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16srrna在线播放_16srrna基因测序是什么(2024年12月免费观看)

内容来源：麦吉窗影视所属栏目：导读更新日期：2024-12-02

16srrna

微生态护肤：探索微生物的奥秘 𐟔 微生态护肤的奥秘，离不开对微生物的深入探索。今天，我们就来聊聊几种检测微生物的神奇技术。 16S rRNA 测序：揭秘细菌世界 𐟦 16S rRNA 测序是一种分子生物学技术，专门用于分析微生物群落中的细菌种类和多样性。16S rRNA 基因是细菌核糖体小亚基的一部分，既有高度的保守性，又有一定的变异性。通过测序，我们可以：鉴定微生物种类：16S rRNA 测序能让我们知道样本中都有哪些细菌，并将它们分类到不同的系统发育群体中。这有助于我们了解微生物的身份和关系。研究微生物多样性：多样性指的是某一生态系统中不同种类的微生物数量和相对丰度。通过16S rRNA 测序，我们可以了解不同微生物在生态系统中的分布和影响。 ITS 测序：真菌的身份证 𐟍„ ITS（Internal Transcribed Spacer）区域位于真菌核糖体 RNA 基因中，其序列在不同真菌种类之间具有较大的差异。通过对 ITS 区域进行测序，我们可以准确鉴定真菌的种类。 16S rRNA 测序与 ITS 测序的结合应用 𐟌🊨🙤𘤤𘪦Š€术结合起来，可以更全面地了解微生物群落的结构和功能。例如，某项研究通过16S rRNA 测序和 ITS 测序，探讨了洗发水对头皮微生态的影响。宏基因组测序：微生物的全景图 𐟌 宏基因组测序可以同时检测样本中所有微生物的基因组信息，包括细菌、真菌、病毒等。它提供了更全面、更详细的微生物群落结构和功能信息。例如，某项研究通过宏基因组测序，探讨了祛痘产品的功效。结语 𐟌Ÿ 这些技术不仅让我们对微生物有了更深入的了解，也为微生态护肤提供了有力的科学依据。未来，随着技术的不断进步，我们相信微生态护肤会带来更多惊喜和突破。

细菌菌种鉴定全攻略：从形态到分子细菌的分类单元主要包括属、种和株三个层次。种（species）是指表型特征高度相似、亲缘关系相近且与同属其他种有明显差异的个体总称。而菌株（strain）则是指不同来源的某一种细菌的纯培养物。细菌的鉴定通常涉及形态特征、生理生化鉴定和分子鉴定等多个方面。其中，分子鉴定包括DNA-DNA杂交（DDH）、G+C含量、16S rRNA比对和ANI（平均核苷酸一致性）等方法。DDH用于评估亲缘关系，G+C值和16S rRNA分别用于评估整体遗传组成和特定基因的保守性。相关阈值如下： G+C差异范围：种间为3%，属间为10%。 ANI：菌株间为99.9%，种间为97%（大于96%时为同一个物种，小于95%时为不同物种）。 Digital DNA–DNA 杂交值：同一菌株为100%，同一亚种为80%~90%，同一种内不同亚种为60%~70%，同属不同种为20%~60%。对于ANI及DNA杂交值，需要基因组数据来进行计算分析，可以通过相关的在线计算工具进行。

