测序公司最新视觉报道_测序公司有哪些(2024年11月全程跟踪)
生工测序真是让人崩溃䊦近真是被生工气得不行ᣀ以前觉得擎科已经够不靠谱了,现在才发现,生工才是测序界的“扛把子”。我的实验数据被搞得一团糟,真是让人崩溃。 看看这些测序结果吧,简直是灾难现场。SnapGene软件打开后,看到那些乱七八糟的碱基序列,心情瞬间跌到了谷底。引物设计得也不靠谱,测出来的数据完全对不上。 还有那些原始的Chromatogram Data,质量值低得可怜,45%的质量值还敢拿出来?真是让人无语。更别提那些自动缩放的原始数据了,完全看不懂。 生工啊生工,真是让我又爱又恨。希望下次能找个靠谱点的测序公司,不然真是要被逼疯了䣀
如何分析转录组数据?需要验证吗? 拿到转录组数据后,如何进行分析和验证呢?以下是一些关键步骤和注意事项: 首先,选择特定的菌株进行转录组学测序,并比对分析。这需要一定的研究背景,例如: 某个基因表达后产量变化显著,通过转录组学分析该基因如何影响产量。 构建了一个完整菌株,观察基因编辑后全局基因的变化。 筛选到具有特定功能的菌株,想进一步分析该菌株。 젥訿行转录组测序前,首先要确定该现象是否发生在转录水平上,而不是其他因素(如蛋白表达、折叠、发酵参数等)引起的。可以用RT-PCR检测相关基因的转录水平,为实验提供支持。 拿到测序结果后,可以通过第三方测序公司的云平台进行差异基因筛选、GO分析和KEGG分析等。验证实验时,一方面要挑选差异倍数2倍以上的基因进行敲除或过表达,来验证该基因与实验背景的现象是否相关。如果差异倍数2倍以上的基因很多,可以调整筛选阈值,缩小范围。另一方面,挑选数个差异基因,用RT-PCR验证他们的变化趋势是否与第三方公司给出的结果一致,确保数据的准确性。 ⏰ 选择几个时间点取样?送几个平行样本? 在发酵过程中,至少选择2个时间点的样本,检测转录水平随时间的变化。如果经费充足,可以多选几个时间点。平行样本最好是3个,如果其中一个样本数据异常,还可以参考其他两组数据。 通过以上步骤,可以更全面地分析转录组数据,并确保数据的准确性和可靠性。
英国NHS启动全球首个实时监测系统,以应对未来病毒大流行风险 近日,英国政府宣布与纳米孔基因组测序公司Oxford Nanopore展开合作,启动全球首个实时病原体监测系统,旨在加快对呼吸道感染的早期检测与治疗响应,以有效应对未来可能爆发的疫情。这一公私合营的计划预计将提升公共卫生体系对新兴病原的应对速度,并为全球疫情防控提供借鉴。 该计划的核心目标是通过快速的病原基因组测序技术,能够在短短6小时内识别病原并提出相应治疗方案。英国内阁健康和社会关怀部长Wes Streeting表示:“如果我们未能做好准备,未来将为失败做好准备。”COVID-19大流行暴露了英国公共卫生体系在应对突发传染病时的脆弱性,而该计划旨在通过提升监测技术,避免历史重演。 该系统将基于Oxford Nanopore的第三代纳米孔测序技术。通过超薄蛋白质膜上的纳米级孔道,这项技术能够实时识别DNA链中的个别核苷酸基团。该技术声称在最佳条件下准确率超过99%,并且独立测试已验证其高精度。这一技术不仅适用于快速检测呼吸道病毒,还能实时分析未知病原体。 作为此计划的重要组成部分,英国的30个NHS站点将开始使用这一先进的基因组测序技术,扩展现有的呼吸道宏基因组项目。项目所获得的数据将提供给英国公共卫生安全局(UKHSA)和基因组英格兰(Genomics England),以便对新兴的致病菌进行识别与预警。此外,UK Biobank也将参与数据共享,为该计划的顺利推进提供重要支持。 