网络药理学前沿信息_网络药理学的研究思路与方法(2024年12月实时热点)
网络药理学学习资料大公开,轻松掌握! 终于有人整理好了网络药理学的宝贵资料,快来看看吧! 网络药理学做图软件:3个必备工具,让你的研究更上一层楼! 网络药理学相关文献:深入了解网络药理学的理论基础。 젧𝑧類学系列一(共11讲):从基础到进阶,带你全面掌握网络药理学。 젧𝑧類学系列二(共14讲):深入探讨网络药理学的实际应用。 젧𝑧類学系列三(共15讲):涵盖网络药理学的最新研究成果。 网络药理学zip文件:包含所有关键资料,方便下载和学习。 堨熩⑦程:详细讲解网络药理学的重要概念和方法。 中药网络药理学资料:专为中药研究设计的网络药理学资源。 数据分析工具:提供KEGG通路富集分析和GO功能富集分析等强大工具。 基因名字转换脚本:将基因名字转换为基因ID,方便进行后续分析。 蠨柳騰控网络视频:展示药物如何通过调控网络影响生物过程。 寸 Cytoscape输入文件准备:教你如何准备Cytoscape所需的输入文件。 蛋白互作网络构建:构建蛋白质相互作用网络,揭示生物过程的复杂性。 多个化合物处理:处理多个化合物,分析它们对网络的影响。 🠔CMSP中药网络药理学资料:专为中药研究设计的网络药理学资源。 TCMSP中药网络药理学资料.zip:包含所有关键资料,方便下载和学习。 堔CMSP中药网络药理学视频教程:详细讲解中药网络药理学的关键概念和方法。 中药网络药理学可视化:将中药的网络药理学研究结果可视化,直观展示药物的作用机制。 PPI网络核心基因:找出PPI网络中的核心基因,深入了解它们在网络中的作用。 PPI网络构建:构建PPI网络,揭示蛋白质之间的相互作用关系。 🠤𘭨什络药理学可视化:将中药的网络药理学研究结果可视化,直观展示药物的作用机制。 药物靶点和疾病靶点交集:找出药物靶点和疾病靶点的交集,深入了解药物的作用机制。 堧𝑧類学视频教程:详细讲解网络药理学的关键概念和方法,帮助你快速上手。 网络药理学资料下载:提供所有关键资料的下载链接,方便学习和使用。
8k网络药理学教程免费分享,快来领取! 大家好,今天我要和大家分享一份价值8k的网络药理学教程,真的是医学科研大佬们的结晶啊!经过一番努力,我终于学完了这些内容,现在整理出来分享给大家,绝对的白嫖福利哦! 网络药理学教程概览 首先,这个教程包括了三个部分的详细内容:网络药理学做图软件、网络药理学相关文献以及一系列的网络药理学讲座。具体来说: 网络药理学做图软件(3个) 这些软件可以帮助你更好地进行网络药理学的可视化操作。 网络药理学系列讲座 这个部分包含了多个讲座,从基础到进阶,适合不同层次的研究人员。 网络药理学相关文献 这些文献都是最新的研究成果,可以帮你了解最新的研究动态。 详细内容展示 接下来,我会详细介绍一下教程中的一些关键内容: KEGG富集分析.mp4 - 344.19MB GO功能富集分析.mp4 - 285.56MB 基因名字转换成基因id的脚本 - 182.36MB 药物调控网络.mp4 - 332.46MB cytoscape输入文件准备.mp4 - 179.45MB 蛋白互作PP网络构建.mp4 - 290.22MB 多个化合物处理.mp4 - 266.3MB TCMSP中药网络药理学资料 此外,教程中还特别提到了TCMSP中药网络药理学资料,这部分内容非常适合中药研究者。具体包括: KEGG通路富集分析(走脚本) - 223.09MB GO功能富集分析(走脚本) - 237.3MB symbol转换为基因id(走脚本) - 136.98MB PPI网络核心基因(走脚本) - 181.73MB PPI网络构建 - 238.77MB 中药网络药理学可视化 - 304.1MB 总结 这份教程真的是涵盖了网络药理学的方方面面,从基础到进阶,从软件到实践,内容非常丰富。希望这份教程能对大家有所帮助,赶紧下载学习吧!如果有任何问题,欢迎在评论区留言,我会尽力解答。祝大家科研顺利!