美吉生物推出真菌ITS多样性绝对定量技术传统的微生物扩增子测序方法主要通过测定细菌16S rRNA、真菌ITS或真核生物18S序列来分析微生物群落的组成和相对丰度。然而，这种方法无法提供微生物的绝对丰度信息，也无法反映微生物总负荷的变化，这可能导致误导性的结论，阻碍对微生态研究的全面理解。𐟌€ 在Nature、Science和Microbiome等顶级期刊上，已有多篇论文强调了绝对丰度在微生物群落动态变化研究中的重要性。𐟓š 为了克服传统扩增子测序的局限性，美吉生物在16S微生物多样性绝对定量技术之后，推出了真菌ITS微生物多样性绝对定量技术。 𐟔 该技术利用内标法绝对定量测序技术，能够一次性获得样品中微生物的总绝对拷贝数和单个物种的绝对拷贝数，从而反映微生物群落的动态变化。美吉生物的真菌ITS多样性绝对定量方法针对ITS1区，通过向样品DNA中添加已知拷贝数的不同浓度梯度混合的Spike-in DNA序列（Spike-in DNA是人工设计合成的DNA，其设计的可变区与公共数据库中的核苷酸序列缺乏一致性，作为内标序列用于定量），共同进行PCR扩增、文库构建和测序。然后，根据Spike-in DNA在扩增子测序中获得的序列数和其理论绝对拷贝数绘制标准曲线，实现对样本中的各微生物的绝对定量。 𐟌🠨復Š€术的应用领域广泛，包括环境、临床和农业等领域。通过提供更清晰、更全面的数据信息，有助于更好地理解微生物群落的动态变化。 𐟓栩€样建议：可选引物：ITS1F-ITS2R（真菌ITS1区）环境样品送样量要求详见微生物多样性取样指南，请提供样本分组信息和理化（临床）指标信息 DNA样品送样要求：Qubit检测DNA浓度≥10ng/，体积≥50ul，OD260/280=1.8~2.0并确保DNA无降解、无污染（需提供抽提DNA的样本用量（如土壤/g），抽提后获得的DNA总量（ng））通过这些技术，美吉生物为微生态研究提供了更全面、更准确的数据支持。𐟌𑀀

真菌16S rRNA基因扩增引物大全 16S rRNA基因是细菌和古菌的标志性基因，用于区分这两类微生物。而真菌则有其独特的基因标记，最常用的是内部转录间隔区（Internal Transcribed Spacer, ITS），包括ITS1和ITS2，以及28S rRNA基因的一部分。这些区域在真菌中具有高度的变异性，非常适合用于真菌多样性的研究和系统发育分析。以下是一些常用的真菌ITS区域扩增引物： ITS1F/ITS4 ITS1F：`CTT GGT CAT TTA GAG GAA GTA A` ITS4：`TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC` 这对引物广泛用于扩增真菌的ITS1区域，适用于真菌多样性和系统发育研究。 ITS5/ITS4 ITS5：`GGA AGT AAA AGT CGT AAC AAG G` ITS4：`TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC` 这对引物也可以用于扩增真菌的ITS区域，包括ITS1和ITS2。 ITS3/ITS4 ITS3：`GCC GCT GAG AAACC AGA ATC A` ITS4：`TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC` 这对引物用于扩增真菌的ITS区域，适用于真菌的多样性和分类研究。 NL1/LR3 NL1：`GGC TGG TGT AAA CYY TTG WG` LR3：`CTT GCG TCA ATT YTC RAR GG` 这对引物特别设计用于扩增子囊菌门（Ascomycota）的真菌。 Fungali-224/Fungali-766 Fungali-224：`GCCAATTBYMTTTRAGTTG` Fungali-766：`CCGTGTTGATYCCTGRCAGT` 这对引物用于扩增真菌的ITS区域，适用于真菌的多样性和系统发育研究。使用引物的注意事项引物的选择：应根据研究目的和预期的分辨率选择合适的引物。如果目的是获得高分辨率的分类信息，可以选择针对特定可变区域的引物；如果目的是获得广泛的真菌多样性信息，可以选择能够扩增较长序列的引物。引物的通用性：尽管这些引物被设计为具有广谱性，但仍然可能存在某些真菌种类无法被有效扩增的情况。引物的特异性：在某些情况下，引物可能会与其他非目标序列发生交叉反应，因此在设计实验时应进行适当的验证。通过选择合适的引物，可以进行真菌多样性和系统发育研究，深入了解真菌的分布和进化关系。

肠道微生物检测：一份“正常”的报告解读最近给家人做了一次肠道微生物检测，结果出来后，总评分是72分，大部分指标都在正常范围内。这份报告的解读还挺有意思的，尤其是对于儿童的疾病风险评估。首先，报告显示弟弟的感染型腹泻、自闭症、抑郁症和自体免疫病（这个术语有点不规范）的风险都是“注意”等级。不过，报告里并没有详细说明这些评估方法，所以实在没法确定这些评估的准确性。从菌群组成来看，也没有发现这些疾病相关的有害菌明显增多。另外，报告中的氨基酸评估有几个异常值，但这些氨基酸是微生物合成的还是代谢的，报告里也没说。方法描述中提到采用的是16S rRNA测序，但我不明白基于16S数据是怎么评估菌群功能的（研究上确实有很不准确的方法）。抗生素风险的评估更是让人摸不着头脑。同一个菌种的耐药性差异很大，更不用说16S测序的菌群组成只能分类到属水平。在没有耐药基因检测的情况下，用属水平物种组成来评估抗生素风险，简直是在瞎猜。尽管如此，排除这些疾病和功能所谓的“评估”，菌群组成方面我还是勉强相信的。虽然很多结果给到了种水平甚至亚种水平（这个用16S技术几乎是不可能做到），但总的来说，弟弟的菌群组成没有特别的有害或罕见菌，菌群多样性也正常，算是一个正常的检测结果。总的来说，这种报告的解读确实不是个容易的事情，在我这样的专业人士都得很小心地来看，需要避免各种误导和不准确性，真不知道在大众和各种所谓的“专家”面前是怎么解读的。