英国健康安全局的首席医学顾问Susan Hopkins强调:“早期检测对于应对新兴病原至关重要,我们将利用现有的基因组监测专业知识,并在此基础上建立更高效的反应机制,以应对未来的潜在威胁。” 除了应对流行病风险,英国政府还表示,这一合作项目将加速NHS的数字化转型,推动公共卫生体系向更高效的数字化管理模式过渡。作为英国政府十年医疗转型计划的一部分,这一举措有望提升医疗系统整体的响应能力和资源整合效率。 Oxford Nanopore公司表示,除了疫情防控,该技术在癌症早期筛查和遗传性疾病诊断方面也具有广泛的应用前景。例如,纳米孔基因组技术可用于检测新生儿的遗传性疾病,有望改变未来疾病预防的方式。通过这一技术,医学研究领域的新发现能够更迅速地转化为临床实践,推动精准医学的发展。 尽管英国政府已经宣布将从明年开始推进该计划,但具体的实施时间表和技术部署地点尚未明确。目前,计划将在10至30个NHS站点进行,但具体的站点分布仍需进一步确认。这项技术的推广不仅仅局限于流感或新冠病毒等已知病原体的检测,其潜力还在于能够对未来可能出现的未知病原提供快速识别与响应。 然而,技术的部署和普及仍面临诸多挑战。如何确保在多个地点有效实施这一高科技监测系统,以及如何在保证数据隐私和安全的前提下实现数据共享,是该计划成功实施的关键。未来,随着技术的成熟与应用的扩大,如何平衡成本效益、技术进步与公共卫生安全之间的关系,将是所有参与方需要深思熟虑的问题。#动态连更挑战# #科技# #疫情#
同源重组构建质粒的详细步骤和注意事项 ❤️一、实验步骤 1️⃣ 载体线性化 ❶ 选择合适的克隆位点,对载体进行线性化。推荐使用双酶切方法,以降低转化背景(假阳性克隆)。 ❷ 酶切时,注意酶切时间,确保载体完全线性化。若使用单酶切,可适当延长酶切时间。 2️⃣ PCR扩增插入片段 ❶ 设计带有同源臂的引物,引物5'端引入与线性化载体末端一致的同源序列(15-20 bp)。 ❷ 使用高保真聚合酶进行PCR扩增,确保扩增片段的准确性与特异性。 3️⃣ 重组反应 ❶ 将线性化载体与扩增的插入片段按一定比例混合,加入重组酶,在一定温度下反应一定时间(如37℃,30分钟)。 ❷ 重组反应完成后,可直接进行转化或储存于-20℃备用。 4️⃣ 转化与筛选 ❶ 将重组产物转化至感受态细胞(如DH5🇧、复苏和涂板等步骤,得到单克隆菌落。 ❷ 通过菌落PCR和质粒提取后的酶切鉴定,筛选阳性克隆。 5️⃣ 测序验证 ❶ 将疑似阳性克隆的菌液送测序公司进行双向测序,比对测序结果与设计序列是否一致。 ❷ 若测序结果正确,则表示重组质粒构建成功,可进行后续实验。 ❤️二、注意事项 1️⃣ 引物设计:同源臂的长度和GC含量需控制在合理范围内(15-20 bp,GC含量40%-60%),以提高重组效率。 2️⃣ 酶切与纯化:确保载体线性化完全,并进行彻底的纯化,避免环状质粒残留。 3️⃣ 重组比例:载体与插入片段的摩尔比通常为1:2,根据实际情况调整。 4️⃣ 转化条件:控制转化产物的量和感受态细胞的状态,以获得理想的转化效率。 ❤️三、原理概述 同源重组法基于DNA分子间的同源序列,在重组酶的催化下实现载体与插入片段的定向重组。通过设计带有同源臂的引物,扩增出带有同源序列的插入片段,再与线性化的载体进行重组,最终得到重组质粒。 ❤️四、应用实例 以RNase P表达载体的构建为例,通过NCBI查找基因序列,设计带有BamHⅠ和SmaⅠ酶切位点的引物,扩增目的基因片段。随后,将目的基因片段与线性化的pGEX-2T载体进行同源重组,构建成功后转化至BL21工程菌中表达目的蛋白。
