以更有效地调整内参,使Western Blot实验更加准确和可靠。
𑠥騮᥅覔导从理论到实践! 引物设计的基本原则 选择目的基因的共有外显子区域进行设计。 引物长度建议在20到25bp之间,GC含量保持在40%到60%,Tm值最好在60℃左右。 设计引物时,尽量跨越外显子,上下游引物可以位于不同的外显子上。 引物的self complementarity和self 3' complementarity相加值应不超过8,单个值不超过5。 扩增产物长度建议在80到300bp之间,最佳为80到150bp。 避免设计含有4个或以上相同碱基(如AAAA、TTTT、GGGG、CCCC)的引物,以及避免明显的二级结构。 设计流程 寸 使用NCBI在线设计工具: 进入NCBI网站,搜索目的基因(如GAPDH)。 查看详细信息,找到共有外显子区域。 选择转录本信息,查看外显子位置。 进入引物设计页面,填写相关信息。 设置引物参数,如PCR产物大小、跨越外显子等。 点击“Get Primers”获取引物序列。 结果解读 在Graphical view of primer pairs部分查看每对引物跨越外显子的情况。 在Detailed primer reports部分查看引物质量和匹配情况。 通过以上步骤,你就可以轻松完成引物设计啦!
ABmart抗体:科研实验的得力助手 ABmart的抗体真的是国货中的佼佼者,用过一次你就会爱上它。它的条带特别清晰,曝光效果极佳。我使用的是ABmart提供的抗体试用装,几乎所有的WB实验都用的是ABmart的抗体。以下是我跑WB实验的结果,LC3和内参GAPDH的条带都非常清晰。 LC3抗体货号T55992,GAPDH抗体货号M20006。跑LC3蛋白的实验条件是:12%的胶,先60V跑30分钟,然后120V跑80分钟。转膜使用的是伯乐半干转,15分钟。封闭用的是5%脱脂牛奶,封闭时间为1小时。一抗在4度下孵育过夜,二抗用1:10000的比例,室温孵育1小时。 ABmart的抗体真的是科研实验的好帮手,强烈推荐给大家!
跑内参全双条带解析 襮验中,你是否遇到过跑内参全双条带的情况?这确实让人头疼。㠊 首先,让我们回顾一下实验步骤。在孵育gapdh时,原本分子量应是36kb,却在15kb处显影。𗢀♂️ 裁掉15kb以下后重新显影,能看到36kb的条带,但问题依旧存在。 ᦍ⤺一抗、封闭液和二抗后,结果仍然一样。而且,不管是gapdh还是b-actin,杂带都相当多,整张膜上显示出两个较黑的条带,距离也不远。 这究竟是不是样本的问题呢?其实,提完蛋白后不到一个礼拜,煮蛋白变性后放置在-20℃,这是常规操作。而且,用同一批样本也曾做出过整齐的内参。𗢀♀️ ᩂ㤹,究竟是什么原因导致了全双条带的现象呢?这可能需要我们从实验的各个环节去仔细排查,包括实验设计、操作步骤、试剂质量等。 ꥸ望这些信息能对你有所帮助!如果你有任何疑问或需要进一步的建议,随时告诉我哦!
WB内参选择指南:灵活运用,事半功倍 在进行蛋白质印迹(Western Blot)实验时,选择合适的内参至关重要。内参是实验中的“稳定分子”,用于标准化目标蛋白的相对表达量。以下是不同实验条件下内参选择的建议: 细胞骨架相关蛋白:如果研究的是与细胞骨架相关的蛋白,如肌动蛋白(Actin),那么肌动蛋白(actin)可能不是最佳选择,因为它在细胞骨架重组时可能会受到影响。可以考虑使用甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)或线粒体蛋白作为内参。 细胞分裂与凋亡相关蛋白:对于研究细胞分裂或凋亡相关蛋白的实验,选择与细胞周期相关的内参,如cyclin B或Mcl-1,可能更为合适。 诱导后或修饰型蛋白:在进行诱导处理或检测磷酸化、乙酰化等修饰型蛋白时,建议选择结构蛋白如肌动蛋白(actin)和微管蛋白(tubulin)作为内参。因为GAPDH是代谢类蛋白,其表达量可能会受到诱导处理的影响。 分泌型样本:在检测血浆、乳汁、组织液等分泌样本时,由于这些样本没有完整的细胞结构,可以选择分泌型蛋白如转铁蛋白(Transferrin)作为内参。 抗癌与真菌药物:在使用抗癌和真菌药物时,由于tubulin的表达可能会受到影响,因此不适合作为内参。 多组织多细胞样本:在进行多组织多细胞样本对比时,建议选择GAPDH作为内参。因为GAPDH是代谢类蛋白,在活组织中的表达较为恒定,而肌动蛋白(actin)和微管蛋白(tubulin)等结构蛋白在不同组织的表达可能会有差异。 细胞核内参:PCNA是细胞核的内参蛋白,在DNA S期表达,因此对于非增殖细胞不推荐使用。 通过灵活运用这些内参选择建议,可以提高实验的准确性和可靠性,让你的研究更加深入和全面。
HIF指标搞定!abmart助力 折腾了好久,终于把缺氧指标之一的HIF1定了,真是感谢abmart的救命之恩! 首先,我查了一下资料,发现缺氧指标在常氧下几分钟就降解了,所以我在乏氧箱里提蛋白。因为乏氧箱不太好操作,我就用预冷的PBS洗了一遍,然后加入含有磷酸酶抑制剂和蛋白酶抑制剂的RIPA裂解液,刮到EP管里,接下来就是正常的提蛋白步骤了。 缺氧的情况下,好像不能用GAPDH做内参,所以我用了ACTIN内参,之前也试过TUBULIN内参,效果也不错。 HIF指标是用7.5%的胶跑的,电泳150V 60分钟,转膜是免冰浴400mA 45分钟,用的是成品无蛋白封闭液,封闭半小时,一抗4℃过夜,二抗室温1小时。还是挺顺利的,跑了两次就搞定了。感觉提蛋白这一步很重要,避免降解,抗体也很关键,有些抗体杂带太多,真是让人头疼。 Bcl-2我用的是12%的胶,电泳和转膜参数同上。一开始用0.2的膜,后来发现0.45的也很OK。有时候WB真是个玄学[捂脸R]。 样品跑了两次后,感觉还是需要涡旋一下再离心,取上清来做WB比较好。中间有几次突然内参就不齐了,真是当头一棒[失望R]。 我要跑的指标比较多(abmart的试用装真是救大命了[赞R]),有些蛋白分子量太接近,整膜要跑两张。为了避免混乱,我用蓝色圆珠笔在左上角写编号,还可以区分正反面。经过马克笔、铅笔、圆珠笔的实验,我发现圆珠笔最好用,强推! 预祝各位道友SCI顺利accept!![得意R][得意R][得意R]
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