上海富衡｜细菌鉴定：洞察微观世界的 “身份识别术”

青春酵母：你不知道的抗衰秘密你有没有听说过青春酵母？其实它也叫青春双歧杆菌，和其他双歧杆菌有点不一样。青春双歧杆菌在年轻人身体里特别多，但到了老年，它的数量就会大幅减少。研究表明，青春酵母可以通过增加体内SOD的含量来促进GABA的产生，从而延缓衰老。听起来是不是很神奇？其实，它通过细胞层面的作用来抗衰老。细胞整体活力：增强衰老细胞的增值能力，促进胶原蛋白的生成。细胞核：延缓细胞衰老，帮助恢复细胞损伤。细胞器：抑制衰老细胞，减缓胶原流失，抑制其对真皮结构的损坏。说到这里，不得不提梵溪花园的大马士革玫瑰精华霜。它有一个独特的专利菌株，经过16S rRNA鉴定并申请了专利，是珈凯自主分离出来的。这个精华霜通过细胞层面作用抗衰，激活细胞整体活力，延缓细胞衰老，恢复细胞损伤，减缓胶原流失，抑制真皮结构损坏。简单来说，它能有效淡化皱纹，提升肌肤弹性，让肌肤重新焕发活力。所以，如果你也在为抗衰老而努力，不妨试试这些方法，让你的肌肤和身体都保持年轻活力！

𐟧쥮基因组测序：揭秘微生物世界 𐟔宏基因组测序，是一种强大的技术手段，它能够揭示环境样品中全部微生物的总DNA（即宏基因组）的奥秘。这种高通量测序方法不仅让我们了解微生物的种群结构，还能揭示它们的基因功能活性以及相互协作关系。𐟌𑊊𐟤”与16S rRNA测序相比，宏基因组测序有何不同？首先，它们的测序原理大相径庭。16S rDNA基因在所有细菌基因组中高度保守，通过对特定高变区进行PCR扩增和测序来研究微生物群落。而宏基因组测序则是将微生物基因组DNA随机打断，通过通用引物进行PCR扩增，再拼接成长序列，从而进行深入研究。𐟧슊𐟎玲䥤–，宏基因组测序的研究目的更为广泛。在16S测序的基础上，它还能深入探索基因和功能层面，如GO、Pathway等，为我们提供更全面的微生物群落信息。𐟔슊𐟌𑦜€重要的是，宏基因组测序在物种鉴定方面具有显著优势。通过随机打断和拼接DNA片段，它能够鉴定微生物到种水平甚至菌株水平，这是16S测序难以做到的。𐟔 𐟌Ÿ总的来说，宏基因组测序为我们打开了一个全新的视角，让我们更深入地理解微生物世界的奥秘。在微生态研究中，结合宏基因组测序和16S测序两种技术手段，将使我们能够更高效、更准确地研究微生物群落组成结构、多样性和功能情况。𐟌ˆ

