qtl定位前沿信息_qtl定位是什么(2024年11月实时热点)
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肠道抗炎药物与精神障碍的神秘关系揭秘! 今年5月,一篇名为《Association of intestinal anti-inflammatory drug target genes with psychiatric Disorders: A Mendelian randomization study》的论文发表,影响因子高达11.4分。这篇文章通过孟德尔随机化方法,探讨了肠道抗炎药物靶标基因与精神障碍之间的因果关系,并揭示了肠道微生物群在其中的潜在中介作用。 数据来源: 文章利用了现有的表达量定量性状位点(eQTL)和蛋白质QTL的汇总数据,这些数据来自GTEx项目及公共的GWAS数据,涵盖了多种精神障碍的病例和对照组数据。此外,还使用了ROSMAP的死后大脑样本数据及欧洲人群的肠道微生物群的GWAS数据。 ᠥ析思路: 选择肠道抗炎药物靶标:识别了五种非甾体抗炎药物,并在DrugBank和ChEMBL数据库中查找这些药物的靶基因。 基因表达数据集:使用GTEx项目中的大脑eQTL数据,选择了与肠道抗炎药物靶标表达相关的基因作为工具变量(IVs)。 结果数据:从公开的GWAS数据集中获取精神障碍的遗传预测因子,包括注意力缺陷多动障碍(ADHD)、自闭症谱系障碍(ASD)、强迫症(OCD)、双相情感障碍(BD)、精神分裂症(SZ)和重性抑郁障碍(MDD)。 孟德尔随机化:使用肠道抗炎药物的蛋白质靶标的遗传变异作为IVs,进行两样本MR分析,以评估药物靶标基因表达与精神障碍之间的因果关系。 敏感性分析:对显著的MR结果进行敏感性分析,包括使用欧洲人群的GTEx数据、使用肠道基因表达作为暴露、使用全血中的全显著cis-eQTL结果,进行贝叶斯共定位分析。 两步MR中介分析:使用GWAS汇总数据,首先估计目标基因表达对中介(肠道微生物群)的因果效应,然后将中介作为暴露来评估对BD风险的因果效应。 文章解释了MR分析结果,提出了olsalazine(一种抗炎药物)可能作为BD治疗的有前景的治疗候选药物,并强调了TPMT和ACAT1在未来药物开发中的重要性。
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