终于有人把网络药理学讲明白了! 网络药理学:从零到有手就会 网络药理学,听起来有点高大上,但其实也没那么复杂。刚开始的时候,我也觉得这玩意儿学不会,但慢慢摸索下来,发现其实只要掌握了几个关键步骤,就能轻松上手。 数据库和工具:你的得力助手 TCMSP数据库:这个数据库简直是宝藏,能帮你找到药物的有效成分。 PubChem数据库:预测这些成分的靶点,让你知道药物到底是怎么起作用的。 SwissTarget Prediction:预测靶点,进一步了解药物的作用机制。 Genecards数据库:找到和疾病相关的靶点,确定药物的治疗方向。 OMIM数据库:获取更多疾病相关的信息,让你的研究更全面。 软件和流程:让你的研究更高效 Cytoscape软件:构建药物-成分-靶点-疾病网络,清晰展示药物的作用路径。 String数据库:找到交集基因,进一步优化你的网络。 PPI网络:通过蛋白质相互作用网络,深入了解药物的作用机制。 DAVID数据库:进行GO和KEGG富集分析,找出药物的主要作用途径。 微生信网站:提供更多生物信息学工具,让你的研究更深入。 分子对接:用Autodock和Pymol进行分子对接,找出药物和靶点的具体结合方式。 Openbabel等软件:进行化学结构优化,提高药物的活性。 做图软件:让你的研究成果更直观 网络药理学的研究离不开各种做图软件,这里推荐几个常用的: Cytoscape:构建网络图,清晰展示药物的作用路径。 其他做图软件:根据具体需求选择合适的软件,让你的研究结果更直观。 相关文献和资料:让你站在巨人的肩膀上 网络药理学系列一(共11讲):从基础到进阶,逐步掌握网络药理学的核心知识。 网络药理学系列二(共14讲):深入探讨网络药理学的各种应用场景。 网络药理学系列三(共15讲):进一步扩展网络药理学的研究范围和方法。 TCMSP中药网络药理学资料:提供更多中药相关的网络药理学资料,让你对中药的研究更深入。 希望这些资料能帮到你,让你的网络药理学研究更上一层楼!
网络药理学学习资源大集合,医学生必备! 网络药理学学习资源合集,助你一臂之力! 探索网络药理学的奥秘,这些资源将是你旅途中的得力助手。 TCMSP数据库:获取药物有效成分的宝库。 점ubChem数据库:预测有效成分靶点的关键。 SwissTarget Prediction:发现更多潜在靶点。 enecards数据库:疾病靶点的信息集散地。 OMIM数据库:疾病与基因关系的详尽资料。 Venn图:交集基因的发现之旅。 网络药理学流程思路:从药物到疾病的全面解析。 寸 Cytoscape软件:构建药物-成分-靶点-疾病网络。 String数据库:PPI网络的构建基础。 砃ytoscape软件:GO和KEGG富集分析的工具。 젥信网站:探索更多生物信息学资源。 Autodock:分子对接的强大引擎。 砐ymol:分子可视化的专业工具。 Openbabel等软件:化学信息学的全方位支持。 蠧𝑧類学做图软件:让你的研究更上一层楼。 网络药理学相关文献:深入研究的坚实基础。 젧𝑧類学系列课程:从基础到进阶的完整学习体验。 掌握这些资源,你的网络药理学研究将更加深入和全面。
医学本科生如何轻松上手网络药理学? 医学本科生们,想要在网络药理学领域有所作为吗?网络药理学不仅是一个热门的研究方向,更是一个充满挑战与机遇的领域。今天,我们就来探讨一下如何轻松上手网络药理学研究。 网络药理学的核心 网络药理学是基于药物与药物之间在结构、功效等方面的相似性,并考虑到机体内靶标分子和生物效应分子的多种相互作用关系,通过构建药物-药物、药物-靶标等网络,来预测药物的功效以及特定功效对应的药物。 🠤𘭨什络药理学的分析思路 中药网络药理学是利用网络药理学的原理和方法,研究中药方剂、药对、中药治疗某种疾病或改善某种表型的分子机制。这类课题一般侧重于整体的分析,分为三步走: 通过数据库、文本挖掘或软件预测等手段找到某方剂、药对或中药中的有效靶点。 通过GO/KEGG富集分析,筛选靶分子相关的生物学功能和分子通路。 构建互作网络,包括药物-活性成分-相关生物学功能/通路之间的互作网络,以及靶分子之间的互作网络。 ᠧ𝑧類学与生信结合的分析套路 这类研究将生信分析套路和网络药理学套路有机结合,通过数据库、文本挖掘或软件预测等手段找到某方剂、药对或中药中的有效靶点,然后通过分析正常组和疾病组的高通量测序/芯片结果,筛选差异表达基因。接着,将药物预测到的靶分子与差异表达基因取交集,得到与差异表达相关的靶分子。最后,通过GO/KEGG富集分析,筛选靶分子相关的生物学功能和分子通路,并构建互作网络。 𞠥覕𐦍 网络药理学涉及多个数据库,如疾病数据库、蛋白互作数据库、基因互作预测数据库和化学结构搜索的数据库等。这些数据库为研究者提供了丰富的资源和工具,帮助他们更好地理解和预测药物的作用机制。 젥ꌩꌨ网络药理学研究通常需要实验验证,包括通过计算机模拟和体外实验(如SPR分析、Biocore)等验证药物小分子与靶分子之间的相互作用位点。此外,还可以通过免疫微环境的相关分析或表型相关分析来进一步验证预测结果。 临床相关性分析 如果有临床相关数据,可以进行临床相关性分析和预测模型的分析套路,包括常见的三表图(基线资料表、单因素、多因素、生存曲线图),以及ROG、Nomogram、Lasso回归等分析。这些分析方法可以帮助研究者更好地理解药物在临床上的应用和效果。 总结 网络药理学是一个充满挑战和机遇的领域,尤其适合医学本科生进行探索。通过合理利用各种数据库和工具,结合实验验证和临床相关性分析,你可以在网络药理学领域取得显著的成果。加油吧,未来的网络药理学研究者们!