背景：流行病学研究证实，适度饮酒与心血管不良事件风险降低相关。人们越来越认识到肠道微生物群和代谢物的组成参与调节宿主的心血管健康。然而，适度饮酒与血清代谢物和肠道微生物组的关联及其对冠状动脉疾病(CAD)的影响尚未得到充分研究。方法：对72名患有各种酒精的CAD男性患者（36名不饮酒者、18名中度饮酒者和18名重度饮酒者）和17名匹配的健康对照者进行血清非靶向代谢组学分析和粪便16S rRNA测序。MetaboAnalyst和PICRUSt2用于分析可能涉及的代谢途径。通过Spearman相关性实现多组学分析，以揭示饮酒与CAD患者肠道微生物组和血清代谢物的相互作用。结果：我们注意到CAD患者在血清代谢组和肠道微生物组方面的不同饮酒水平和健康对照组之间存在明显差异。适度饮酒显著改变了脂质组学特征，包括与患有CAD的非和重度饮酒者相比，患有CAD的中度饮酒者的鞘脂和甘油磷脂减少。此外，我们还发现患有CAD的适度饮酒者的微生物衍生代谢物减少，例如2-苯基乙酰胺和甲羟戊酸。需要注意的是，患有CAD的适度饮酒者的肠道微生物群往往与健康对照者的肠道微生物群相似。与不饮酒者相比，中度饮酒CAD患者的Paraprevotella、Lysinibacillus的相对丰度显著升高，而双歧杆菌属、Megasphaera和链球菌属在中度饮酒者中显著降低。多组学分析显示，与适度饮酒相关的特定代谢物和微生物与CAD的严重程度相关。结论：我们的研究表明，适度饮酒对CAD患者血清代谢物和肠道微生物群的影响似乎与大量饮酒和不饮酒的影响是分开的。适度饮酒往往对代谢特征和共生菌群产生更积极的影响，这可以解释其对心血管健康的有益影响。总体而言，我们的研究提供了对适度饮酒对CAD患者影响的新见解。总之，我们提出了一个新概念，即“通过肠道微生物群调节酒精含量”对人类心血管健康的影响。研究发现，饮酒会对许多疾病产生因果影响，包括缺血性心脏病、高血压性心脏病和中风。我们推测适量饮酒可能会调节肠道微生态和血清代谢物，这可能在改善CAD方面起重要作用。饮酒应被视为心血管系统的重要调节因素。然而，未来仍需进行功能验证和探索性研究，以验证因果关系。 #饮酒# #适度饮酒# #健康科普# #正式确诊为健康人# #肠道健康# #肠道菌群# #心血管# #心血管健康# #男性健康#

微波炉里的细菌世界：你知道多少？ 𐟔 研究背景：微波炉是我们日常生活中常见的电器，但你知道吗？它们可能隐藏着丰富的微生物世界。这项研究旨在探索家用、共享家用和实验室微波炉中的细菌群落，了解它们是如何受到微波炉使用模式和用户习惯的影响的。 𐟎 ”究目标和假设：研究团队的目标是确定微波炉是否因为微波辐射等因素而形成了独特的微生物群落。他们假设，不同使用模式的微波炉会导致细菌组成的差异。 𐟔젧 ”究方法：为了验证这个假设，研究人员从30台微波炉（10台家用、10台共享家用、10台实验室）中收集了样本。他们使用了培养技术和16S rRNA基因的下一代测序（NGS）来分析细菌群落。此外，他们还将微波炉的微生物群落与太阳能电池板、核废料和厨房表面等其他环境进行了比较。 𐟓Š 结果和发现：通过培养和NGS分析，研究人员发现，微波炉中的细菌群落主要由变形菌门、厚壁菌门、放线菌门和拟杆菌门组成，这与人体皮肤微生物群落相似。家用微波炉中更多食品相关的细菌，如施瓦纳菌属、肠杆菌属和克雷布希拉属，而实验室微波炉中则更多抗辐射、耐热和抗干燥的细菌，如柯克球菌属和蓝细菌。 𐟒젨’Œ解释：这些差异表明，使用模式和选择压力塑造了每种类型微波炉的微生物群落。家用微波炉的细菌群落更接近于食品相关的细菌，而实验室微波炉则更多抗辐射、耐热和抗干燥的细菌。 𐟌Ÿ 对研究领域的贡献：这项研究首次详细探索了微波炉的微生物群落，揭示了人类活动和环境因素如何影响这些人工设备中的细菌群落。 𐟏† 成就和重要性：研究表明，即使暴露在高温和辐射等极端条件下，微波炉仍然孕育有专门适应这些条件的微生物群落。这在鉴定新的极端生物体方面具有潜在的生物技术应用。 𐟚력𑀩™性和未来工作：这项研究没有调查微波炉中细菌的适应机制。未来需要进一步研究微波炉内部细菌如何生存在恶劣条件下，以及它们的潜在生物技术用途。

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