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内容来源:麦吉窗影视所属栏目:导读更新日期:2024-12-01

slc7a11

【9期文章推荐】基于生物信息学分析构建肝细胞癌患者新型双硫死亡相关预后模型 网页链接 导读:目前,二硫化物代谢与癌症之间的紧密联系备受关注。在过度表达SLC7A11的癌细胞中,抑制葡萄糖转运体可以诱导二硫化物的耗竭,进而显著阻碍肿瘤的发生发展。由于HCC细胞对氧化应激显示出高度敏感性,并且SLC7A11在HCC组织中表达显著,因此,以双硫死亡通路为治疗靶点成为HCC治疗的新策略。然而,要深入了解双硫死亡的具体机制并评估其在HCC中的治疗潜力,仍需要进一步研究。本研究收集了HCC患者的mRNA表达谱和临床数据,包括TCGA、ICGC和GEO数据库。在TCGA-LIHC队列中,建立了一个以双硫死亡相关基因为基础的4基因预后模型,通过时间依赖性受试者工作特征曲线(ROC曲线)分析检测了风险评分的预测准确性,并通过ICGC-LIRI-JP和GSE14520(GPL3721)队列验证其可靠性。随后,通过深入进行功能富集分析,探讨了双硫死亡调节HCC发生发展的潜在机制。最后,结合药物敏感性数据分析了双硫死亡对HCC患者索拉非尼治疗效果的影响。

铁死亡:从基础到检测的全面解析 铁死亡是一种依赖于铁离子的程序性细胞死亡形式,由于多种因素(如药物或基因因素)导致代谢过程的改变和过氧化脂质的积累,从而损伤细胞膜结构。 铁死亡的特殊细胞形态学特征 铁死亡具有一些独特的细胞形态学特征,例如线粒体变小,线粒体膜密度增高,线粒体嵴减少或消失,以及线粒体外膜破裂。 铁死亡与疾病的关系 铁死亡与神经退行性疾病、癌症、中风、脑出血、创伤性脑损伤、心脏再灌注损伤和哺乳动物肾脏变性有关,也与植物的热应激有关。 铁死亡的调控网络 铁死亡的调控主要是铁死亡防御系统和铁死亡执行系统的博弈。铁死亡执行系统包括PUFA-PL的合成和过氧化,以及铁代谢。由LPCAT3和ACSL4介导的PUFA-PL合成,以及ALOXs和POR介导的PUFA-PL过氧化是铁死亡发生的必要条件。 PUFA-PL合成与过氧化 ACSL4和LPCAT3促进多不饱和脂肪酸 (PUFA) 掺入磷脂中形成多不饱和脂肪酸的磷脂 (PUFA-PL)。PUFA-PLs 易受脂氧合酶 (ALOXs) 介导的自由基引发的氧化作用。这种氧化作用最终会导致脂质双层的破坏并影响膜功能,从而促进铁死亡。乙酰辅酶A羧化酶(ACC)的失活或减弱也可阻断铁死亡。 铁死亡防御系统 铁死亡防御系统主要包括GPX4依赖的系统(SLC7A11-GSH-GPX4轴)和GPX4非依赖的系统(如NAD(P)H-FSP1-CoQ10轴和DHFR-BH4-GCH1轴)。 总结 铁死亡是一种重要的细胞死亡形式,与多种疾病有关。了解其基础特征和调控机制有助于更好地理解和应对相关疾病。