网络药理学:一场充满挑战的学习之旅 最近,我开始了网络药理学的学习之旅,真是又爱又恨。整个过程漫长而繁琐,用了无数个数据库,下载了各种软件,结果总是事与愿违。每一步走错,就得从头再来,真是让人抓狂。 今天,我终于进入了研究所,跟着师姐开始学习。希望这次能顺利一些,毕竟师姐的经验丰富,有她在身边指导,感觉心里踏实了不少。 网络药理学的挑战 銊网络药理学,听起来很高大上,但实际操作起来却让人头疼。你需要先从海量数据中筛选出有用的信息,然后通过复杂的计算和分析,找出药物的作用靶点。这个过程就像是在大海捞针,稍有不慎就会漏掉重要的信息。 一步步来,别急 师姐告诉我,做科研最重要的是耐心和细心。每一步都要仔细核对,确保数据的准确性。虽然过程很枯燥,但只要坚持下去,总会有收获的。 未来的方向 目前,我已经掌握了一些基本的分析方法和软件操作。接下来,我会继续深入学习,争取早日独立开展实验。希望有一天,我也能像师姐一样,成为这个领域的专家。 总之,网络药理学虽然充满挑战,但只要我们坚持努力,总会有收获的。加油!ꀀ
网络药理学:探索药物作用的全新视角 网络药理学,这个充满科技感的领域,结合生物信息学分析,正为我们打开一扇探索药物作用的新大门! 多成分、多靶点、多通路:网络药理学告诉我们,药物不是单打独斗,而是通过多个靶点和信号通路来调节复杂疾病,尤其在中药复方研究中大放异彩! 系统性:它综合了基因、蛋白质、代谢产物等生物分子网络,揭示药物的整体作用机制,让我们不再局限于孤立的靶点分析。 頥䚧𐦍:网络药理学融合了药物化学、生物信息学、分子生物学等多学科数据,构建药物和疾病之间的网络关系,让研究更加全面。 研究步骤大揭秘: 1️⃣ 数据获取:从公开数据库或文献中获取药物成分、靶点、疾病相关基因等数据。 2️⃣ 靶点预测:利用计算工具预测药物的潜在靶点,结合分子对接和虚拟筛选技术。𛊳️⃣ 网络构建:构建“成分-靶点-疾病”网络,分析网络拓扑结构,识别关键节点和靶点。𘊴️⃣ 通路分析:通过KEGG、GO等通路富集分析,探讨药物作用的分子机制和信号通路。습️⃣ 实验验证:网络药理学的结论需要通过实验验证,如细胞实验或动物模型。 进阶技能包毼 蠤靶点获取及韦恩图绘制 药物-成分-靶点图、PPI、拓扑数据分析 頇O/KEGG富集分析 差异表达+ROC分析 𞠗GCNA分析、免疫浸润分析 ASSO回归分析和随机森林(RF)分析 泛癌分析+TCGA突变瀑布图 分子对接 력子动力学模拟:蛋白与配体动力学模拟 如果你的研究够新颖、够广泛,不妨留下你的课题方向,让我们一起探索药物作用的新世界! 你也想要在科研道路上跟进一步,发表高分SCI吗?别犹豫,赶紧行动吧!
