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clustalx新上映(2024年12月抢先看)

内容来源：麦吉窗影视所属栏目：导读更新日期：2024-12-04

clustalx

生物信息学干货：蛋白理化及多序列比对技巧 𐟓Š 蛋白质分子量与等电点预测不同蛋白质的等电点各异。当缓冲液与等电点一致时，蛋白质会沉淀，影响酶促反应。因此，了解蛋白质的等电点至关重要。BioXM软件可进行此分析。 𐟔 蛋白N端信号肽分析信号肽含有疏水区，可能导致重组蛋白形成包涵体。在设计引物前，需先进行信号肽分析，并在信号肽断裂位点后的碱基端设计引物。注意：切除信号肽后要验证读码框是否改变，且质粒载体上带有启动子，无需考虑RNA聚合酶转录问题。 𐟔„ 多序列比对 GeneDoc软件支持两种算法（pairwise和multiple）进行多序列比对，具体操作流程见图3。输出结果为aln格式，可用Jalview可视化打开。 𐟌𑠃lustalX2多序列比对将多条序列依次输入text文件，保存为txt格式。ClustalX2支持多种比对格式，完成后得到树文件和aln文件，用Jalview打开aln文件即可。 𐟌🠍EGA-X多序列比对及进化树分析 MEGA-X支持多序列比对和进化树分析，完成后输出fasta格式和mega格式文件。构建进化树后，可点击小锤子进行美化。 𐟎蠅Spript可视化及二级结构预测 ESpript可用于多序列比对可视化和二级结构预测。将MEGA比对后格式和Swiss model建模文件导入ESpript，即可生成高质量配图。 𐟔 Motif预测详细见图示，了解如何进行motif预测。

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