表型组学最新视觉报道_表型组学平台(2024年12月全程跟踪)
Phenomics|中国中医科学院仝小林院士团队发表“基于糖尿病探讨中医药表型组学研究”综述
表型组学期刊发展研讨会举办 | 科协事
有学生问苏格拉底爱情是什么,苏格拉底让他去花园里边找一朵最美的玫瑰,当时正直玫瑰花开,花园里的玫瑰看上去都非常美丽,实在难分高下,最后学生空手而归!如何帮助苏格拉底找到最美丽的花,来了解植物表型组学吧网页链接
悉尼科大博士项目招生啦! 릂尼科技大学(UTS),位于澳大利亚悉尼,是公立研究型大学的佼佼者。现在,该校全奖博士项目正在火热招生中! 쨯婡探索细菌间共生如何调节水生生态系统健康,结合基因组学、表型组学和微流体学的前沿方法,为水生生态系统的健康控制提供全新视角。 学金丰厚,每年津贴价值高达37000美元,博士期间还有额外资金用于相关费用。学制3.5年,让你全身心投入研究! 研究方向包括:确定新的细菌共生相互作用、阐明细菌间交换的关键化学货币、探究共生行为机制以及评估共生体如何控制生态系统水平过程。 ᦃ深入了解水生生态系统的你,不要错过这个机会!赶快行动吧,悉尼科大等你来挑战!
单细胞与空间转录组学揭示细胞通讯新模式 在《Nature Methods》杂志上,有一篇题为《通过单细胞和空间转录组学推断驱动模式的细胞间流动》的文章,真是让人眼前一亮。这篇文章提出了一种全新的方法来研究细胞通讯,让我对细胞通讯的复杂性有了更深的理解。 传统上,我们进行细胞通讯分析时,可能只关注单个基因的变化。但这篇文章告诉我们,当细胞受体接收到信号刺激时,实际上是一个由多个基因构成的基因模块在发生变化。这个模块可能包含我们感兴趣的下游分子或转录因子,甚至可能与某些临床表型(如预后或疗效)有关。 文章中提到的FlowSig算法,完美地解决了这些问题。无论是单细胞转录组测序还是空间组学,都能从中推断出细胞间通信驱动的细胞间流动。这种方法揭示了细胞间信息流动的复杂性,为多种疾病的研究提供了新的视角。 具体来说,文章中提到的FGF受体(FGFR1和FGFR3)是输入信号的来源,而GEM模块则是这些信号引起的细胞内变化。这些变化会促使细胞释放一系列配体。以前的研究中并没有包含GEM这个中间过程。 总的来说,这篇文章为我们提供了一个全新的研究细胞通讯的框架,让我们能够更深入地理解细胞间的复杂相互作用。
一本书搞懂数据挖掘在药物发现中的应用 这本书简直是个宝藏!它从多个角度深入探讨了数据挖掘在药物发现中的重要性。全书分为四个部分,每一部分都充满了干货。 第一部分:数据来源的多样性 第一部分主要介绍了药物发现中使用的各种数据来源。比如,蛋白质结构数据库和各种小分子生物活性数据库。这些数据库就像是药物的宝藏库,里面藏着无数可能的线索。 第二部分:数据分析和可视化工具 第二部分重点介绍了数据分析和数据挖掘的各种方法。特别是对HTS(高通量筛选)数据的挖掘,以及如何识别不同的目标命中。此外,还展示了一些强大的数据可视化工具,这些工具能简化数据,让它们更容易理解。 第三部分:药理学应用 第三部分讨论了多种药理学应用。比如在化学基因组学时代,数据挖掘可以为配体分析和目标捕捉带来积极的结果。这一部分的内容非常实用,对于药物开发人员来说,简直就是一把利器。 第四部分:系统生物学方法 𑊊最后一部分介绍了系统生物学方法。比如,如何通过综合和模块化分析方法挖掘大分子和表型数据。这些方法能够降低高维数据的复杂性,为整合不同类型的组学数据提供了一种方法。此外,还建立了一套新的方法,定量地衡量化学品对生物系统的生物影响。 总结 总的来说,这本书从工业和学术两个角度处理了药物发现策略,为药物开发人员提供了一个系统的、全面的视角。无论你是数据科学家还是药物发现专家,这本书都值得一读。它不仅能让你了解数据挖掘在药物发现中的重要性,还能教你如何在实际项目中应用这些技术。 所以,如果你对数据挖掘和药物发现感兴趣,这本书绝对是你的不二之选!