网络药理学助力中药复方轻松发一区SCI 最近大家都在讨论生信,网络药理学更是其中的热门话题。其实,网络药理学真的很简单,就是在线预测嘛!但它能帮你找到中药复方的潜在靶点和通路,真是太棒了!今天我们就来看看一篇基于网络药理学预测并依赖铁死亡的中药复方如何轻松发表一区SCI。 文章概况 期刊名:Phytomedicine 影响因子:7.9 题目:Network pharmacology-based study on the mechanism of ShenKang injection in diabetic kidney disease through Keap1/Nrf2/Ho-1 signaling pathway ᠦ路解析 列出肾康注射液(SKI)中的多种成分,并将其输入TCMSP系统进行预测,得到280个潜在基因。 将这些基因与可能诱发糖尿病肾病(DKD)的基因取交集,进行GO/KEGG富集分析和药物成分疾病目标网络分析,发现可能影响铁死亡(排名靠后,略显牵强)。 进行表型验证,包括小鼠的体重、血脂、肾功能、肾脏组织学和氧化应激水平。 检测肾脏内铁离子和铁死亡通路变化。 进行细胞实验和影响铁死亡的Keap1/Nrf2/Ho-1通路验证。 ️ 数据库和生信工具 网络药理学系统:TCMSP system 疾病相关基因检索:GenGards, OMIM, drugbank, TTD, Disgene 蛋白互作分析:Sting 蛋白互作画图:Cytoscape 3.9.0(画图至少花了2个小时) GO/KEGG分析:Metascape数据库 总结 这篇文章通过幻想一个通路,然后利用网络药理学强行解释,再在动物和细胞上找相应的表型。虽然看起来简单,但效果却非常好。希望这篇文章能给你一些启发,毕竟循证医学还是很重要的嘛!
独一味抗肝纤维化成分与机制详解 🠧줸味(Lamiophlomis Herba, LH)是一种生长在青藏高原的珍贵传统药材,具有活血化瘀、抗菌和抗炎的特性。其主要成分包括环烯醚萜苷、苯乙醇苷、黄酮类和多糖,已被证实对肝纤维化病理变化具有改善作用,能减轻肝纤维化程度,但其具体作用机制和活性成分尚需进一步研究。 研究方法: 活性成分鉴定:使用UPLC-Q-TOF-MS技术鉴定LH中的活性成分;利用主成分分析( PCA)和HotMap软件对UPLC-Q-TOF-MS数据进行分析,筛选出标记成分。 网络药理学:通过数据库检索和网络分析,预测LH潜在的抗纤维化靶点,并构建活性成分-靶点网络。 分子对接:对LH的活性成分与潜在靶点进行分子对接研究,以预测它们之间的相互作用。 实验验证:利用ELISA, RT-PCR和Western blotting等实验方法验证网络药理学和分子对接的结果。 细胞实验:培养肝星状细胞( HSC-T6 )并用转化生长因子B1 (TGF-B1)激活,然后用LH及其单体成分处理,以评估其对肝纤维化的抑制效果。免疫荧光分析用于检测HSC-T6细胞中-平滑肌肌动蛋白( a-SMA )的表达。 主要结果: 识别了LH中的标志成分。 发现了与肝纤维化相关的LH活性成分。 基于网络药理学筛选了LH调节肝纤维化的靶点及潜在机制。 进行了LH活性成分和关键靶点的分子对接。 证实了LH能够减少HSC-T6细胞的肝纤维化。 文章小结:该研究通过综合化学和网络药理学方法,筛选了LH抗肝纤维化靶点,通过分子对接验证了活性成分与靶点之间的直接相互作用,此外,还通过ELISA, RT-PCR和Western blot等实验方法对网络药理学的结果进行了验证,增强了研究结果的说服力。
8k元网络药理学教程免费分享 这些资料是医学科研大佬们精心整理的,经过一番努力终于学完了,现在分享给大家,绝对免费哦! 网络药理学教程概览 网络药理学教程用不到了,分享给大家,拿走不谢! 网络药理学系列一(共11讲) KEGG富集分析.mp4 GO功能富集分析.mp4 基因名字转换成基因id(脚本安装) 药物调控网络.mp4 Cytoscape输入文件准备.mp4 蛋白互作PP网络构建.mp4 多个化合物处理.mp4 网络药理学系列二(共14讲) KEGG通路富集分析(走脚本) GO功能富集分析(走脚本) Symbol转换为基因id(走脚本) PPI网络核心基因(走脚本) PPI网络构建.mp4 中药网络药理学可视化.mp4 网络药理学系列三(共15讲) KEGG通路富集分析(走脚本) GO功能富集分析(走脚本) Symbol转换为基因id(走脚本) PPI网络核心基因(走脚本) PPI网络构建.mp4 中药网络药理学可视化.mp4 额外资料 TCMSP中药网络药理学资料.zip KEGG通路富集分析(走脚本) GO功能富集分析(走脚本) Symbol转换为基因id(走脚本) PPI网络核心基因(走脚本) PPI网络构建.mp4 中药网络药理学可视化.mp4 Cytoscape输入文件准备(走脚本) 药物靶点和疾病靶点交集(走脚本) 总结 这些教程涵盖了网络药理学的多个方面,从基础到进阶,适合各个层次的科研人员。希望这些资料对大家有所帮助!
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