美国说唱歌手侃爷称特斯拉老板埃隆ⷩ鬦聾称马斯克是一个克隆人,有一半中国基因。马斯克则对此言论大方笑纳:“我认为这是一种赞美。”但这并不是一句玩笑话,2023年美国测序公司基因数据泄露,数据显示埃隆马斯克的父系基因来自中国汉族占比60%左右的O3基因。其父系基因类型为O3b1-F1150【今O2b1】,也就是说其祖上是中国人。 对此你有何看法?你认为世界首富马斯克真的是中国人的后代吗?#热点新知# #动态连更挑战# #热点引擎计划#
全球15大顶尖领域,被誉为“工业皇冠”,代表技术与制造巅峰。中国,在这些领域中占据了多少席位? 光刻机,荷兰阿斯麦公司领先全球。航空发动机,美国独领风骚。高端数控机床,德国、日本并驾齐驱。碳纤维,日本独占鳌头。芯片设计软件,美国依旧领先。 工业机器人,日本技术先进。特种钢材,日本品质卓越。核磁共振,德国医疗领先。基因测序,美国生物科技强大。 然而,盾构机、高铁、5G,中国展现实力。盾构机技术,中国地下工程佼佼者。高铁技术,自主研发列车,铁路系统先进。5G通信,中国引领全球。 新能源电车、卫星导航,中国同样强劲。新能源电车市场,中国全球领先。卫星导航,北斗与GPS并驱。 15大领域,中国已占1/3。彰显科技工业实力,预示未来发展潜力。 中国已摘多颗“工业皇冠”明珠,未来更可期。你觉得中国未来哪些领域将突破?哪些需加强研发?
11月10日个股新增概念 一、盛帮股份新增“储能”概念。 据同花顺数据显示,入选理由是:根据2024年6月3日公告,公司已成功开发应用于储能领域的产品,并已完成送样 二、茂莱光学新增“基因测序”概念。 三、东方生物新增“基因测序”概念。 四、金力永磁新增“人形机器人”概念。 五、阳谷华泰新增“光刻胶”概念。 六、和辉光电-U新增“柔性屏(折叠屏)”概念。 七、合肥城建新增“创投”概念。 八、国民技术新增“数据安全”概念。 九、九州通新增“基因测序”概念。 据同花顺数据显示,入选理由是:2022年年报:公司旗下天九再生医学科技有限公司积极开展细胞存储、干细胞产品开发,基因检测及诊断、医疗器械设备研发 十、联环药业新增“股权转让(并购重组)”概念。 十一、华东重机新增“工业母机”概念。 十二、挖金客新增“5g”概念。 十三、中交地产新增“物业管理”概念。 新增“稀土永磁”概念。 据同花顺数据显示,入选理由是:2023年5月22日互动易:公司控股子公司中韵矿业通过其子公司持有赞比亚孔布瓦(Nkombwa)稀土矿探矿权。
【英国测序公司ONT撤诉华大集团,曾指责其最新基因测序技术侵犯专利】据美国生物医药行业媒体GenomeWeb当地时间10月4日报道,英国基因测序公司Oxford Nanopore Technologies plc(下简称:ONT公司)撤回此前对华大集团及其下属公司华大基因、华大智造等其他相关公司的诉讼申请。 根据美国加利福尼亚北区地方法院,ONT公司是以“无偏见地”形式驳回。这意味着,当事人ONT公司保留再次提出诉讼的权利。ONT公司对于后续是否会再次对华大集团发起诉讼不予置评。11月5日,华大集团表示公司对此不予置评。(界面)
两周挑战单细胞分析D9:小白必看心得分享 最近几天因为忙得不可开交,一直没来得及更新。今天终于有时间来汇报一下这两周的进度和心得。之前我已经把Linux和R的基础知识学了一遍,对转录组测序的基本流程也有了大概的了解。 今天终于开始分析单细胞测序数据了,真是激动人心的一天!我一直在四五个学习资源之间疯狂切换,试图找到最适合自己的方法。首先,我浏览了公司给我的下机数据,发现他们包分析到细胞亚群注释,但具体的代码和阈值都不会给我。于是我决定从fastaq文件开始,自己动手做上游分析。 