复旦人表院夏令营全攻略:报名到面试 又到了保研季,很多学弟学妹来问我关于复旦人表院夏令营的情况。今天我就来给大家详细讲讲,希望能帮到你们。 1️⃣ 学院概况 人表院全名是人类表型组研究院,是近几年新成立的学院,由金力老师担任院长。主要研究方向是各组学与人类表型关联研究,很多老师都是金力老师一脉的遗传学专家。人表院目前位于复旦张江校区,夏令营活动也在这里进行(说实话,张江有点偏僻䯼。不过,报人表院并不意味着未来一定要在张江读研,因为有些老师的实验室还在江湾,所以最终还是要看你选择的导师。 2️⃣ 报名注意事项 报名页面上填的方向主要影响面试分组,23年的面试分为三大组:生信、生技等。但最终做什么方向还是看你进了哪个课题组。生信方向在确定读人表院后可以直接选导师,不清楚生技方向会不会有轮转等情况。 3️⃣ 夏令营流程 夏令营活动分为三天: 第一天:听报告,参观人表院的设施和器材等。 第二天:与导师自由交流,会公布各个导师的办公室位置,可以选择去江湾或在张江找心仪老师交流。 第三天:面试。 4️⃣ 面试情况 每个人总计约20分钟。首先是自我介绍,大约三分钟,不要求英文和PPT。接着是英语能力考察,给一小段文献内容朗读并翻译。我那段是关于癌症肿瘤相关的,篇幅很短,对生物专业的同学应该不算难,专业名词也不多。建议大家读的时候不要太着急,边读边组织语言翻译,我就是没过脑子飞速读完然后卡了一会儿才翻译完。然后是导师提问环节,大概有10多个老师参与,但实际提问的老师只有两三个,老师们都比较温和,没有问太尖锐的问题。我报的是生信方向,问的专业问题就是几个统计学相关的小问题,也比较简单。之后有对自我介绍时讲到的感兴趣方向提问,也有对个人性格(抗压能力,与导师意见不一致怎么办等)的问题,总体来看不算太难。 5️⃣ 优营情况 入营约80人,优营约30人,应该算比较高的比例了。 最后,还是想说一句,如果有心仪的导师或者学校,并且有把握优营上岸,各位保研的同学真的没必要大量海投,有稳保冲的学校就好。保研夏令营只是一段普通的经历而已,不是拿来炫耀自己能进多少个名校夏令营的资本,过度海投反而占了那些可能需要冲一把同学的名额。
微生物药物合成中生物信息学研究相关图片 深入探索生信分析的最新进展,尤其是单细胞测序和空间转录组测序的方法。如果你对这些领域感兴趣,不妨查阅图5和6,它们详细介绍了方法步骤。此外,还有更多关于单细胞测序、空间转录组测序以及公共数据挖掘的知识等你来发现! 金凤实验室的研究团队在最新研究中取得了一项重大发现:他们发现了恶性胶质瘤内一种全新的肿瘤相关巨噬细胞(TAM),并揭示了其在肿瘤血管正常化中的潜在疗效。这项突破性研究由陆军军医大学第一附属医院(重庆西南医院)的卞修武院士、时雨副教授以及平轶芳教授领导的团队与祁淑红副研究员合作完成,并于最近在《Cancer Cell》杂志上发表。 通过单细胞多组学技术,研究团队绘制了恶性胶质瘤内肿瘤相关巨噬细胞的空间图谱,并发现了一种富集于缺氧坏死区的新型亚群,被称为缺氧亚群(Hypoxia-TAM)。这些巨噬细胞能够诱导微血管渗漏,导致肿瘤微血管结构异常,从而限制了抗肿瘤药物的递送效果。⚠⚠⚠ 进一步研究发现,缺氧环境中的肿瘤因子和缺氧因素是诱导这种新型亚群形成的关键因素。团队证实,胶质瘤细胞分泌的富含半胱氨酸的蛋白质和低氧条件下产生的乳酸能够促进这些巨噬细胞向缺氧亚群表型转化,并引发血管高渗漏的现象。 这一发现为开发新型的肿瘤治疗策略提供了重要线索。通过针对缺氧亚群的靶向治疗,可以诱导胶质瘤血管正常化,提高抗肿瘤药物的递送效率,从而增强治疗效果。 该研究不仅加深了我们对胶质瘤免疫微环境的认识,也为未来开发针对肿瘤相关巨噬细胞的免疫治疗策略和抗肿瘤血管生成策略提供了新思路和可能性。
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