LncRNA-HMG减弱p53介导的铁死亡 第一步,p53可能为LncRNA-HMG下游分子 为了探索LncRNA-HMG介导CRC细胞化疗耐药的分子机制。将TCGA结直肠癌数据分为LncRNA-HMG低组和LncRNA-HMG高组,差异基因富集分析发现p53信号显著富集(图1a-b)。STRING蛋白-蛋白互作分析表明p53是枢纽因子之一(图1c)。综上所述,LncRNA-HMG可能与p53结合,调控p53信号通路。 第二步,LncRNA-HMG调控p53及其下游靶点 研究表明p53作为一个关键的转录因子,通过抑制铁凋亡抑制因子SLC7A11和VKORC1L1的表达来影响细胞内ROS水平。WB检测发现,LncRNA-HMG敲减增加p53水平,降低SLC7A11和VKORC1L1水平;过表达LncRNA-HMG则相反(图1d-e)。同样,LncRNA-HMG缺失促进5-Fu和奥沙利铂治疗后p53的升高,下调SLC7A11和VKORC1L1的表达;过表达则相反(图1f-g)。表明LncRNA-HMG调控p53及其下游靶点。 第三步,LncRNA-HMG降低p53的稳定性,并减弱p53介导的ROS铁死亡 根据报道,p53的蛋白稳定性在控制p53水平中起重要作用。采用核糖体阻滞药物环己亚胺(CHX)阻断蛋白翻译,进一步分析p53的稳定性。发现,LncRNA-HMG过表达,p53的稳定性受到损害,而抑制LncRNA-HMG则增强了p53的稳定性(图1h-i)。显示LncRNA-HMG降低了p53的稳定性,并减弱了p53介导的ROS铁死亡。 全文分享请查阅:【《Redox Biol》解读:作为支架lncRNA!LncRNA-HMG通过抑制p53介导的铁死亡刺激结直肠癌细胞产生化疗耐药】。 如有相关科研问题,欢迎留言探讨。 #科研#⠂ #泛素化修饰#⠂ #铁死亡#⠣实验室日常#⠂ #coip实验#

国自然标书写作的三种叙事策略 国自然标书的灵魂在于其叙事方式,而分子机制是关键。假设分子机制为A→B→C,那么如何将这个机制的故事讲得生动有趣呢?这里推荐三种写法:正序、倒序和两头堵。究竟哪种写法更好呢?让我们一起来看看吧! 𐟓– 正序:A→B→C 正序写法就像一部纪录片,不需要反转,从大数据分析中提炼出A的差异表达和功能作用。然后通过沉默A或者过表达A,发现B分子,B分子是C通路或表型的明星分子。这种叙事方式最为平稳。 已知的基础知识: ①铁死亡可抑制肝纤维化,抑制铁死亡会发生肝纤维化; ②SLC7A11是铁死亡的抑制因子; ③HIF-1˜悔쥽•激活因子。 故事如下: 索拉非尼抑制肝星状细胞(HSC)激活而改善肝纤维化; 在索拉非尼诱导的抗纤维化过程中,HIF-1ᨨ𞾩™低; HIF-1€š过激活SLC7A11的转录,SLC7A11是铁死亡的抑制因子; 索拉非尼通过抑制HIF-1禥‘HSC铁死亡; 阻断HSC铁死亡可消除索拉非尼诱导的抗纤维化作用。 𐟔„ 倒序:C→B→A 倒序写法是从结果出发,逐步推导原因。 索拉非尼诱导的小鼠肝纤维化发生了铁死亡; 索拉非尼通过体外触发铁死亡抑制HSC激活; 阻断HSC铁死亡可消除索拉非尼诱导的抗纤维化作用; 在索拉非尼诱导的抗纤维化过程中,SLC7A11表达降低; 索拉非尼通过抑制SLC7A11触发HSC铁死亡; HIF-1€š过激活SLC7A11的转录抑制HSC铁死亡; 索拉非尼抑制HIF-1š„表达水平促进HSC铁死亡。 𐟔— 两头堵:A→?→C,原来中间分子是B(SLC7A11)! 两头堵的写法逻辑性最强,最符合推理习惯,容易被大家理解。 索拉非尼抑制HSC激活而改善肝纤维化; 索拉非尼处理肝纤维化的小鼠后肝发生了铁死亡; 阻断HSC铁死亡可消除索拉非尼诱导的抗纤维化作用; 在索拉非尼诱导的抗纤维化过程中,HIF-1ᨨ𞾩™低; 索拉非尼通过抑制HIF-1禥‘HSC铁死亡; HIF-1€š过激活SLC7A11的转录抑制HSC铁死亡。 这三种写法各有千秋,选择适合自己的方式,让你的国自然标书更加生动有趣吧!

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