之前我只知道cellranger可以做10x的上游分析,但今天才知道不同测序平台有自己的上游分析流程。比如我选择的BD平台,就应该用BD官方流程来分析。我仔细看了公司给我的表达矩阵等文件,发现他们确实是用BD官方流程。为了确认这个流程里的参数设置是否影响结果,我在BD测序官网找到了该流程的用户手册,发现里面并不涉及主观的参数设置,说明我可以放心使用这个流程出来的表达矩阵。于是上游分析就可以省略了。 接下来就是下游分析了。首先要了解你选择的测序平台上游分析出来的文件格式和类型,一般都是mtx等三个文件。然后就可以直接匹配上大多数单细胞课程里讲解的用各个R包的下游分析,跟着流程一步步走。 今天的心得体会: 1️⃣ 一定要对自己使用的测序平台有深入的了解。小白最好确保公司下机结果出到表达矩阵,不然自己做上游分析需要根据不同平台跑不同的流程,难度直接拉满。而且要知道各个单细胞平台的优势和正常结果,比如BD平台免疫细胞亚群中如果没有中性粒细胞就不正常等。 2️⃣ 对于一个内容要选择多个学习资源。比如我看的生信技能树的视频,很多例子实际都是针对10x或者smartseq,不太适用于我。我就去BD官网找他们自己出的分析流程来看,一边看一边比对。上游分析的详细流程如果你赶时间可以选择略过,直接从表达矩阵之后的下游分析开始看,但也要知道上游分析的基本流程。 3️⃣ 单细胞测序的核心是需求导向。在做单细胞测序前,心里就应该有一个大致规划,要重点放在什么细胞亚群上,要有什么结果。因为单细胞测序分析的各种参数选择都很主观,所以要熟悉自己的样本和需求。 希望这些心得能对大家有所帮助!加油!ꀀ
洞察科技:固态纳米孔测序技术的创新者完成数千万元天使轮融资 广州洞察科技有限公司(洞察科技)近期宣布完成了数千万元的天使轮融资,由Forcefield Ventures (IMO Ventures)领投,天图资本、雅亿资本等机构跟投。 一、融资用途 本轮融资将用于固态纳米孔检测设备的研发和应用场景扩展,预计今年下半年推出针对科研市场的固态纳米孔测序仪。 二、公司背景 洞察科技成立于2022年1月,由来自斯坦福大学、帝国理工学院等名校博士联合创立,团队在固态纳米孔制备及检测领域具有先驱地位。 三、技术创新 公司基于固态纳米孔单分子检测技术,自主研发了生物大分子检测设备和基因测序仪,以及配套的试剂耗材,具备准确、快速、低成本、小型化的特点。 四、技术优势 与传统的NGS技术相比,纳米孔单分子测序无需标记和扩增,具有测序读长长、速度快、灵活便捷等优势,能够提高基因组大型或复杂结构变异的检出率。 五、固态纳米孔的应用前景 固态纳米孔技术在稳定性、电流噪声、工艺集成方面具有显著优势,有望大幅降低测序成本,拓展到RNA测序及核酸修饰识别。 六、投资方评价 天图投资合伙人魏国兴对洞察科技的技术给予了高度评价,并认为其在DNA测序、蛋白质检测等领域具有巨大商业潜力。 七、天图投资的背景 天图投资作为国内最早从事股权投资的专业机构之一,拥有专业的投研团队和丰富的投资经验,尤其在生命科学领域有深入布局。 八、行业影响 洞察科技的技术创新和融资成功,预示着固态纳米孔测序技术将为生命科学领域带来新的检测解决方案,推动行业发展。 总结: 洞察科技的天使轮融资成功,展现了市场对其固态纳米孔测序技术的高度认可。随着技术的不断成熟和应用场景的扩展,洞察科技有望成为生命科学工具领域的新质生产力代表,为精准医疗和生命科学研究提供更低成本、更快速精准的检测产品。天图投资等机构的支持,将进一步加速公司的研发进程和市场推广,推动其在生命科学领域的长远发展。
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